МИКРОБЕН
Бактериалната съвместимост и обездвижването с биовъглен подобрява разграждането на тебуконазол, състава и функционирането на микробиома на почвата
Секвениране на 16S ампликони в пълна дължина |PacBio HiFi |Алфа разнообразие |Бета разнообразие
В това проучване секвенирането на 16S ампликон в пълна дължина от PacBio и биоинформационен анализ са предоставени от Biomarker Technologies.
Акценти
Имобилизираните с Biochar разграждащи тебуконазол бактерии Alcaligenes faecalis WZ-2 са изследвани за ефикасност на биоразграждане и въздействие върху замърсена с тебуконазол почва в сравнение със свободно разграждащия се щам WZ-2.
1. Имобилизираният с биовъглен WZ-2 показва по-ефективно разграждане в тебуконазол в сравнение със свободния WZ-2 чрез намаляване на полуживота на тебуконазол в почвата от 18,7 дни на 13,3 дни.
2. Имобилизираният с биовъглен WZ-2 успя да възстанови естествените почвени микробни ензимни активности, включително уреаза, дехидрогеназа и инвертаза и др.
3. Микробен профил в почва, третирана с имобилизиран с биовъглен WZ-2, определен чрез секвениране на 16S в пълна дължина, силно подкрепя, че тази система може да възстанови здравето на почвата чрез подобряване на структурата на бактериалната общност при замърсяване с тебуконазол.
Експеримент (свързан с последователността)
Групиране: CK: Естествена почва;T: Почва, обогатена с тебуконазол;S: Почва, съдържаща тебуконазол със свободен щам WZ-2;BC: Tebuconazole съдържа почва с биовъглен;BCS: почва, съдържаща тебуконазол с имобилизиран биовъглен WZ-2.
Вземане на проби: Пълна екстракция на почвена ДНК, амплифицирана с 16S rDNA праймери
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) и 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),представляващи 16S rDNA с пълна дължина
Платформа за секвениране: PacBio RS II
Стратегия за последователност: CCS HIFI чете
Анализ на данни:BMKCloudБиоинформативното платформиране прави златните рибки отлична генетична моделна система за физиологията и еволюцията на рибите.
Резултат
Структурата на почвената микробна общност се определя чрез секвениране на 16S rDNA.Богатството на OTU и индексът на алфа разнообразието, включително индексите Chao1, Ace, Shannon и Simpson, бяха оценени, за да се разкрие видовото разнообразие във всяка система.След 60 дни инкубация всички показатели показват подобна тенденция, т.е. тебуконазол може да предизвика намаляване на видовото богатство и разнообразието в почвата.Въпреки това, чрез добавяне на щам WZ-2, почвената бактериална общност беше частично възстановена по отношение както на богатството, така и на разнообразието.Наблюдава се ограничена разлика между BC, BCS и CK, което показва, че биовъглен и имобилизиран с биовъглен WZ-2 могат ефективно да възстановят биологичното здраве на почвата.
Непретеглен метод на двойка-група със средни аритметични стойности (UPGMA) беше приложен в това проучване, за да покаже бета разнообразие между групите.Както е показано на следващата фигура, BC, BSC и CK споделят по-сходен модел на микробен състав в сравнение с група T и S, което допълнително показва, че въвеждането на биовъглен в замърсената с тебуконазол почва за биоремедиация може до голяма степен да улесни възстановяването на микробната общност в почвата.
Фигура.UPGMA групиране на бактериална общност на ниво тип при различно третиране
справка
Sun, Tong и др.„Бактериалната съвместимост и обездвижването с биовъглен подобрява разграждането на тебуконазол, състава и функционирането на почвения микробиом.“Журнал за опасни материали398 (2020): 122941.
Новини и Акценти има за цел да сподели най-новите успешни случаи с Biomarker Technologies, да улови нови научни постижения, както и видни техники, приложени по време на проучването.
Време на публикуване: 8 януари 2022 г