সার্কআরএনএ

সার্কুলার আরএনএ (circRNA) হলো নন-কোডিং আরএনএ যা বৃত্তাকার কাঠামো গঠন করে এবং এর একাধিক নিয়ন্ত্রক ভূমিকা রয়েছে, যার মধ্যে টার্গেট জিনের জন্য miRNA-এর সাথে প্রতিযোগিতা এবং প্রোটিন বাইন্ডিং অন্তর্ভুক্ত। BMKCloud circRNA পাইপলাইনটি একটি সু-অ্যানোটেড এবং উচ্চ মানের রেফারেন্স জিনোম ব্যবহার করে rRNA-বর্জিত লাইব্রেরি বিশ্লেষণের জন্য ডিজাইন করা হয়েছে। এই বিশ্লেষণ শুরু হয় রিড ট্রিমিং এবং কোয়ালিটি কন্ট্রোলের মাধ্যমে, এরপর রেফারেন্স জিনোমের সাথে রিড অ্যালাইনমেন্ট এবং নতুন circRNA-এর পূর্বাভাস দেওয়া হয়, যার সাথে ডেটাবেস থেকে পরিচিত circRNA শনাক্ত করা হয়। পরবর্তীতে সংশ্লিষ্ট miRNA টার্গেট এবং circRNA হোস্ট শনাক্ত করা হয়। ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ ডিফারেনশিয়ালি এক্সপ্রেসড circRNA-গুলোকে প্রকাশ করে, এবং সংশ্লিষ্ট হোস্টগুলোকে কার্যকরীভাবে অ্যানোটেট করে সমৃদ্ধ জৈবিক ফাংশনগুলো নিষ্কাশন করা হয়।