MIKROBA
Kompatibilitas dan imobilisasi bakteri dengan biochar meningkatkan degradasi tebuconazole, komposisi dan fungsi mikrobioma tanah
Urutan amplikon 16S panjang penuh |PacBio HiFi |Keanekaragaman alfa |Keanekaragaman beta
Dalam penelitian ini, pengurutan amplikon 16S full-length oleh PacBio dan analisis bioinformatik disediakan oleh Biomarker Technologies.
Highlight
Bakteri pendegradasi tebuconazole amobilisasi biochar Alcaligenes faecalis WZ-2 dipelajari mengenai efisiensi biodegradasi dan pengaruhnya terhadap tanah yang terkontaminasi tebuconazole dibandingkan dengan strain WZ-2 yang bebas degradasi.
1. WZ-2 yang diimobilisasi dengan biochar menunjukkan degradasi tebuconazole yang lebih efisien dibandingkan dengan WZ-2 bebas dengan mengurangi waktu paruh tebuconazole di dalam tanah dari 18,7 hari menjadi 13,3 hari.
2. WZ-2 yang diimobilisasi dengan biochar mampu mengembalikan aktivitas enzim mikroba tanah asli, termasuk urease, dehidrogenase dan invertase, dll.
3. Profil mikroba dalam tanah yang diberi perlakuan WZ-2 yang diimobilisasi biochar yang ditentukan dengan pengurutan 16S panjang penuh sangat mendukung bahwa sistem ini dapat memulihkan kesehatan tanah dengan memperbaiki struktur komunitas bakteri di bawah kontaminasi tebuconazole.
Eksperimen (Terkait pengurutan)
Pengelompokan: CK: Tanah alami;T: Tanah dibubuhi tebuconazole;S: Tebuconazole mengandung tanah dengan strain bebas WZ-2;BC: Tebuconazole mengandung tanah dengan biochar;BCS: Tebuconazole mengandung tanah dengan biochar immobilisasi WZ-2.
Pengambilan sampel: Total ekstraksi DNA tanah yang diperkuat dengan primer 16S rDNA
27F (5′-AGAGTTGATCCTGGTCCAG-3′) dan 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),mewakili rDNA 16S panjang penuh
Platform pengurutan: PacBio RS II
Strategi pengurutan: CCS HIFI berbunyi
Analisis data:BMKCloudPlatform Bioinformatik menjadikan ikan mas sebagai sistem model genetik yang sangat baik untuk fisiologi dan evolusi ikan.
Hasil
Struktur komunitas mikroba tanah ditentukan dengan sekuensing 16S rDNA.Indeks kekayaan OTU dan keanekaragaman alfa, termasuk indeks Chao1, Ace, Shannon dan Simpson dievaluasi untuk mengungkap keanekaragaman spesies di setiap sistem.Setelah inkubasi 60 hari, semua indeks menunjukkan tren serupa, yaitu tebuconazole dapat menyebabkan penurunan kekayaan dan keanekaragaman spesies di dalam tanah.Namun, dengan menambahkan strain WZ-2, sebagian komunitas bakteri tanah pulih baik dari segi kekayaan maupun keanekaragamannya.Perbedaan terbatas yang diamati antara BC, BCS dan CK, menunjukkan bahwa biochar dan WZ-2 yang diimobilisasi biochar dapat secara efektif memulihkan kesehatan biologis tanah.
Metode Kelompok Berpasangan Tak Tertimbang dengan Mean Aritmatika (UPGMA) diterapkan dalam penelitian ini untuk menunjukkan keragaman beta antar kelompok.Seperti yang ditunjukkan pada gambar berikut, BC, BSC, dan CK memiliki pola komposisi mikroba yang lebih mirip dibandingkan dengan kelompok T dan S, yang selanjutnya menunjukkan bahwa pengenalan biochar pada bioremediasi tanah yang terkontaminasi tebuconazole dapat memfasilitasi pemulihan komunitas mikroba di dalam tanah.
Angka.Pengelompokan komunitas bakteri UPGMA pada tingkat filum dengan perlakuan berbeda
Referensi
Matahari, Tong, dkk.“Kompatibilitas dan imobilisasi bakteri dengan biochar meningkatkan degradasi tebuconazole, komposisi dan fungsi mikrobioma tanah.”Jurnal Bahan Berbahaya398 (2020): 122941.
Berita dan Sorotan bertujuan untuk berbagi kasus-kasus sukses terbaru dengan Biomarker Technologies, menangkap pencapaian ilmiah baru serta teknik-teknik terkemuka yang diterapkan selama penelitian.
Waktu posting: 08 Januari 2022