ক্ষুদ্র আরএনএ সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
বৈশিষ্ট্য
● আকার নির্বাচন লাইব্রেরি প্রস্তুতি।
● miRNA পূর্বাভাস এবং লক্ষ্যবস্তু কেন্দ্রিক বায়োইনফরমেটিক বিশ্লেষণ।
পরিষেবার সুবিধা
●ব্যাপক দক্ষতাআমরা বিভিন্ন ধরণের ৩০০টিরও বেশি নমুনা প্রক্রিয়াজাত করেছি। আমরা প্রতিটি প্রকল্পে আমাদের সমৃদ্ধ অভিজ্ঞতা নিয়ে আসি।
●কঠোর মান নিয়ন্ত্রণআমরা নমুনা প্রস্তুতি থেকে শুরু করে লাইব্রেরি প্রস্তুতি, সিকোয়েন্সিং এবং বায়োইনফরমেটিক্স পর্যন্ত সকল পর্যায়ে মূল নিয়ন্ত্রণ ব্যবস্থা প্রয়োগ করি। আমাদের সতর্ক পর্যবেক্ষণ ধারাবাহিকভাবে উচ্চ মানের ফলাফল প্রদান নিশ্চিত করে।
●ব্যাপক বায়োইনফরমেটিক্স বিশ্লেষণ:এর মাধ্যমে একাধিক ডেটাবেস (KEGG, GO) ব্যবহার করে পরিচিত ও নতুন উভয় প্রকার miRNA শনাক্তকরণ, miRNA-এর টার্গেট শনাক্তকরণ এবং সংশ্লিষ্ট কার্যকরী টীকা ও সমৃদ্ধকরণ করা যায়।
●বিক্রয়োত্তর সহায়তাউপস্থিত থাকার গুরুত্ব আমরা বুঝি, তাই প্রকল্প সমাপ্তির পরেও আমাদের প্রতিশ্রুতি ৩ মাসের বিক্রয়োত্তর সেবার মাধ্যমে প্রসারিত হয়। এই সময়ে, আমরা প্রকল্পের ফলো-আপ, সমস্যা সমাধানে সহায়তা এবং ফলাফল সম্পর্কিত যেকোনো জিজ্ঞাসার সমাধানের জন্য প্রশ্নোত্তর পর্বের আয়োজন করে থাকি।
নমুনার প্রয়োজনীয়তা এবং ডেলিভারি
| লাইব্রেরি | প্ল্যাটফর্ম | প্রস্তাবিত ডেটা | ডেটা কিউসি |
| নির্বাচিত আকার | ইলুমিনা SE50 | ১০-২০ মিলিয়ন রিড | Q30≥85% |
নমুনা প্রয়োজনীয়তা:
নিউক্লিওটাইড:
| ঘনত্ব (ng/μl) | পরিমাণ (μg) | বিশুদ্ধতা | সততা |
| ≥ ৮০ | ≥ ০.৮ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 জেলে সীমিত বা কোনো প্রোটিন বা ডিএনএ দূষণ দেখা যায়নি। | RIN≥৬.০; ৫.০≥২৮এস/১৮এস≥১.০; সীমিত বা কোনো বেসলাইন উচ্চতা নেই |
● উদ্ভিদ:
মূল, কাণ্ড বা পাপড়ি: ৪৫০ মিলিগ্রাম
পাতা বা বীজ: ৩০০ মিলিগ্রাম
ফল: ১.২ গ্রাম
● প্রাণী:
হৃৎপিণ্ড বা অন্ত্র: ৪৫০ মিলিগ্রাম
অভ্যন্তরীণ অঙ্গ বা মস্তিষ্ক: ২৪০ মিলিগ্রাম
পেশী: ৬০০ মিলিগ্রাম
হাড়, চুল বা ত্বক: ১.৫ গ্রাম
● আর্থ্রোপড:
পোকামাকড়: ৯ গ্রাম
ক্রাস্টেশিয়া: ৪৫০ মিলিগ্রাম
● সম্পূর্ণ রক্ত২টি টিউব
● কোষ: 106 কোষ
● সিরাম এবং প্লাজমা:৬ মিলি
প্রস্তাবিত নমুনা ডেলিভারি
পাত্র: ২ মিলি সেন্ট্রিফিউজ টিউব (টিন ফয়েল ব্যবহার করা বাঞ্ছনীয় নয়)
নমুনার নামকরণ: গ্রুপ+প্রতিলিপি, যেমন A1, A2, A3; B1, B2, B3।
চালান:
১. ড্রাই-আইস: নমুনাগুলো ব্যাগে ভরে ড্রাই-আইসের মধ্যে পুঁতে রাখতে হবে।
২. আরএনএস্টেবল টিউব: আরএনএ নমুনা আরএনএ স্থিতিশীলকরণ টিউবে (যেমন আরএনএস্টেবল®) শুকিয়ে কক্ষ তাপমাত্রায় পাঠানো যেতে পারে।
পরিষেবা কার্যপ্রবাহ
পরীক্ষার নকশা
নমুনা সরবরাহ
আরএনএ নিষ্কাশন
গ্রন্থাগার নির্মাণ
ক্রমবিন্যাস
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয়োত্তর সেবা
বায়োইনফরমেটিক্স
● কাঁচা ডেটার গুণমান নিয়ন্ত্রণ
● ক্ষুদ্র আরএনএ-র শ্রেণিবিন্যাস
● miRNA অভিব্যক্তি এবং পার্থক্যমূলক অভিব্যক্তি বিশ্লেষণ
● miRNA টার্গেট জিন এবং ভিন্নভাবে প্রকাশিত miRNA টার্গেট জিনের টীকা
● টার্গেট জিনের টীকা এবং ভিন্নভাবে প্রকাশিত miRNA জিনের কার্যকারিতা সমৃদ্ধকরণ
miRNA শনাক্তকরণ: গঠন ও গভীরতা
miRNA-এর ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন – হায়ারারকিক্যাল ক্লাস্টারিং
ভিন্নভাবে প্রকাশিত miRNA-এর লক্ষ্যবস্তুর কার্যকরী টীকা
নির্বাচিত প্রকাশনা সংকলনের মাধ্যমে BMKGene-এর sRNA সিকোয়েন্সিং পরিষেবার দ্বারা সাধিত গবেষণার অগ্রগতি সম্পর্কে জানুন।
চেন, এইচ. প্রমুখ (২০২৩) 'ভাইরাল সংক্রমণ প্যানাক্স নটোগিনসেং-এ স্যাপোনিন জৈব সংশ্লেষণ এবং সালোকসংশ্লেষণকে বাধা দেয়',উদ্ভিদ শারীরবিদ্যা এবং জৈব রসায়ন, ২০৩, পৃ. ১০৮০৩৮। ডিওআই: ১০.১০১৬/জে.পিএলএপিএইচওয়াই.২০২৩.১০৮০৩৮।
লি, এইচ. প্রমুখ (২০২৩) 'উদ্ভিদের FYVE ডোমেন-যুক্ত প্রোটিন FREE1 মাইক্রোপ্রসেসর উপাদানের সাথে যুক্ত হয়ে miRNA জৈব-উৎপাদন দমন করে',EMBO রিপোর্ট, 24(1)। doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
ইউ, জে. প্রমুখ (২০২৩) 'মৌমাছি, Apis mellifera-তে মাল্টিপল এপিডার্মাল গ্রোথ ফ্যাক্টর-লাইক ডোমেইনস ৮ জিন (megf8)-কে টার্গেট করার মাধ্যমে মাইক্রোআরএনএ Ame-Bantam-3p লার্ভা ও পিউপার বিকাশ নিয়ন্ত্রণ করে',আন্তর্জাতিক আণবিক বিজ্ঞান জার্নাল, 24(6), পৃ. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
ঝাং, এম. প্রমুখ (২০১৮) 'মাংসের গুণমানের সাথে সম্পর্কিত মাইক্রোআরএনএ এবং জিনের সমন্বিত বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে Gga-MiR-140-5p মুরগির পেশীর অভ্যন্তরে চর্বি জমার উপর প্রভাব ফেলে',কোষীয় শারীরবিদ্যা এবং জৈব রসায়ন, 46(6), পৃ. 2421-2433। doi: 10.1159/000489649।
