lncrna

লং নন-কোডিং আরএনএ (lncRNA) হলো ২০০ নিউক্লিওটাইডের চেয়ে দীর্ঘ আরএনএ, যার কোডিং ক্ষমতা কম কিন্তু গুরুত্বপূর্ণ নিয়ন্ত্রক ভূমিকা রয়েছে। BMKCloud lncRNA পাইপলাইনটি একটি উচ্চ মানের, সু-অ্যানোটেড রেফারেন্স জিনোম ব্যবহার করে আরআরএনএ-বর্জিত লাইব্রেরি বিশ্লেষণ করার জন্য ডিজাইন করা হয়েছে, যেখানে lncRNA এবং mRNA-এর এক্সপ্রেশন একসাথে বিশ্লেষণ করা হয়। রিড ট্রিমিং এবং কোয়ালিটি কন্ট্রোলের পর, ট্রান্সক্রিপ্ট অ্যাসেম্বল করার জন্য রিডগুলোকে রেফারেন্স জিনোমের সাথে অ্যালাইন করা হয় এবং পরবর্তী জিন স্ট্রাকচার বিশ্লেষণের মাধ্যমে অল্টারনেটিভ স্প্লাইসিং ও নতুন জিন উন্মোচিত হয়। ট্রান্সক্রিপ্টগুলোকে mRNA বা lncRNA হিসেবে চিহ্নিত করা হয় এবং ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণের মাধ্যমে ডিফারেনশিয়ালি এক্সপ্রেসড lncRNA, তাদের টার্গেট এবং ডিফারেনশিয়ালি এক্সপ্রেসড জিন (DEGS) শনাক্ত করা হয়। সমৃদ্ধ কার্যকরী বিভাগগুলো খুঁজে বের করার জন্য DEGs এবং ডিফারেনশিয়ালি এক্সপ্রেসড lncRNA টার্গেট উভয়কেই কার্যকরীভাবে অ্যানোটেট করা হয়।