দীর্ঘ নন-কোডিং সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
পরিষেবার সুবিধা
●mRNA এবং lncRNA-এর যৌথ বিশ্লেষণmRNA ট্রান্সক্রিপ্টের পরিমাণ নির্ণয়ের সাথে lncRNA এবং তাদের টার্গেট সম্পর্কিত অধ্যয়নকে একত্রিত করার মাধ্যমে, কোষীয় প্রতিক্রিয়ার অন্তর্নিহিত নিয়ন্ত্রণমূলক প্রক্রিয়া সম্পর্কে একটি গভীর ধারণা পাওয়া সম্ভব।
●ব্যাপক দক্ষতাআমরা বিভিন্ন নমুনা এবং প্রকল্পের উদ্দেশ্যকে সামনে রেখে ২,৩০,০০০-এরও বেশি নমুনা প্রক্রিয়াজাত করেছি। আমরা প্রতিটি প্রকল্পে আমাদের বিপুল অভিজ্ঞতা নিয়ে আসি।
●mRNA এবং lncRNA-এর যৌথ বিশ্লেষণআমরা mRNA ট্রান্সক্রিপ্টের পরিমাণ নির্ণয়ের সাথে lncRNA এবং তাদের টার্গেট নিয়ে গবেষণাকে একত্রিত করি, যার ফলে কোষীয় প্রতিক্রিয়ার অন্তর্নিহিত নিয়ন্ত্রক প্রক্রিয়া সম্পর্কে একটি গভীর ধারণা লাভ করা সম্ভব হয়।
●কঠোর মান নিয়ন্ত্রণআমরা নমুনা প্রস্তুতি থেকে শুরু করে লাইব্রেরি প্রস্তুতি, সিকোয়েন্সিং এবং বায়োইনফরমেটিক্স পর্যন্ত সকল পর্যায়ে মূল নিয়ন্ত্রণ ব্যবস্থা প্রয়োগ করি। আমাদের সতর্ক পর্যবেক্ষণ ধারাবাহিকভাবে উচ্চ মানের ফলাফল প্রদান নিশ্চিত করে।
●বিশদ টীকাআমরা ডিফারেনশিয়ালি এক্সপ্রেসড জিন (ডিইজি)-গুলোকে কার্যকরীভাবে টীকাযুক্ত করতে এবং সংশ্লিষ্ট এনরিচমেন্ট বিশ্লেষণ সম্পাদন করতে একাধিক ডেটাবেস ব্যবহার করি। এই ব্যাপক পদ্ধতিটি ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রতিক্রিয়ার অন্তর্নিহিত কোষীয় এবং আণবিক প্রক্রিয়াগুলো সম্পর্কে অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে, যা নিশ্চিত করে যে আপনি আপনার পরীক্ষার ডেটা সম্পর্কে সম্ভাব্য সমস্ত তথ্য পাচ্ছেন।
●বিক্রয়োত্তর সহায়তাউপস্থিত থাকার গুরুত্ব আমরা বুঝি, তাই প্রকল্প সমাপ্তির পরেও আমাদের প্রতিশ্রুতি ৩ মাসের বিক্রয়োত্তর সেবার মাধ্যমে প্রসারিত হয়। এই সময়ে, আমরা প্রকল্পের ফলো-আপ, সমস্যা সমাধানে সহায়তা এবং ফলাফল সম্পর্কিত যেকোনো জিজ্ঞাসার সমাধানের জন্য প্রশ্নোত্তর পর্বের আয়োজন করে থাকি।
নমুনার প্রয়োজনীয়তা এবং ডেলিভারি
| লাইব্রেরি | প্ল্যাটফর্ম | প্রস্তাবিত ডেটা | ডেটা কিউসি |
| আরআরএনএ-বঞ্চিত দিকনির্দেশক লাইব্রেরি | ইলুমিনা পিই১৫০ | ১০-১৬ জিবি | Q30≥85% |
নিউক্লিওটাইড:
| ঘনত্ব (ng/μl) | পরিমাণ (μg) | বিশুদ্ধতা | সততা |
| ≥ ৮০ | ≥ ০.৮ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 জেলে সীমিত বা কোনো প্রোটিন বা ডিএনএ দূষণ দেখা যায়নি। | RIN≥৬.০; ৫.০≥২৮এস/১৮এস≥১.০; সীমিত বা কোনো বেসলাইন উচ্চতা নেই |
● উদ্ভিদ:
মূল, কাণ্ড বা পাপড়ি: ৪৫০ মিলিগ্রাম
পাতা বা বীজ: ৩০০ মিলিগ্রাম
ফল: ১.২ গ্রাম
● প্রাণী:
হৃৎপিণ্ড বা অন্ত্র: ৪৫০ মিলিগ্রাম
অভ্যন্তরীণ অঙ্গ বা মস্তিষ্ক: ২৪০ মিলিগ্রাম
পেশী: ৬০০ মিলিগ্রাম
হাড়, চুল বা ত্বক: ১.৫ গ্রাম
● আর্থ্রোপড:
পোকামাকড়: ৯ গ্রাম
ক্রাস্টেশিয়া: ৪৫০ মিলিগ্রাম
● সম্পূর্ণ রক্ত:২টি টিউব
● কোষ: 106 কোষ
● সিরাম এবং প্লাজমা: ৬ মিলি
প্রস্তাবিত নমুনা ডেলিভারি
পাত্র: ২ মিলি সেন্ট্রিফিউজ টিউব (টিন ফয়েল ব্যবহার করা বাঞ্ছনীয় নয়)
নমুনার নামকরণ: গ্রুপ+প্রতিলিপি, যেমন A1, A2, A3; B1, B2, B3।
চালান:
১. ড্রাই-আইস: নমুনাগুলো ব্যাগে ভরে ড্রাই-আইসের মধ্যে পুঁতে রাখতে হবে।
২. আরএনএস্টেবল টিউব: আরএনএ নমুনা আরএনএ স্থিতিশীলকরণ টিউবে (যেমন আরএনএস্টেবল®) শুকিয়ে কক্ষ তাপমাত্রায় পাঠানো যেতে পারে।
পরিষেবা কার্যপ্রবাহ
পরীক্ষার নকশা
নমুনা সরবরাহ
আরএনএ নিষ্কাশন
গ্রন্থাগার নির্মাণ
ক্রমবিন্যাস
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয়োত্তর সেবা
বায়োইনফরমেটিক্স
- কাঁচা ডেটা
- ডেটা কিউসি
- জিনোম সারিবদ্ধকরণ
- জিনের গঠন (বিকল্প স্প্লাইসিং, জিনের গঠন অপ্টিমাইজেশন এবং নতুন জিনের পূর্বাভাস)
- জিন অভিব্যক্তির পরিমাণ নির্ধারণ
- ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ
- ডিইজি টীকা এবং সমৃদ্ধকরণ + ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেসড এলএনসিআরএনএ টার্গেট জিন
- প্রতিলিপি শনাক্তকরণ
- lncRNA শনাক্তকরণ (lncRNA সংরক্ষণ এবং পরিচিত lncRNA)
- lncRNA লক্ষ্য জিনের পূর্বাভাস
- lncRNA এক্সপ্রেশন পরিমাণ নির্ধারণ
- mRNA ডেটার সাথে যৌথ বিশ্লেষণ
ডিফারেনশিয়াল জিন এক্সপ্রেশন (ডিইজি) বিশ্লেষণ
lncRNA এক্সপ্রেশনের পরিমাণ নির্ধারণ – ক্লাস্টারিং
lncRNA টার্গেট জিনের সমৃদ্ধি
mRNA এবং lncRNA-এর যৌথ অবস্থান বিশ্লেষণ – সার্কোস প্লট (মাঝের বৃত্তটি mRNA এবং ভেতরের বৃত্তটি lncRNA)
নির্বাচিত প্রকাশনা সংকলনের মাধ্যমে BMKGene-এর lncRNA সিকোয়েন্সিং পরিষেবার দ্বারা সাধিত অগ্রগতিগুলো অন্বেষণ করুন।
জি, এইচ. প্রমুখ (২০২০) 'ইঁদুরের যকৃতে শৈত্যচাপ-সম্পর্কিত lncRNA-সমূহের শনাক্তকরণ, কার্যগত পূর্বাভাস এবং মূল lncRNA যাচাইকরণ',বৈজ্ঞানিক প্রতিবেদন2020 10:1, 10(1), পৃষ্ঠা 1–14। doi: 10.1038/s41598-020-57451-7।
জিয়া, জেড. প্রমুখ (২০২১) 'সমন্বিত ট্রান্সক্রিপ্টোমিক বিশ্লেষণ একটি CyHV-3-প্রতিরোধী কমন কার্প স্ট্রেইনের রোগ প্রতিরোধ ব্যবস্থা উন্মোচন করে',ইমিউনোলজিতে ফ্রন্টিয়ার্স, 12, পৃ. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
ওয়াং, এক্সজে এট আল. (২০২২) 'স্মল সেল লাং ক্যান্সারে প্রতিযোগী এন্ডোজেনাস আরএনএ নিয়ন্ত্রণ নেটওয়ার্কের মাল্টি-ওমিক্স ইন্টিগ্রেশন-ভিত্তিক অগ্রাধিকার নির্ধারণ: আণবিক বৈশিষ্ট্য এবং ঔষধ প্রার্থী',ফ্রন্টিয়ার্স ইন অনকোলজি, 12, পৃ. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
শাও, এল. প্রমুখ (২০২০) 'পপুলাসে সালোকসংশ্লেষণের অন্তর্নিহিত জিন সহ-অভিব্যক্তি নেটওয়ার্কের জিনগত বিশ্লেষণ',উদ্ভিদ জৈবপ্রযুক্তি জার্নাল, 18(4), পৃষ্ঠা 1015–1026। doi: 10.1111/PBI.13270।
ঝেং, এইচ. প্রমুখ (২০২২) 'গ্রেভস ডিজিজ এবং হাশিমোটোস থাইরয়েডাইটিসের মাইক্রোএনভায়রনমেন্টে ইমিউন কোষগুলিতে অনিয়ন্ত্রিত জিন এক্সপ্রেশন এবং অস্বাভাবিক মেটাবলিক সিগন্যালিং-এর জন্য একটি গ্লোবাল রেগুলেটরি নেটওয়ার্ক',ইমিউনোলজিতে ফ্রন্টিয়ার্স, 13, পৃ. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX।
