BMKCloud Log in
条形 ব্যানার-03

পণ্য

16S/18S/ITS অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং-এনজিএস

16S/18S/ITS অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং-এর লক্ষ্য হল একটি মাইক্রোবিয়াল সম্প্রদায়ের ফাইলোজেনি, শ্রেণীবিন্যাস এবং প্রজাতির প্রাচুর্য প্রকাশ করা যা হাউসকিপিং জেনেটিক মার্কারগুলির PCR পণ্যগুলির তদন্ত করে যা অত্যন্ত কথিত এবং হাইপারভারিয়েবল উভয় অংশই ধারণ করে।Woeses et al,(1977) দ্বারা এই নিখুঁত আণবিক আঙ্গুলের ছাপের প্রবর্তন বিচ্ছিন্নতা-মুক্ত মাইক্রোবায়োম প্রোফাইলিংকে শক্তিশালী করে।16S (ব্যাকটেরিয়া), 18S (ছত্রাক) এবং অভ্যন্তরীণ প্রতিলিপিযুক্ত স্পেসার (আইটিএস, ছত্রাক) এর সিকোয়েন্সিং প্রচুর প্রজাতির পাশাপাশি বিরল এবং অজ্ঞাত প্রজাতির সনাক্তকরণের অনুমতি দেয়।এই প্রযুক্তি মানুষের মুখ, অন্ত্র, মল ইত্যাদির মতো বিভিন্ন পরিবেশে ডিফারেনশিয়াল মাইক্রোবিয়াল কম্পোজিশন সনাক্ত করার জন্য একটি ব্যাপকভাবে প্রয়োগ করা এবং প্রধান হাতিয়ার হয়ে উঠেছে।

প্ল্যাটফর্ম:ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্ম


পরিষেবার বিবরণ

ডেমো ফলাফল

কেস স্টাডি

পরিষেবার সুবিধা

● পরিবেশগত নমুনাগুলিতে জীবাণু গঠনের বিচ্ছিন্নতা-মুক্ত এবং দ্রুত সনাক্তকরণ

● পরিবেশগত নমুনাগুলিতে কম-প্রচুর উপাদানগুলিতে উচ্চ রেজোলিউশন

● সর্বশেষ QIIME2 ডাটাবেস, টীকা, OTU/ASV এর পরিপ্রেক্ষিতে বিভিন্ন বিশ্লেষণের সাথে বিশ্লেষণের প্রবাহ।

● উচ্চ-থ্রুপুট, উচ্চ নির্ভুলতা

● বিভিন্ন অণুজীব সম্প্রদায় অধ্যয়নের জন্য প্রযোজ্য

● BMK 100,000-এর বেশি নমুনা/বছর, মাটি, জল, গ্যাস, স্লাজ, মল, অন্ত্র, ত্বক, গাঁজন ঘোল, পোকামাকড়, গাছপালা ইত্যাদির সাথে বিস্তৃত অভিজ্ঞতার মালিক।

● BMKCloud 45টি ব্যক্তিগতকৃত বিশ্লেষণ সরঞ্জাম সহ ডেটা ব্যাখ্যার সুবিধা

পরিষেবা নির্দিষ্টকরণ

সিকোয়েন্সিংপ্ল্যাটফর্ম

লাইব্রেরি

প্রস্তাবিত তথ্য ফলন

আনুমানিক ঘূর্ণায়মান সময়

ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্ম

PE250

50K/100K/300K ট্যাগ

30 দিন

বায়োইনফরমেটিক্স বিশ্লেষণ

● কাঁচা ডেটা মান নিয়ন্ত্রণ

● OTU ক্লাস্টারিং/ডি-নোইজ(ASV)

● OTU টীকা

● আলফা বৈচিত্র্য

● বিটা বৈচিত্র্য

● আন্তঃগ্রুপ বিশ্লেষণ

● পরীক্ষামূলক কারণের বিরুদ্ধে অ্যাসোসিয়েশন বিশ্লেষণ

● ফাংশন জিন পূর্বাভাস

16 এস

নমুনা প্রয়োজনীয়তা এবং ডেলিভারি

নমুনা প্রয়োজনীয়তা:

জন্যডিএনএ নির্যাস:

নমুনার ধরন

পরিমাণ

একাগ্রতা

বিশুদ্ধতা

ডিএনএ নির্যাস

30 এনজি

1 এনজি/μl

OD260/280= 1.6-2.5

পরিবেশগত নমুনার জন্য:

নমুনার ধরন

প্রস্তাবিত নমুনা পদ্ধতি

মাটি

নমুনার পরিমাণ: প্রায়।5 গ্রাম;অবশিষ্ট শুকনো পদার্থ পৃষ্ঠ থেকে অপসারণ করা প্রয়োজন;বড় টুকরা পিষে এবং 2 মিমি ফিল্টার মাধ্যমে পাস;সংরক্ষণের জন্য জীবাণুমুক্ত EP-টিউব বা সাইরোটিউবে অ্যালিকোট নমুনা।

মল

নমুনার পরিমাণ: প্রায়।5 গ্রাম;সংরক্ষণের জন্য জীবাণুমুক্ত ইপি-টিউব বা ক্রায়োটিউবে নমুনা সংগ্রহ এবং অ্যালিকোট করুন।

অন্ত্রের বিষয়বস্তু

অ্যাসেপটিক অবস্থার অধীনে নমুনাগুলি প্রক্রিয়া করা দরকার।PBS সঙ্গে সংগৃহীত টিস্যু ধোয়া;পিবিএসকে সেন্ট্রিফিউজ করুন এবং ইপি-টিউবে প্রিপিপিট্যান্ট সংগ্রহ করুন।

কর্দম

নমুনার পরিমাণ: প্রায়।5 গ্রাম;সংরক্ষণের জন্য জীবাণুমুক্ত ইপি-টিউব বা ক্রায়োটিউবে অ্যালিকোট স্লাজের নমুনা সংগ্রহ করুন

পানি শরীর

সীমিত পরিমাণে মাইক্রোবিয়ালের নমুনার জন্য, যেমন ট্যাপের জল, কূপের জল, ইত্যাদি, কমপক্ষে 1 লিটার জল সংগ্রহ করুন এবং ঝিল্লিতে মাইক্রোবিয়ালকে সমৃদ্ধ করতে 0.22 μm ফিল্টারের মধ্য দিয়ে যান।জীবাণুমুক্ত টিউবে ঝিল্লি সংরক্ষণ করুন।

চামড়া

জীবাণুমুক্ত তুলো সোয়াব বা সার্জিক্যাল ব্লেড দিয়ে ত্বকের পৃষ্ঠকে সাবধানে স্ক্র্যাপ করুন এবং জীবাণুমুক্ত টিউবে রাখুন।

প্রস্তাবিত নমুনা বিতরণ

নমুনাগুলিকে তরল নাইট্রোজেনে 3-4 ঘন্টার জন্য হিমায়িত করুন এবং তরল নাইট্রোজেন বা -80 ডিগ্রিতে দীর্ঘমেয়াদী সংরক্ষণে সংরক্ষণ করুন।শুষ্ক-বরফ সহ নমুনা শিপিং প্রয়োজন।

সার্ভিস ওয়ার্ক ফ্লো

নমুনা বিতরণ

নমুনা বিতরণ

লাইব্রেরি প্রস্তুতি

গ্রন্থাগার নির্মাণ

সিকোয়েন্সিং

সিকোয়েন্সিং

তথ্য বিশ্লেষণ

তথ্য বিশ্লেষণ

পরে বিক্রয় সেবা

পরে বিক্রয় সেবা


  • আগে:
  • পরবর্তী:

  • 1. প্রজাতি বিতরণ

    3

    2.তাপ মানচিত্র: প্রজাতির সমৃদ্ধি ক্লাস্টারিং

    4

    3. বিরল উপদল বক্ররেখা

    5

    4.NMDS বিশ্লেষণ

    6

    5.Lefse বিশ্লেষণ

    7

     

     

     

    বিএমকে কেস

    টাইপ 2 ডায়াবেটিস সহ এবং ব্যতীত স্থূল ব্যক্তিরা বিভিন্ন অন্ত্রের মাইক্রোবিয়াল কার্যকরী ক্ষমতা এবং গঠন দেখায়

    প্রকাশিত:সেল হোস্ট এবং মাইক্রোব, 2019

    সিকোয়েন্সিং কৌশল:

    চর্বিহীন অ-ডায়াবেটিস (n=633);স্থূল অ-ডায়াবেটিস (n=494);স্থূল-টাইপ 2 ডায়াবেটিস (n=153);
    লক্ষ্য অঞ্চল: 16S rDNA V1-V2
    প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা মিসেক (এনজিএস-ভিত্তিক অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং)
    ডিএনএ নির্যাসের উপসেট ইলুমিনা হিসেকে মেটাজেনমিক সিকোয়েন্সিংয়ের শিকার হয়েছিল

    মূল ফলাফল

    এই বিপাকীয় রোগগুলির মাইক্রোবিয়াল প্রোফাইলিংগুলি সফলভাবে পৃথক করা হয়েছিল।
    16S সিকোয়েন্সিং দ্বারা উত্পন্ন মাইক্রোবিয়াল বৈশিষ্ট্যগুলির তুলনা করে, স্থূলতা মাইক্রোবিয়াল গঠনের পরিবর্তন, স্বতন্ত্র বৈশিষ্ট্য, বিশেষ করে আকেরম্যানসিয়া, ফেক্যালিব্যাকটেরিয়াম, অসিলিব্যাক্টর, অ্যালিস্টিপস ইত্যাদির উল্লেখযোগ্য হ্রাসের সাথে যুক্ত পাওয়া গেছে। উপরন্তু, T2D Escherichia/shigella বৃদ্ধির সাথে যুক্ত পাওয়া গেছে। .

    রেফারেন্স

    Thingholm, LB, et al."টাইপ 2 ডায়াবেটিস সহ এবং ছাড়া স্থূল ব্যক্তিরা বিভিন্ন অন্ত্রের মাইক্রোবিয়াল কার্যকরী ক্ষমতা এবং গঠন দেখায়।"সেল হোস্ট এবং মাইক্রোব26.2 (2019)।

     

    একটি উদ্ধৃতি পেতে

    এখানে আপনার বার্তা লিখুন এবং আমাদের পাঠান

    আমাদের কাছে আপনার বার্তা পাঠান: