MICROBIANO
A compatibilidade bacteriana e a imobilização com biochar melhoraram a degradação do tebuconazol, a composição e o funcionamento do microbioma do solo
Sequenciamento completo do amplicon 16S |PacBio HiFi |Diversidade alfa |Diversidade beta
Neste estudo, o sequenciamento completo do amplicon 16S pela PacBio e a análise bioinformática foram fornecidos pela Biomarker Technologies.
Destaques
Bactéria degradadora de tebuconazol imobilizada com Biochar Alcaligenes faecalis WZ-2 foi estudada na eficiência da biodegradação e afeta o solo contaminado com tebuconazol em comparação com a cepa de degradação livre WZ-2.
1. O WZ-2 imobilizado com biochar mostrou uma degradação mais eficiente no tebuconazol em comparação com o WZ-2 livre, reduzindo a meia-vida do tebuconazol no solo de 18,7 dias para 13,3 dias.
2. WZ-2 imobilizados com biochar foram capazes de restaurar as atividades de enzimas microbianas nativas do solo, incluindo urease, desidrogenase e invertase, etc.
3. O perfil microbiano em solo tratado com WZ-2 imobilizado com biocarvão, determinado pelo sequenciamento 16S completo, apoiou fortemente que este sistema poderia restaurar a saúde do solo, melhorando a estrutura da comunidade bacteriana sob contaminação com tebuconazol.
Experimento (relacionado ao sequenciamento)
Agrupamento: CK: Solo natural;T: Solo enriquecido com tebuconazol;S: Tebuconazol continha solo com cepa livre WZ-2;BC: Tebuconazol continha solo com biocarvão;BCS: Tebuconazol continha solo com biochar imobilizado WZ-2.
Amostragem: Extração total de DNA do solo amplificada por primers 16S rDNA
27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') e 1492R (5'-GGTTACCTTGTTACGA),representando rDNA 16S completo
Plataforma de sequenciamento: PacBio RS II
Estratégia de sequenciamento: leituras CCS HIFI
Análise de dados:BMKCloudA plataforma bioinformática faz do peixe dourado um excelente sistema de modelo genético para a fisiologia e evolução dos peixes.
Resultado
A estrutura da comunidade microbiana do solo foi determinada pelo sequenciamento do 16S rDNA.A riqueza de OTU e o índice de diversidade alfa, incluindo os índices Chao1, Ace, Shannon e Simpson, foram avaliados para revelar a diversidade de espécies em cada sistema.Após 60 dias de incubação, todos os índices mostraram tendências semelhantes, ou seja, o tebuconazol poderia induzir a redução na riqueza e diversidade de espécies no solo.No entanto, ao adicionar a estirpe WZ-2, a comunidade de bactérias do solo foi parcialmente recuperada em termos de riqueza e diversidade.Diferença limitada foi observada entre BC, BCS e CK, indicando que o biochar e o WZ-2 imobilizado com biochar poderiam efetivamente restaurar a saúde biológica do solo.
O Método de Pares-Grupos Não Ponderados com Médias Aritméticas (UPGMA) foi aplicado neste estudo para mostrar a diversidade beta entre os grupos.Como mostrado na figura a seguir, BC, BSC e CK compartilharam um padrão mais semelhante de composição microbiana em comparação com o grupo T e S, o que indicou ainda que a introdução de biochar na biorremediação de solo contaminado com tebuconazol poderia facilitar em grande parte a recuperação da comunidade microbiana no solo.
Figura.Agrupamento UPGMA da comunidade bacteriana em nível de filo sob diferentes tratamentos
Referência
Sun, Tong, et al.“A compatibilidade bacteriana e a imobilização com biochar melhoraram a degradação do tebuconazol, a composição e o funcionamento do microbioma do solo.”Diário de Materiais Perigosos398 (2020): 122941.
Notícias e Destaques visa compartilhar os mais recentes casos de sucesso com Biomarker Technologies, capturando novas conquistas científicas, bem como técnicas proeminentes aplicadas durante o estudo.
Horário da postagem: 08 de janeiro de 2022