MIKROBI
Bakteerien yhteensopivuus ja immobilisointi biohiilen kanssa paransi tebukonatsolin hajoamista, maaperän mikrobiomien koostumusta ja toimintaa
Täyspitkä 16S-amplikonin sekvensointi |PacBio HiFi |Alfa monimuotoisuus |Beta-monimuotoisuus
Tässä tutkimuksessa Biomarker Technologies tarjosi täyspitkän 16S-amplikonin sekvensoinnin PacBion avulla ja bioinformaattisen analyysin.
Kohokohdat
Biohiilellä immobilisoidun tebukonatsolia hajottavan bakteerin Alcaligenes faecalis WZ-2 tutkittiin biologisen hajoamisen tehokkuuden ja vaikutuksen suhteen tebukonatsolipitoiseen maaperään verrattuna vapaasti hajoavaan kantaan WZ-2.
1. Biohiilellä immobilisoitu WZ-2 osoitti tehokkaamman hajoamisen tebukonatsolissa verrattuna vapaaseen WZ-2:een vähentämällä tebukonatsolin puoliintumisaikaa maaperässä 18,7 päivästä 13,3 päivään.
2. Biohiilellä immobilisoidut WZ-2:t pystyivät palauttamaan maaperän mikrobien entsyymiaktiivisuudet, mukaan lukien ureaasin, dehydrogenaasin ja invertaasin jne.
3. Mikrobiprofiili biohiilellä immobilisoidussa WZ-2-käsitellyssä maaperässä, joka määritettiin täyspitkällä 16S-sekvensoinnilla, tuki vahvasti sitä, että tämä järjestelmä voisi palauttaa maaperän terveyden parantamalla bakteeriyhteisön rakennetta tebukonatsolikontaminaation alaisena.
Kokeilu (sekvensointiin liittyvä)
Ryhmittely: CK: Luonnollinen maaperä;T: Tebukonatsolilla lisätty maaperä;S: Tebukonatsoli sisälsi maaperää, jossa oli vapaa kanta WZ-2;BC: Tebukonatsoli sisälsi maaperää, jossa oli biohiiltä;BCS: Tebukonatsoli sisälsi maaperää, jossa oli biohiilellä immobilisoitua WZ-2:ta.
Näytteenotto: 16S rDNA-alukkeilla monistettu maaperän DNA:n kokonaisuutto
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) ja 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),edustaa täyspitkää 16S rDNA:ta
Sekvensointialusta: PacBio RS II
Sekvensointistrategia: CCS HIFI lukee
Tietojen analysointi:BMKCloudBioinformatic Platforming tekee kultakalasta erinomaisen geneettisen mallijärjestelmän kalojen fysiologiaan ja evoluutioon.
Tulos
Maaperän mikrobiyhteisön rakenne määritettiin 16S rDNA -sekvensoinnilla.OTU:n rikkaus- ja alfadiversiteettiindeksi, mukaan lukien Chao1-, Ace-, Shannon- ja Simpson-indeksit, arvioitiin paljastamaan lajien monimuotoisuus kussakin järjestelmässä.60 päivän inkuboinnin jälkeen kaikki indeksit osoittivat samansuuntaista suuntausta, eli tebukonatsoli saattoi vähentää lajien rikkautta ja monimuotoisuutta maaperässä.Kuitenkin lisäämällä kantaa WZ-2 maaperän bakteeriyhteisö saatiin osittain talteen sekä rikkauden että monimuotoisuuden suhteen.Rajoitettu ero havaittiin BC:n, BCS:n ja CK:n välillä, mikä osoittaa, että biohiilellä ja biohiilellä immobilisoitu WZ-2 voisi tehokkaasti palauttaa maaperän biologisen terveyden.
Tässä tutkimuksessa sovellettiin painottamatonta pariryhmämenetelmää aritmeettisilla keskiarvoilla (UPGMA) beetan monimuotoisuuden osoittamiseksi ryhmien välillä.Kuten seuraavassa kuvassa näkyy, BC:llä, BSC:llä ja CK:lla oli samanlainen mikrobikoostumuskuvio verrattuna ryhmään T ja S, mikä osoitti edelleen, että biohiilen lisääminen tebukonatsolilla saastuneeseen maaperän bioremediaatioon voisi suurelta osin helpottaa mikrobiyhteisön palautumista maaperään.
Kuva.Bakteeriyhteisön UPGMA-klusterointi syrjätasolla erilaisilla hoidoilla
Viite
Sun, Tong et ai."Bakteereiden yhteensopivuus ja immobilisaatio biohiilen kanssa paransivat tebukonatsolin hajoamista, maaperän mikrobiomien koostumusta ja toimintaa."Journal of Hazardous Materials398 (2020): 122941.
Uutisia ja kohokohtia Tavoitteena on jakaa uusimmat onnistuneet tapaukset Biomarker Technologiesin kanssa, vangita uusia tieteellisiä saavutuksia sekä tutkimuksen aikana käytettyjä merkittäviä tekniikoita.
Postitusaika: 08.01.2022