মেটাজেনমিক সিকোয়েন্সিং -এনজিএস
একটি মেটাজেনোম পরিবেশগত এবং মানব মেটাজেনোমগুলির মতো জীবের মিশ্র সম্প্রদায়ের মোট জেনেটিক উপাদানের সংকলন। এটিতে আবাদযোগ্য এবং অ -সংস্কৃতিযোগ্য অণুজীবের জিনোম রয়েছে। এনজিএসের সাথে শটগান মেটাজেনমিক সিকোয়েন্সিং এই জটিল জিনোমিক ল্যান্ডস্কেপগুলি পরিবেশগত নমুনাগুলিতে এম্বেড করা ট্যাক্সোনমিক প্রোফাইলিংয়ের চেয়ে বেশি সরবরাহ করে, প্রজাতির বৈচিত্র্য, প্রাচুর্য গতিশীলতা এবং জটিল জনসংখ্যার কাঠামোর মধ্যে দানাদার অন্তর্দৃষ্টি দেয়। ট্যাক্সোনমিক স্টাডিজের বাইরে, শটগান মেটাজেনোমিক্স একটি কার্যকরী জিনোমিক্স দৃষ্টিকোণও সরবরাহ করে, এনকোডযুক্ত জিনগুলির অনুসন্ধান এবং বাস্তুসংস্থানীয় প্রক্রিয়াগুলিতে তাদের পুটিক ভূমিকাগুলি সক্ষম করে। পরিশেষে, জেনেটিক উপাদান এবং পরিবেশগত কারণগুলির মধ্যে পারস্পরিক সম্পর্ক নেটওয়ার্ক স্থাপন মাইক্রোবায়াল সম্প্রদায় এবং তাদের পরিবেশগত পটভূমির মধ্যে জটিল ইন্টারপ্লে সম্পর্কে সামগ্রিক বোঝার জন্য অবদান রাখে। উপসংহারে, মেটাজেনমিক সিকোয়েন্সিং এই জটিল বাস্তুতন্ত্রের মধ্যে জেনেটিক্স এবং বাস্তুশাস্ত্রের মধ্যে বহুমুখী সম্পর্ককে আলোকিত করে বিভিন্ন মাইক্রোবায়াল সম্প্রদায়ের জিনোমিক জটিলতাগুলি উন্মোচন করার জন্য একটি মূল উপকরণ হিসাবে দাঁড়িয়েছে।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক এবং ডিএনবিএসইকিউ-টি 7
পরিষেবা সুবিধা
●মাইক্রোবায়াল সম্প্রদায়ের প্রোফাইলিংয়ের জন্য বিচ্ছিন্নতা এবং চাষ-মুক্ত পদ্ধতি: অবিশ্বাস্য জীব থেকে জিনগত উপাদানগুলির সিকোয়েন্সিং সক্ষম করা।
●উচ্চ রেজোলিউশন: পরিবেশগত নমুনায় স্বল্প-প্রাচুর্য প্রজাতি সনাক্ত করুন।
●বিস্তৃত বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণ:কেবল ট্যাক্সোনমিক বৈচিত্র্যের উপরই নয়, সম্প্রদায়ের কার্যকরী বৈচিত্র্যের উপরও মনোনিবেশ করা।
●বিস্তৃত অভিজ্ঞতা:বিভিন্ন গবেষণা ডোমেনগুলিতে একাধিক মেটাজেনমিক্স প্রকল্পগুলি সফলভাবে বন্ধ করার এবং 200,000 এরও বেশি নমুনা প্রক্রিয়াকরণের ট্র্যাক রেকর্ডের সাথে, আমাদের দল প্রতিটি প্রকল্পে প্রচুর অভিজ্ঞতা নিয়ে আসে।
পরিষেবা স্পেসিফিকেশন
| সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্ম | সিকোয়েন্সিং কৌশল | ডেটা প্রস্তাবিত | মান নিয়ন্ত্রণ |
| ইলুমিনা নোভাসেক বা ডিএনবিএসইকিউ-টি 7 | PE150 | 6-20 জিবি | Q30≥85% |
পরিষেবার প্রয়োজনীয়তা
| ঘনত্ব (এনজি/µl) | মোট পরিমাণ (এনজি) | ভলিউম (µl) |
| ≥1 | ≥30 | ≥20 |
● মাটি/কাদা: 2-3 জি
● অন্ত্রের সামগ্রী-প্রাণী: 0.5-2g
● অন্ত্রের বিষয়বস্তু- ইনস্যাক্ট: 0.1-0.25g
● উদ্ভিদ পৃষ্ঠ (সমৃদ্ধ পলল): 0.5-1g
● গাঁজন ব্রোথ সমৃদ্ধ পলল): 0.2-0.5g
● মল (বড় প্রাণী): 0.5-2g
● মল (মাউস): 3-5 গ্রেন
● পালমোনারি অ্যালভোলার ল্যাভেজ তরল: ফিল্টার পেপার
● যোনি সোয়াব: 5-6 সোয়াবস
● ত্বক/যৌনাঙ্গে সোয়াব/লালা/ওরাল নরম টিস্যু/ফ্যারিঞ্জিয়াল সোয়াব/রেকটাল সোয়াব: ২-৩ সোয়াবস
● পৃষ্ঠের অণুজীব: 5-6 সোয়াবস
● ওয়াটারবডি/এয়ার/বায়োফিল্ম: ফিল্টার পেপার
● এন্ডোফাইটস: 2-3 জি
● ডেন্টাল ফলক: 0.5-1g
পরিষেবা কাজের প্রবাহ
নমুনা বিতরণ
গ্রন্থাগার নির্মাণ
সিকোয়েন্সিং
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয় পরে পরিষেবা
নিম্নলিখিত বিশ্লেষণ অন্তর্ভুক্ত:
● সিকোয়েন্সিং ডেটা কোয়ালিটি কন্ট্রোল
● মেটাজেনোম অ্যাসেম্বলি এবং জিনের পূর্বাভাস
● জিন টীকা
● ট্যাক্সোনমিক আলফা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ
Punity সম্প্রদায়ের কার্যকরী বিশ্লেষণ: জৈবিক ফাংশন, বিপাকীয়, অ্যান্টিবায়োটিক প্রতিরোধের
Faceliep কার্যকরী এবং ট্যাক্সোনমিক বৈচিত্র উভয়ই বিশ্লেষণ:
বিটা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ
আন্তঃ গ্রুপ বিশ্লেষণ
পারস্পরিক সম্পর্ক বিশ্লেষণ: পরিবেশগত কারণ এবং আউট রচনা এবং বৈচিত্র্যের মধ্যে
কার্যকরী বিশ্লেষণ: কার্ড অ্যান্টিবায়োটিক প্রতিরোধের
কেজিজি বিপাকীয় পথগুলির ডিফারেনশিয়াল বিশ্লেষণ: উল্লেখযোগ্য পথগুলির হিটম্যাপ
ট্যাক্সোনমিক বিতরণের আলফা বৈচিত্র্য: এসিই সূচক
ট্যাক্সোনমিক বিতরণের বিটা বৈচিত্র্য: পিসিওএ
বিএমকেজেনের মেটাজেনোম সিকোয়েন্সিং পরিষেবাদি দ্বারা ইলুমিনার সাথে প্রকাশনাগুলির একটি সংশোধিত সংগ্রহের মাধ্যমে সহজতর অগ্রগতিগুলি অন্বেষণ করুন।
হাই, কি। এট আল। (2023) 'বিভিন্ন সংস্কৃতি জলের তাপমাত্রায় সংক্রামক হেমোটোপয়েটিক নেক্রোসিস ভাইরাসে সংক্রামিত রেইনবো ট্রাউট (অনকোরহাইঞ্চাস মাইকিস) এর অন্ত্রের বিষয়বস্তুগুলির পরিবর্তনের মেটাজেনমিক এবং বিপাকীয় বিশ্লেষণ',মাইক্রোবায়োলজিতে সীমান্ত, 14, পি। 1275649। doi: 10.3389/fmicb.2023.1275649।
মাও, সি এট আল। (2023) 'মাইক্রোবায়াল সম্প্রদায়গুলি, প্রতিরোধের জিন এবং বিভিন্ন ট্রফিক রাজ্যের নগর হ্রদে প্রতিরোধের ঝুঁকি: অভ্যন্তরীণ লিঙ্কগুলি এবং বাহ্যিক প্রভাব',বিপজ্জনক উপকরণ অগ্রিম জার্নাল, 9, পি। 100233। doi: 10.1016/j.hazadv.2023.100233।
সু, এম। এট আল। (2022) 'মেটাজেনমিক বিশ্লেষণে ভেড়া রুমেনের তরল-সম্পর্কিত এবং শক্ত-সম্পর্কিত অণুজীবের মধ্যে রচনা এবং কার্যকারিতার মধ্যে পার্থক্য প্রকাশিত হয়েছে',মাইক্রোবায়োলজিতে সীমান্ত, 13, পি। 851567। doi: 10.3389/fmicb.2022.851567।
ইয়িন, জে এট আল। (2023) 'স্থূল নিংক্সিয়াং পিগ-প্রাপ্ত মাইক্রোবায়োটা কার্নিটাইন বিপাককে পুনর্বিবেচনা করে পাতলা শূকরগুলিতে পেশী ফ্যাটি অ্যাসিড জমা দেওয়ার প্রচারের জন্য',উদ্ভাবন, 4 (5), পি। 100486। doi: 10.1016/j.xinn.2023.100486।
ঝাও, এক্স। ইত্যাদি। (2023) 'হেইহে মোহনা, চীন' এর উপরের এবং নিম্ন প্রান্তে প্রতিনিধি বায়ো/অ-সংক্রমণযোগ্য প্লাস্টিক এবং অ-প্লাস্টিক অস্তিত্বের সম্ভাব্য ঝুঁকির বিষয়ে মেটাজেনমিক অন্তর্দৃষ্টি ',মোট পরিবেশ বিজ্ঞান, 887, পি। 164026। doi: 10.1016/j.scitotenv.2023.164026।
