●mRNA এবং lncRNA এর যৌথ বিশ্লেষণ: lncRNA এবং তাদের লক্ষ্যগুলির অধ্যয়নের সাথে mRNA ট্রান্সক্রিপ্টের পরিমাপকে একত্রিত করে, সেলুলার প্রতিক্রিয়ার অন্তর্নিহিত নিয়ন্ত্রক প্রক্রিয়াটির একটি গভীর ওভারভিউ পাওয়া সম্ভব।
●ব্যাপক দক্ষতা: আমাদের দল প্রতিটি প্রকল্পে প্রচুর অভিজ্ঞতা নিয়ে আসে, বিএমকে-তে 23,000 টিরও বেশি নমুনা প্রক্রিয়াকরণের ট্র্যাক রেকর্ড সহ বিভিন্ন ধরণের নমুনা এবং lncRNA প্রকল্পগুলি বিস্তৃত।
●কঠোর মান নিয়ন্ত্রণ: আমরা নমুনা এবং লাইব্রেরি প্রস্তুতি থেকে সিকোয়েন্সিং এবং বায়োইনফরমেটিক্স পর্যন্ত সমস্ত পর্যায়ে মূল নিয়ন্ত্রণ পয়েন্টগুলি বাস্তবায়ন করি। এই সূক্ষ্ম পর্যবেক্ষণ ধারাবাহিকভাবে উচ্চ-মানের ফলাফল প্রদান নিশ্চিত করে।
●বিক্রয়োত্তর সমর্থন: আমাদের প্রতিশ্রুতি 3 মাসের বিক্রয়োত্তর পরিষেবার মেয়াদ সহ প্রকল্প সমাপ্তির বাইরে প্রসারিত। এই সময়ের মধ্যে, আমরা ফলাফলের সাথে সম্পর্কিত যেকোন প্রশ্নের সমাধান করতে প্রকল্প ফলো-আপ, সমস্যা সমাধানে সহায়তা এবং প্রশ্নোত্তর সেশন অফার করি।
লাইব্রেরি | প্ল্যাটফর্ম | প্রস্তাবিত ডেটা | ডেটা QC |
rRNA ক্ষয়প্রাপ্ত নির্দেশমূলক গ্রন্থাগার | ইলুমিনা PE150 | 10-16 জিবি | Q30≥85% |
Conc.(ng/μl) | পরিমাণ (μg) | বিশুদ্ধতা | সততা |
≥ 80 | ≥ ০.৮ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 জেলে দেখানো সীমিত বা কোন প্রোটিন বা ডিএনএ দূষণ নেই। | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; সীমিত বা কোন বেসলাইন উচ্চতা |
● গাছপালা:
মূল, কান্ড বা পাপড়ি: 450 মিলিগ্রাম
পাতা বা বীজ: 300 মিলিগ্রাম
ফল: 1.2 গ্রাম
● প্রাণী:
হার্ট বা অন্ত্র: 450 মিলিগ্রাম
ভিসেরা বা মস্তিষ্ক: 240 মিগ্রা
পেশী: 600 মিলিগ্রাম
হাড়, চুল বা ত্বক: 1.5 গ্রাম
● আর্থ্রোপডস:
পোকামাকড়: 9 গ্রাম
ক্রাস্টেসিয়া: 450 মিলিগ্রাম
● সম্পূর্ণ রক্ত:2 টিউব
● কোষ: 106 কোষ
● সিরাম এবং প্লাজমা: 6 মিলি
প্রস্তাবিত নমুনা বিতরণ
ধারক: 2 মিলি সেন্ট্রিফিউজ টিউব (টিনের ফয়েল বাঞ্ছনীয় নয়)
নমুনা লেবেলিং: গ্রুপ+প্রতিলিপি যেমন A1, A2, A3; B1, B2, B3।
চালান:
1. শুকনো বরফ: নমুনাগুলি ব্যাগে প্যাক করা এবং শুকনো বরফের মধ্যে সমাহিত করা দরকার।
2. আরএনএস্টেবল টিউব: আরএনএ নমুনাগুলিকে আরএনএ স্ট্যাবিলাইজেশন টিউবে শুকানো যেতে পারে (যেমন RNAstable®) এবং ঘরের তাপমাত্রায় পাঠানো যেতে পারে।
বায়োইনফরমেটিক্স
ডিফারেনশিয়াল জিন এক্সপ্রেশন (DEGs) বিশ্লেষণ
lncRNA এক্সপ্রেশনের পরিমাণ নির্ধারণ - ক্লাস্টারিং
lncRNA টার্গেট জিন সমৃদ্ধকরণ
যৌথ mRNA এবং lncRNA অবস্থান বিশ্লেষণ – সার্কোস প্লট (মাঝারি বৃত্ত হল mRNA এবং ভিতরের বৃত্ত হল lncRNA)
প্রকাশনাগুলির একটি কিউরেটেড সংগ্রহের মাধ্যমে BMKGene-এর lncRNA ইকুয়েন্সিং পরিষেবাগুলির দ্বারা সহজলভ্য অগ্রগতিগুলি অন্বেষণ করুন৷
জি, এইচ. এট আল। (2020) 'আইডেন্টিফিকেশন, কার্যকরী ভবিষ্যদ্বাণী, এবং ইঁদুরের লিভারে ঠান্ডা চাপ-সম্পর্কিত lncRNAগুলির মূল lncRNA যাচাইকরণ', বৈজ্ঞানিক রিপোর্ট 2020 10:1, 10(1), pp. 1-14৷ doi: 10.1038/s41598-020-57451-7।
জিয়া, জেড এবং অন্যান্য। (2021) 'ইন্টিগ্রেটিভ ট্রান্সক্রিপ্টোমিক অ্যানালাইসিস রিভিলস দ্য ইমিউন মেকানিজম ফর এ সাইএইচভি-৩-রেজিস্ট্যান্ট কমন কার্প স্ট্রেন', ফ্রন্টিয়ার্স ইন ইমিউনোলজি, 12, পি. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
ওয়াং, এক্সজে এবং অন্যান্য। (2022) 'মাল্টি-ওমিক্স ইন্টিগ্রেশন-ভিত্তিক অগ্রাধিকার কম্পিটিং এন্ডোজেনাস আরএনএ রেগুলেশন নেটওয়ার্কস ইন স্মল সেল লাং ক্যান্সার: মলিকুলার ক্যারেক্টিস্টিকস অ্যান্ড ড্রাগ ক্যান্ডিডেটস', ফ্রন্টিয়ার্স ইন অনকোলজি, 12, পি. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'পপুলাসে সালোকসংশ্লেষণের অন্তর্নিহিত জিনের সহ-অভিব্যক্তি নেটওয়ার্কের জেনেটিক ডিসেকশন', প্ল্যান্ট বায়োটেকনোলজি জার্নাল, 18(4), পিপি। 1015–1026। doi: 10.1111/PBI.13270।
ঝেং, এইচ. এট আল। (2022) 'এ গ্লোবাল রেগুলেটরি নেটওয়ার্ক ফর ডিসরেগুলেটেড জিন এক্সপ্রেশন অ্যান্ড অ্যাবনরমাল মেটাবলিক সিগন্যালিং ইন ইমিউন সেল ইন দ্য মাইক্রোএনভায়রনমেন্ট অফ গ্রেভস ডিজিজ অ্যান্ড হাশিমোটোস থাইরয়েডাইটিস', ফ্রন্টিয়ার্স ইন ইমিউনোলজি, 13, পি. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX।