Ամպլիկոնային հաջորդականացում (16S/18S/ITS)
Ամպլիկոնային (16S/18S/ITS) հաջորդականացումը Illumina-ի միջոցով մանրէային բազմազանության վերլուծության մեթոդ է՝ մանրէային պրոֆիլները նույնականացնելով դրանց հաջորդականությունների համաձայն, ապա փորձելով վերծանել համայնքի հարստությունը և բազմազանությունը յուրաքանչյուր նմուշի ներսում և նմուշների միջև: BMKCloud Amplicon (NGS) խողովակաշարը թույլ է տալիս վերլուծել 16S, 18S, ITS և բազմաթիվ ֆունկցիոնալ գեները: Այն սկսվում է ընթերցման կտրումից, զույգ ծայրերի ընթերցման հավաքումից և որակի գնահատմամբ, որին հաջորդում է նմանատիպ ընթերցումների կլաստերացումը՝ վեց տարբեր վերլուծության բաժիններում օգտագործվող գործառնական տաքսոնոմիկ միավորներ (OTU) ստեղծելու համար: Տաքսոնոմիկ ծանոթագրությունը տեղեկատվություն է տրամադրում յուրաքանչյուր նմուշի հարաբերական առատության և կազմի մասին, մինչդեռ ալֆա և բետա բազմազանության վերլուծությունները կենտրոնանում են համապատասխանաբար նմուշների ներսում և դրանց միջև մանրէային բազմազանության վրա: Խմբերի միջև դիֆերենցիալ վերլուծությունը գտնում է տարբերվող OTU-ներ՝ օգտագործելով ինչպես պարամետրիկ, այնպես էլ ոչ պարամետրիկ թեստեր, մինչդեռ կորելյացիոն վերլուծությունը կապում է այդ տարբերությունները շրջակա միջավայրի գործոնների հետ: Վերջապես, ֆունկցիոնալ գեների առատությունը կանխատեսվում է մարկերային գեների առատության հիման վրա՝ պատկերացում տալով յուրաքանչյուր նմուշի ֆունկցիայի և էկոլոգիայի մասին:
