পণ্য

*এখানে দেখানো ডেমো ফলাফল সবই Biomarker Technologies-এর সাথে প্রকাশিত জিনোম থেকে

1.এর ক্রোমোজোম-স্তরের জিনোম সমাবেশে সার্কোসজি. রোটুন্ডিফোলিয়ামন্যানোপুর সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্ম দ্বারা

ওয়াং এম এট আল।,আণবিক জীববিজ্ঞান এবং বিবর্তন, 2021 

2.ওয়েনিং রাই জিনোম সমাবেশ এবং টীকা এর পরিসংখ্যান

লি জি এট আল।,প্রকৃতি জেনেটিক্স, 2021

3. এর জিনের পূর্বাভাসসেচিয়াম এডুলজিনোম, তিনটি ভবিষ্যদ্বাণী পদ্ধতি থেকে উদ্ভূত:নতুনভবিষ্যদ্বাণী, হোমোলজি-ভিত্তিক ভবিষ্যদ্বাণী এবং আরএনএ-সেক ডেটা ভিত্তিক ভবিষ্যদ্বাণী

ফু এ এট আল।,উদ্যানতত্ত্ব গবেষণা, 2021

4. তিনটি তুলার জিনোমে অক্ষত দীর্ঘ টার্মিনাল পুনরাবৃত্তির সনাক্তকরণ

ওয়াং এম এট আল।,আণবিক জীববিজ্ঞান এবং বিবর্তন, 2021

5.Hi-C তাপ মানচিত্রগ. আকুমিনাটাজিনোম জিনোম-ওয়াইড সব-বাই-সব মিথস্ক্রিয়া দেখাচ্ছে।হাই-সি মিথস্ক্রিয়াগুলির তীব্রতা কনটিগের মধ্যে রৈখিক দূরত্বের সমানুপাতিক।এই তাপ মানচিত্রে একটি পরিষ্কার সরল রেখা ক্রোমোজোমের উপর কনটিগগুলির একটি অত্যন্ত সঠিক নোঙ্গর নির্দেশ করে।(কন্টিগ অ্যাঙ্করিং অনুপাত: 96.03%)

কাং এম এট আল।,প্রকৃতি যোগাযোগ,2021

বিএমকে কেস

একটি উচ্চ-মানের জিনোম সমাবেশ রাইয়ের জিনোমিক বৈশিষ্ট্য এবং কৃষিগতভাবে গুরুত্বপূর্ণ জিনগুলিকে হাইলাইট করে

প্রকাশিত: প্রকৃতি জেনেটিক্স, 2021

সিকোয়েন্সিং কৌশল:

জিনোম সমাবেশ: 20 kb লাইব্রেরি সহ PacBio CLR মোড (497 Gb, প্রায় 63×)
ক্রম সংশোধন: ইলুমিনা প্ল্যাটফর্মে 270 bp DNA লাইব্রেরি (430 Gb, প্রায় 54×) সহ NGS
কনটিগস অ্যাঙ্করিং: ইলুমিনা প্ল্যাটফর্মে হাই-সি লাইব্রেরি (560 জিবি, প্রায় 71×)
অপটিক্যাল মানচিত্র: (779.55 Gb, প্রায় 99×) Bionano Irys-এ

মূল ফলাফল

1. ওয়েনিং রাই জিনোমের একটি সমাবেশ প্রকাশিত হয়েছিল মোট জিনোমের আকার 7.74 গিগাবাইট (প্রবাহ সাইটোমেট্রি দ্বারা আনুমানিক জিনোমের আকারের 98.74%)।এই সমাবেশের স্ক্যাফোল্ড N50 1.04 Gb অর্জন করেছে।93.67% কনটিগ সফলভাবে 7 টি সিউডো-ক্রোমোজোমে নোঙ্গর করা হয়েছিল।এই সমাবেশটি লিঙ্কেজ ম্যাপ, LAI এবং BUSCO দ্বারা মূল্যায়ন করা হয়েছিল, যার ফলে সমস্ত মূল্যায়নে উচ্চ স্কোর হয়েছে।

2. এই জিনোমের ভিত্তিতে তুলনামূলক জিনোমিক্স, জেনেটিক লিঙ্কেজ ম্যাপ, ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স স্টাডির উপর আরও অধ্যয়ন করা হয়েছিল।জিনোম-ওয়াইড জিন ডুপ্লিকেশন এবং স্টার্চ জৈব সংশ্লেষণ জিনের উপর তাদের প্রভাব সহ একাধিক বৈশিষ্ট্য সম্পর্কিত জিনোমিক বৈশিষ্ট্য প্রকাশ করা হয়েছিল;জটিল প্রোলামিন লোকির শারীরিক সংগঠন, প্রাথমিক শিরোনাম বৈশিষ্ট্যের অন্তর্নিহিত জিনের অভিব্যক্তি বৈশিষ্ট্য এবং পুটেটিভ গৃহপালিত-সম্পর্কিত ক্রোমোসোমাল অঞ্চল এবং রাইয়ের লোকি।

ওয়েইনিং রাই জিনোমের জিনোমিক বৈশিষ্ট্যের সার্কোস ডায়াগ্রাম

রাই জিনোমের বিবর্তনীয় এবং ক্রোমোজোম সিন্টেনি বিশ্লেষণ