10x জিনোমিক্স ভিজিয়াম স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোম
বৈশিষ্ট্য
● রেজোলিউশন: 100 µM
● স্পট ব্যাস: 55 µM
● দাগের সংখ্যা: 4992
● ক্যাপচার এলাকা: 6.5 x 6.5 মিমি
● প্রতিটি বারকোডেড স্পট 4টি বিভাগ নিয়ে গঠিত প্রাইমার দিয়ে লোড করা হয়:
- এমআরএনএ প্রাইমিং এবং সিডিএনএ সংশ্লেষণের জন্য পলি(ডিটি) লেজ
- পরিবর্ধন পক্ষপাত সংশোধন করতে অনন্য আণবিক সনাক্তকারী (UMI)
- স্থানিক বারকোড
- আংশিক রিড 1 সিকোয়েন্সিং প্রাইমারের বাইন্ডিং সিকোয়েন্স
● H&E বিভাগগুলির স্টেনিং
সুবিধাদি
●ওয়ান স্টপ সেবা: ক্রায়ো-সেকশনিং, স্টেনিং, টিস্যু অপ্টিমাইজেশান, স্থানিক বারকোডিং, লাইব্রেরি প্রস্তুতি, সিকোয়েন্সিং এবং বায়োইনফরমেটিক্স সহ সমস্ত অভিজ্ঞতা এবং দক্ষতা-ভিত্তিক পদক্ষেপগুলিকে একীভূত করে৷
● অত্যন্ত দক্ষ প্রযুক্তিগত দল: মানুষ, মাউস, স্তন্যপায়ী, মাছ এবং গাছপালা সহ 250 টিরও বেশি টিস্যুর প্রকার এবং 100+ প্রজাতির অভিজ্ঞতা সহ।
●পুরো প্রকল্পের রিয়েল-টাইম আপডেট: পরীক্ষামূলক অগ্রগতির সম্পূর্ণ নিয়ন্ত্রণ সহ।
●ব্যাপক স্ট্যান্ডার্ড বায়োইনফরমেটিক্স:প্যাকেজ 29টি বিশ্লেষণ এবং 100+ উচ্চ-মানের পরিসংখ্যান অন্তর্ভুক্ত করে।
●কাস্টমাইজড ডেটা বিশ্লেষণ এবং ভিজ্যুয়ালাইজেশন: বিভিন্ন গবেষণা অনুরোধের জন্য উপলব্ধ.
●একক-কোষ mRNA সিকোয়েন্সিং সহ ঐচ্ছিক যৌথ বিশ্লেষণ
স্পেসিফিকেশন
| নমুনা প্রয়োজনীয়তা | লাইব্রেরি | সিকোয়েন্সিং কৌশল | ডেটা প্রস্তাবিত | মান নিয়ন্ত্রণ |
| OCT-এম্বেডেড ক্রাইও নমুনা, FFPE নমুনা (অনুকূল ব্যাস: আনুমানিক 6x6x6 mm3) প্রতি নমুনা 3 ব্লক | 10X ভিজিয়াম সিডিএনএ লাইব্রেরি | ইলুমিনা PE150 | প্রতি স্পট 50K PE রিড (60 জিবি) | RIN>7 |
নমুনা প্রস্তুতি নির্দেশিকা এবং পরিষেবা কর্মপ্রবাহ সম্পর্কে আরও বিশদ বিবরণের জন্য, অনুগ্রহ করে নির্দ্বিধায় একটি সাথে কথা বলুন৷BMKGENE বিশেষজ্ঞ
পরিষেবা কর্মপ্রবাহ
নমুনা প্রস্তুতি পর্বে, একটি উচ্চ-মানের আরএনএ প্রাপ্ত করা যায় তা নিশ্চিত করার জন্য একটি প্রাথমিক বাল্ক RNA নিষ্কাশন ট্রায়াল করা হয়।টিস্যু অপ্টিমাইজেশান পর্যায়ে বিভাগগুলিকে দাগ দেওয়া হয় এবং ভিজ্যুয়ালাইজ করা হয় এবং টিস্যু থেকে এমআরএনএ মুক্তির জন্য ব্যাপ্তিকরণের শর্তগুলি অপ্টিমাইজ করা হয়।অপ্টিমাইজড প্রোটোকল তারপর লাইব্রেরি নির্মাণের সময় প্রয়োগ করা হয়, তারপরে সিকোয়েন্সিং এবং ডেটা বিশ্লেষণ করে।
সম্পূর্ণ পরিষেবা ওয়ার্কফ্লোতে একটি প্রতিক্রিয়াশীল প্রতিক্রিয়া লুপ বজায় রাখার জন্য রিয়েল-টাইম আপডেট এবং ক্লায়েন্ট নিশ্চিতকরণ জড়িত, মসৃণ প্রকল্প সম্পাদন নিশ্চিত করে।
নিম্নলিখিত বিশ্লেষণ অন্তর্ভুক্ত:
ডেটা মান নিয়ন্ত্রণ:
o ডেটা আউটপুট এবং গুণমান স্কোর বিতরণ
o স্পট প্রতি জিন সনাক্তকরণ
o টিস্যু কভারেজ
অভ্যন্তরীণ নমুনা বিশ্লেষণ:
o জিন সমৃদ্ধি
o স্পট ক্লাস্টারিং, হ্রাস মাত্রা বিশ্লেষণ সহ
o ক্লাস্টারগুলির মধ্যে ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ: মার্কার জিনের সনাক্তকরণ
o কার্যকরী টীকা এবং মার্কার জিন সমৃদ্ধকরণ
আন্তঃগ্রুপ বিশ্লেষণ
o উভয় নমুনা থেকে দাগের পুনরায় সংমিশ্রণ (যেমন। রোগাক্রান্ত এবং নিয়ন্ত্রণ) এবং পুনরায় ক্লাস্টার
o প্রতিটি ক্লাস্টারের জন্য মার্কার জিন সনাক্তকরণ
o কার্যকরী টীকা এবং মার্কার জিন সমৃদ্ধকরণ
o গোষ্ঠীর মধ্যে একই ক্লাস্টারের ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন
অভ্যন্তরীণ-নমুনা বিশ্লেষণ
স্পট ক্লাস্টারিং
মার্কার জিন সনাক্তকরণ এবং স্থানিক বিতরণ
আন্তঃগ্রুপ বিশ্লেষণ
উভয় গ্রুপ এবং পুনরায় ক্লাস্টার থেকে ডেটা সংমিশ্রণ
নতুন ক্লাস্টারের মার্কার জিন
এই বৈশিষ্ট্যযুক্ত প্রকাশনাগুলিতে 10X ভিজিয়াম দ্বারা BMKGene-এর স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোমিক্স পরিষেবা দ্বারা সুবিধাপ্রাপ্ত অগ্রগতিগুলি অন্বেষণ করুন:
চেন, ডি. এট আল।(2023) 'mthl1, স্তন্যপায়ী আঠালো জিপিসিআর-এর একটি সম্ভাব্য ড্রোসোফিলা হোমোলগ, মাছিতে ইনজেকশন দেওয়া অনকোজেনিক কোষে টিউমার প্রতিরোধী প্রতিক্রিয়ার সাথে জড়িত', মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রের ন্যাশনাল একাডেমি অফ সায়েন্সেসের কার্যধারা, 120(30), পি.e2303462120।doi: /10.1073/pnas.2303462120
চেন, ওয়াই এবং অন্যান্য।(2023) 'STEEL স্প্যাটিওটেম্পোরাল ট্রান্সক্রিপ্টোমিক ডেটার উচ্চ-রেজোলিউশন ডিলাইনেশন সক্ষম করে', বায়োইনফরমেটিক্সে ব্রিফিংস, 24(2), পৃষ্ঠা 1-10।doi: 10.1093/BIB/BBAD068।
লিউ, সি. এট আল।(2022) 'A spatiotemporal atlas of organogenesis in the development of orchid flowers', Nucleic Acids Research, 50(17), pp. 9724–9737.doi: 10.1093/NAR/GKAC773।
ওয়াং, জে. এট আল।(2023) 'ইন্টিগ্রেটিং স্পেশিয়াল ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স এবং একক-নিউক্লিয়াস আরএনএ সিকোয়েন্সিং রিভিলস দ্য পটেনশিয়াল থেরাপিউটিক স্ট্র্যাটেজিস ফর ইউটেরিন লিওমিওমা', ইন্টারন্যাশনাল জার্নাল অফ বায়োলজিক্যাল সায়েন্সেস, 19(8), পৃষ্ঠা 2515-2530।doi: 10.7150/IJBS.83510।
