১৬এস/১৮এস/আইটিএস অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং-প্যাকবিও
পরিষেবা বৈশিষ্ট্য
● সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্ম: প্যাকবিও রেভিও
● সিকোয়েন্সিং মোড: CCS (হাইফাই রিড)
● হাইফাই এসএমআরটি বেল লাইব্রেরি প্রস্তুতির আগে লক্ষ্য অঞ্চলের প্রশস্তকরণ এবং তারপরে অ্যামপ্লিকনগুলির ট্যান্ডেম লিঙ্কিং
পরিষেবার সুবিধা
●উচ্চতর ট্যাক্সোনমিক রেজোলিউশন: টিহ্যান শর্ট-অ্যাম্পলিকন সিকোয়েন্সিং,প্রজাতি স্তরে উচ্চতর OTU শ্রেণীবিভাগ হার সক্ষম করে।
●অত্যন্ত নির্ভুল বেস কলিং: PacBio CCS মোড সিকোয়েন্সিং (HiFi রিড)।
●বিচ্ছিন্নতা-মুক্ত: পরিবেশগত নমুনায় জীবাণুর গঠনের দ্রুত সনাক্তকরণ।
●ব্যাপকভাবে প্রযোজ্য: বিভিন্ন জীবাণু সম্প্রদায় অধ্যয়ন।
●ব্যাপক জৈব তথ্য বিশ্লেষণ: ডাটাবেস, টীকা, OTU/ASV এর পরিপ্রেক্ষিতে বিভিন্ন বিশ্লেষণ সহ সর্বশেষ QIIME2 প্যাকেজ (অণুজীব বাস্তুবিদ্যার পরিমাণগত অন্তর্দৃষ্টি)।
●বিস্তৃত দক্ষতা: প্রতি বছর হাজার হাজার অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং প্রকল্প পরিচালিত হওয়ার সাথে সাথে, BMKGENE এক দশকেরও বেশি অভিজ্ঞতা, একটি অত্যন্ত দক্ষ বিশ্লেষণ দল, ব্যাপক বিষয়বস্তু এবং চমৎকার বিক্রয়োত্তর সহায়তা নিয়ে আসে।
পরিষেবার স্পেসিফিকেশন
| লাইব্রেরি | সিকোয়েন্সিং কৌশল | প্রস্তাবিত ডেটা |
| অ্যামপ্লিকন | প্যাকবিও রেভিও | ১০/৩০/৫০ কে ট্যাগ (সিসিএস) |
নমুনা প্রয়োজনীয়তা
| ঘনত্ব (ng/µL) | মোট পরিমাণ (µg) | আয়তন (µL) |
| ≥৫ | ≥০.৩ | ≥২০ |
প্রস্তাবিত নমুনা বিতরণ
নমুনাগুলিকে তরল নাইট্রোজেনে ৩-৪ ঘন্টার জন্য ফ্রিজে রাখুন এবং তরল নাইট্রোজেন অথবা -৮০ ডিগ্রি তাপমাত্রায় দীর্ঘমেয়াদী সংরক্ষণে সংরক্ষণ করুন। শুকনো বরফ দিয়ে নমুনা পাঠানো প্রয়োজন।
পরিষেবা কর্মপ্রবাহ
নমুনা বিতরণ
লাইব্রেরি নির্মাণ
সিকোয়েন্সিং
তথ্য বিশ্লেষণ
বিক্রয়োত্তর সেবা
নিম্নলিখিত বিশ্লেষণ অন্তর্ভুক্ত:
● কাঁচা তথ্যের মান নিয়ন্ত্রণ
● OTU ক্লাস্টারিং/ডি-নয়েজ (ASV)
●OTU টীকা
● আলফা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ: শ্যানন, সিম্পসন এবং ACE সহ একাধিক সূচক।
● বিটা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ
● আন্তঃগ্রুপ বিশ্লেষণ
● পারস্পরিক সম্পর্ক বিশ্লেষণ: পরিবেশগত কারণ এবং OUT গঠন এবং বৈচিত্র্যের মধ্যে
● ১৬S কার্যকরী জিন পূর্বাভাস
ট্যাক্সোনমিক বন্টনের হিস্টোগ্রাম
সম্প্রদায় বন্টন ফাইলোজেনেটিক ট্রি
আলফা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ: ACE
সূচক
বিটা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ: PCoA
আন্তঃগ্রুপ বিশ্লেষণ: আনোভা
PacBio-এর সাথে BMKGene-এর অ্যাম্পলিকন সিকোয়েন্সিং পরিষেবাগুলির মাধ্যমে প্রকাশিত প্রকাশনার একটি সংগ্রহের মাধ্যমে অগ্রগতিগুলি অন্বেষণ করুন।
গাও, এক্স. এবং ওয়াং, এইচ. (২০২৩) 'আলপাইন মেরিনো ভেড়ার দুটি বৃদ্ধির পর্যায়ে আল্পাইন তৃণভূমিতে বিভিন্ন ফেনোলজির (রেগ্রিন বনাম ঘাস) অভিযোজনের সময় রুমেন ব্যাকটেরিয়ার প্রোফাইল এবং কার্যকারিতার তুলনামূলক বিশ্লেষণ', গাঁজন, 9(1), পৃষ্ঠা 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
লি, এস. এট আল. (২০২৩) 'কালচারোমিক্স-ভিত্তিক মেটাজেনমিক্স এবং উচ্চ-রেজোলিউশন বিশ্লেষণ ব্যবহার করে মরুভূমির মাটিতে মাইক্রোবায়াল ডার্ক ম্যাটার ক্যাপচারিং', এনপিজে বায়োফিল্মস অ্যান্ড মাইক্রোবায়োমস ২০২৩ ৯:১, ৯(১), পৃষ্ঠা ১–১৪। doi: ১০.১০৩৮/s৪১৫২২-০২৩-০০৪৩৯-৮।
Mu, L. et al. (2022) 'আলফালফা, ধানের খড় এবং গমের ভুসি দিয়ে তৈরি মিশ্র সাইলেজের গাঁজন বৈশিষ্ট্য, ব্যাকটেরিয়ার বৈচিত্র্য এবং বায়বীয় স্থিতিশীলতার উপর ফ্যাটি অ্যাসিড লবণের প্রভাব', জার্নাল অফ দ্য সায়েন্স অফ ফুড অ্যান্ড এগ্রিকালচার, 102(4), পৃষ্ঠা 1475–1487। doi: 10.1002/JSFA.11482।
ইয়াং, জে. এট আল. (২০২৩) 'অক্সাজোলোন-প্ররোচিত অন্ত্রের অক্সিডেটিভ স্ট্রেস ইন অ্যাডাল্ট জেব্রাফিশ'-এ সোনচাস ব্র্যাকিওটাস ডিসি থেকে নির্যাসের অ্যান্টিঅক্সিডেন্ট প্রভাবে অক্সিডেটিভ স্ট্রেস বায়োমার্কার এবং অন্ত্রের মাইক্রোবায়োটার মধ্যে মিথস্ক্রিয়া', অ্যান্টিঅক্সিডেন্টস ২০২৩, খণ্ড ১২, পৃষ্ঠা ১৯২, ১২(১), পৃষ্ঠা ১৯২। doi: ১০.৩৩৯০/ANTIOX১২০১০১৯২।
