মেটাজেনোমিক্স (এনজিএস)

ইলুমিনা সহ শটগান মেটাজিনোমিক্স হলো জটিল নমুনা থেকে সরাসরি ডিএনএ সিকোয়েন্সিং করার মাধ্যমে মাইক্রোবায়োম অধ্যয়নের একটি জনপ্রিয় পদ্ধতি, যা ট্যাক্সোনমিক এবং ফাংশনাল উভয় প্রকার বৈচিত্র্য অধ্যয়নে সক্ষম করে। BMKCloud মেটাজিনোমিক (NGS) পাইপলাইনটি কোয়ালিটি কন্ট্রোল এবং মেটাজিনোম অ্যাসেম্বলি দিয়ে শুরু হয়, যেখান থেকে জিন প্রেডিক্ট করা হয় এবং একাধিক ডেটাবেস ব্যবহার করে ফাংশন ও ট্যাক্সোনমির জন্য অ্যানোটেট করা নন-রিডানড্যান্ট ডেটাসেটে ক্লাস্টার করা হয়। এই তথ্য নমুনার অভ্যন্তরীণ ট্যাক্সোনমিক বৈচিত্র্য (আলফা ডাইভারসিটি) এবং নমুনার মধ্যকার বৈচিত্র্য (বিটা ডাইভারসিটি) বিশ্লেষণ করতে ব্যবহৃত হয়। গ্রুপগুলোর মধ্যে ডিফারেনশিয়াল অ্যানালাইসিস প্যারামেট্রিক এবং নন-প্যারামেট্রিক উভয় পরীক্ষা ব্যবহার করে দুটি গ্রুপের মধ্যে ভিন্ন OTU এবং জৈবিক ফাংশনগুলো খুঁজে বের করে, অন্যদিকে কোরিলেশন অ্যানালাইসিস এই পার্থক্যগুলোকে পরিবেশগত কারণগুলোর সাথে সম্পর্কিত করে।