পণ্য

1. হিস্টোগ্রাম: প্রজাতি বিতরণ

2. কেইজিজি বিপাকীয় পথগুলিতে কার্যকরী জিনগুলি টীকা করা হয়েছে৷

3.তাপ মানচিত্র: আপেক্ষিক জিনের প্রাচুর্যের উপর ভিত্তি করে পার্থক্যমূলক ফাংশন4. CARD অ্যান্টিবায়োটিক প্রতিরোধী জিনের সার্কোস

বিএমকে কেস

মাটি-ম্যানগ্রোভ মূল ধারাবাহিকতায় অ্যান্টিবায়োটিক প্রতিরোধী জিন এবং ব্যাকটেরিয়া রোগজীবাণুর বিস্তার

প্রকাশিত:বিপজ্জনক পদার্থের জার্নাল, 2021

সিকোয়েন্সিং কৌশল:

উপাদান: ম্যানগ্রোভ মূলের চারটি খণ্ডের ডিএনএ নির্যাস: অপরিবর্তিত মাটি, রাইজোস্ফিয়ার, এপিস্ফিয়ার এবং এন্ডোস্ফিয়ার অংশগুলি
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা হাইসেক 2500
লক্ষ্য: মেটাজেনোম
16S rRNA জিন V3-V4 অঞ্চল

মূল ফলাফল

মাটি থেকে উদ্ভিদে অ্যান্টিবায়োটিক রেজিস্ট্যান্স জিন (ARGs) এর বিস্তার অধ্যয়নের জন্য ম্যানগ্রোভ চারাগুলির মাটি-মূল ধারাবাহিকতায় মেটাজেনমিক সিকোয়েন্সিং এবং মেটাবারকোডিং প্রোফাইলিং প্রক্রিয়া করা হয়েছিল।মেটাজেনোমিক ডেটা প্রকাশ করেছে যে 91.4% অ্যান্টিবায়োটিক প্রতিরোধের জিন সাধারণত উপরে উল্লিখিত চারটি মাটির অংশে চিহ্নিত করা হয়েছিল, যা একটি ধারাবাহিক ফ্যাশন দেখায়।16S rRNA অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং 29,285টি সিকোয়েন্স তৈরি করেছে, যা 346 প্রজাতির প্রতিনিধিত্ব করে।অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং দ্বারা প্রজাতির প্রোফাইলিংয়ের সাথে একত্রিত করে, এই বিস্তারটি রুট-সম্পর্কিত মাইক্রোবায়োটা থেকে স্বাধীন বলে প্রমাণিত হয়েছিল, তবে এটি জেনেটিক উপাদানগুলির মোবাইল দ্বারা সহজতর করা যেতে পারে।এই অধ্যয়নটি আন্তঃসংযুক্ত মাটি-মূল ধারাবাহিকতার মাধ্যমে মাটি থেকে উদ্ভিদে ARG এবং প্যাথোজেনগুলির প্রবাহকে চিহ্নিত করেছে।

রেফারেন্স

ওয়াং, সি. , হু, আর. , স্ট্রং, পিজে , ঝুয়াং, ডব্লিউ. , এবং শু, এল.(2020)।অ্যান্টিবায়োটিক প্রতিরোধী জিন এবং ব্যাকটেরিয়া রোগজীবাণুর বিস্তার মাটি-ম্যানগ্রোভ মূল ধারাবাহিকতা বরাবর।বিপজ্জনক পদার্থের জার্নাল, 408, 124985।