BMKCloud Log in
条形banner-03

Жаңылыктар

МИКРОБ

Кооптуу материалдардын журналы

Бактериялардын шайкештиги жана биокөгүр менен иммобилизациясы тебуконазолдун деградациясын, топурактын микробиомасынын курамын жана иштешин жакшыртты.

Толук узундуктагы 16S ампликонун секвенирлөө |PacBio HiFi |Alpha көп түрдүүлүк |Бета ар түрдүүлүк

Бул изилдөөдө PacBio тарабынан толук узундуктагы 16S ампликон секвенирлөө жана биоинформатикалык анализ Biomarker Technologies тарабынан берилген.

Маанилүү учурлар

Биокар менен иммобилизацияланган тебуконазолду деградациялоочу бактерия Alcaligenes faecalis WZ-2 эркин бузулуучу WZ-2 штаммына салыштырмалуу биодеградациянын натыйжалуулугу жана тебуконазол менен булганган топуракка таасири боюнча изилденген.

1. Биокар-иммобилизацияланган WZ-2 топурактагы тебуконазолдун жарым ажыроо мөөнөтүн 18,7 күндөн 13,3 күнгө чейин кыскартуу аркылуу эркин WZ-2ге салыштырмалуу тебуконазолдун кыйла натыйжалуу бузулушун көрсөттү.

2. Биокар-иммобилизацияланган WZ-2 топурактын микробдук ферменттеринин активдүүлүгүн калыбына келтире алды, анын ичинде уреаза, дегидрогеназа жана инвертаза ж.б.

3. Толук узундуктагы 16S ырааттуулугу менен аныкталган, биокөгүрлөр менен иммобилизацияланган WZ-2 менен иштетилген кыртыштагы микробдук профиль бул система тебуконазолдун булгануусу астында бактериялык жамааттын түзүлүшүн жакшыртуу аркылуу топурактын ден соолугун калыбына келтире аларын бекем колдоду.

Эксперимент (ырааттуулукка байланыштуу)

Топтоо: CK: Табигый топурак;Т: Тебуконазол кошулган топурак;S: Tebuconazole эркин штамм WZ-2 менен топурак камтыган;BC: Tebuconazole биокөмүр менен топурак камтыган;BCS: Тебуконазолдун курамында WZ-2 иммобилизацияланган биокөмүр бар топурак бар.

Үлгү алуу: 16S рДНК праймерлери менен күчөтүлгөн кыртыштын ДНКсынын жалпы экстракциясы
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) жана 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),толук узундуктагы 16S рДНКны чагылдырган

Секвенирлөө платформасы: PacBio RS II

Ырааттуулук стратегиясы: CCS HIFI окуйт

Маалыматтарды талдоо:BMKCloudБиоинформатикалык платформа алтын балыктарды балыктын физиологиясы жана эволюциясы үчүн эң сонун генетикалык модель системасы кылат.

Жыйынтык

Топурак микробдук жамааттын түзүлүшү 16S рДНК секвенциясы менен аныкталган.Ар бир системадагы түрлөрдүн ар түрдүүлүгүн ачуу үчүн OTU байлыгы жана альфа ар түрдүүлүк индекси, анын ичинде Чао1, Эйс, Шеннон жана Симпсон индекстери бааланган.60 күндүк инкубациядан кийин бардык индекстер окшош тенденцияны көрсөттү, башкача айтканда, тебуконазол топурактын түрлөрүнүн байлыгынын жана ар түрдүүлүгүнүн азайышына алып келиши мүмкүн.Бирок, штамм WZ-2 кошуу менен, топурак бактериялар жамааты жарым-жартылай байлык жана ар түрдүүлүк жагынан калыбына келтирилди.BC, BCS жана CK арасында чектелген айырма байкалды, бул биокөгүр жана биокөгүрс менен иммобилизацияланган WZ-2 топурактын биологиялык ден соолугун эффективдүү калыбына келтире аларын көрсөтүп турат.

1-2-1024x218

Бул изилдөөдө топтор арасында бета ар түрдүүлүгүн көрсөтүү үчүн арифметикалык каражаттар менен салмаксыз жуп-топтук методу (UPGMA) колдонулган.Төмөнкү сүрөттө көрсөтүлгөндөй, BC, BSC жана CK T жана S топторуна салыштырмалуу микробдук курамдын окшош үлгүсүн бөлүштү, бул андан ары тебуконазол менен булганган топурактын биоремедиациясына биокөмүрдү киргизүү топурактагы микробдук жамааттын калыбына келишине чоң жардам бере аларын көрсөттү.

2-1-1024x472

Сүрөт.Ар кандай дарылоо астында филум деңгээлинде бактериялык жамааттын UPGMA кластери

Шилтеме

Sun, Tong жана башкалар."Бактериялардын шайкештиги жана биокөгүр менен иммобилизациясы тебуконазолдун деградациясын, топурактын микробиомасынын курамын жана иштешин жакшыртты."Кооптуу материалдар журналы398 (2020): 122941.

Толук текстти окуңуз

Жаңылыктар жана кызыктуу окуялар акыркы ийгиликтүү учурларды Biomarker Technologies менен бөлүшүүгө, жаңы илимий жетишкендиктерге, ошондой эле изилдөө учурунда колдонулган көрүнүктүү ыкмаларга ээ болууга багытталган.


Посттун убактысы: Январь-08-2022

Бизге билдирүүңүздү жөнөтүңүз: