-
জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন বিশ্লেষণ
জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডি (জিডব্লিউএএস) নির্দিষ্ট বৈশিষ্ট্য (ফেনোটাইপ) এর সাথে সম্পর্কিত জেনেটিক বৈকল্পিক (জিনোটাইপ) সনাক্ত করা লক্ষ্য করে।জিডব্লিউএএস অধ্যয়ন জেনেটিক মার্কারগুলি বিপুল সংখ্যক ব্যক্তির পুরো জিনোম অতিক্রম করে এবং জনসংখ্যার স্তরে পরিসংখ্যানগত বিশ্লেষণের মাধ্যমে জিনোটাইপ-ফেনোটাইপ অ্যাসোসিয়েশনগুলির পূর্বাভাস দেয়।এটি মানুষের রোগ এবং প্রাণী বা উদ্ভিদের জটিল বৈশিষ্ট্যের উপর কার্যকরী জিন খনির গবেষণায় ব্যাপকভাবে প্রয়োগ করা হয়েছে।
-
একক- নিউক্লিয়াস আরএনএ সিকোয়েন্সিং
উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিংয়ের সাথে একক কোষ ক্যাপচারিং এবং পৃথক লাইব্রেরি নির্মাণের কৌশলের অগ্রগতি কোষ-বাই-কোষ ভিত্তিতে জিনের অভিব্যক্তি অধ্যয়নের অনুমতি দেয়।এটি জটিল কোষের জনসংখ্যার উপর একটি গভীর এবং সম্পূর্ণ সিস্টেম বিশ্লেষণ সক্ষম করে, যেখানে এটি সমস্ত কোষের গড় নিয়ে তাদের বৈচিত্র্যের মুখোশ এড়ায়।
যাইহোক, কিছু কোষ একক-কোষ সাসপেনশনে তৈরি করার জন্য উপযুক্ত নয়, তাই অন্যান্য নমুনা তৈরির পদ্ধতি - টিস্যু থেকে নিউক্লিয়াস নিষ্কাশন প্রয়োজন, অর্থাৎ, নিউক্লিয়াস সরাসরি টিস্যু বা কোষ থেকে বের করা হয় এবং একক-নিউক্লিয়াস সাসপেনশনে প্রস্তুত করা হয়। সেল সিকোয়েন্সিং।
BMK 10× Genomics ChromiumTM ভিত্তিক একক-কোষ RNA সিকোয়েন্সিং পরিষেবা প্রদান করে।এই পরিষেবাটি রোগ সম্পর্কিত গবেষণায় ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়েছে, যেমন ইমিউন কোষের পার্থক্য, টিউমারের ভিন্নতা, টিস্যু বিকাশ ইত্যাদি।
স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোম চিপ: 10× জিনোমিক্স
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্ম
-
উদ্ভিদ/প্রাণী পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং
সম্পূর্ণ জিনোম রি-সিকোয়েন্সিং, যা WGS নামেও পরিচিত, সিঙ্গেল নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম (SNP), সন্নিবেশ মুছে ফেলা (InDel), স্ট্রাকচার ভ্যারিয়েশন (SV), এবং কপি নম্বর ভেরিয়েশন (CNV) সহ সমগ্র জিনোমে সাধারণ এবং বিরল উভয় মিউটেশন প্রকাশ করতে সক্ষম করে। )SVs SNPs-এর তুলনায় ভিন্নতার ভিত্তির একটি বৃহত্তর অংশ তৈরি করে এবং জিনোমের উপর বেশি প্রভাব ফেলে, যা জীবন্ত প্রাণীর উপর উল্লেখযোগ্য প্রভাব ফেলে।দীর্ঘ-পড়া রিকোয়েন্সিং বড় টুকরো এবং জটিল বৈচিত্রগুলির আরও সুনির্দিষ্ট সনাক্তকরণের অনুমতি দেয় কারণ দীর্ঘ পঠনগুলি জটিল অঞ্চলগুলি যেমন ট্যান্ডেম পুনরাবৃত্তি, GC/AT-সমৃদ্ধ অঞ্চল এবং হাইপার-ভেরিয়েবল অঞ্চলগুলির উপর ক্রোমোসোমাল অতিক্রম করাকে আরও সহজ করে তোলে।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা, প্যাকবিও, ন্যানোপুর
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
কোষের স্থানিক সংগঠন বিভিন্ন জৈবিক প্রক্রিয়ায় গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে, যেমন অনাক্রম্য অনুপ্রবেশ, ভ্রূণের বিকাশ ইত্যাদি। স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং, যা স্থানিক অবস্থানের তথ্য ধরে রাখার সময় জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইলিং নির্দেশ করে, ট্রান্সক্রিপ্টোম-স্তরের টিস্যু আর্কিটেকচারে দুর্দান্ত অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করেছে।প্রযুক্তির বিকাশের সাথে, অতি-স্বচ্ছ টিস্যু আকারবিদ্যা এবং স্থানিক আণবিক অভিব্যক্তির প্রকৃত কাঠামোগত পার্থক্য উচ্চ রেজোলিউশনের সাথে অধ্যয়ন করা দরকার।BMKGENE নমুনা থেকে জৈবিক অন্তর্দৃষ্টি পর্যন্ত ব্যাপক, এক-স্টপ স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং পরিষেবা প্রদান করে।
স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স প্রযুক্তি বৈচিত্র্যময় নমুনাগুলিতে স্থানিক বিষয়বস্তুর সাথে জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইলের সমাধান করে বিভিন্ন গবেষণার ক্ষেত্রে অভিনব দৃষ্টিভঙ্গিকে শক্তিশালী করেছে।
স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোম চিপ: BMKMANU S1000
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্ম
-
10x জিনোমিক্স ভিজিয়াম স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোম
ভিজিয়াম স্পেশিয়াল জিন এক্সপ্রেশন হল একটি মূলধারার স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি যা মোট এমআরএনএর উপর ভিত্তি করে টিস্যুকে শ্রেণীবদ্ধ করার জন্য।স্বাভাবিক বিকাশ, রোগের প্যাথলজি এবং ক্লিনিকাল অনুবাদমূলক গবেষণার অভিনব অন্তর্দৃষ্টি আবিষ্কার করতে রূপগত প্রসঙ্গ সহ পুরো ট্রান্সক্রিপ্টোমটি ম্যাপ করুন।BMKGENE নমুনা থেকে জৈবিক অন্তর্দৃষ্টি পর্যন্ত ব্যাপক, এক-স্টপ স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং পরিষেবা প্রদান করে।
স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স প্রযুক্তি ভিন্ন ভিন্ন নমুনাগুলিতে স্থানিক বিষয়বস্তুর সাথে জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইলের সমাধান করে বিভিন্ন গবেষণার ক্ষেত্রে অভিনব দৃষ্টিভঙ্গিকে শক্তিশালী করেছে.
স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোম চিপ: 10x জিনোমিক্স ভিজিয়াম
প্ল্যাটফর্ম:ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্ম
-
পূর্ণ-দৈর্ঘ্য mRNA সিকোয়েন্সিং-ন্যানোপোর
RNA সিকোয়েন্সিং ব্যাপক ট্রান্সক্রিপ্টোম বিশ্লেষণের জন্য একটি অমূল্য হাতিয়ার হয়েছে।নিঃসন্দেহে, ঐতিহ্যগত শর্ট-রিড সিকোয়েন্সিং এখানে অনেক গুরুত্বপূর্ণ উন্নয়ন অর্জন করেছে।তা সত্ত্বেও, এটি প্রায়শই পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের আইসোফর্ম সনাক্তকরণ, পরিমাণ নির্ধারণ, পিসিআর পক্ষপাতের সীমাবদ্ধতার সম্মুখীন হয়।
ন্যানোপোর সিকোয়েন্সিং নিজেকে অন্যান্য সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্ম থেকে আলাদা করে, যাতে নিউক্লিওটাইডগুলি ডিএনএ সংশ্লেষণ ছাড়াই সরাসরি পড়া হয় এবং দশ হাজার কিলোবেসে দীর্ঘ পঠিত হয়।এটি পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের ট্রান্সক্রিপ্ট ক্রসিং এবং আইসোফর্ম-স্তরের অধ্যয়নের চ্যালেঞ্জগুলি মোকাবেলা করার জন্য সরাসরি পাঠ-আউট করার ক্ষমতা দেয়।
প্ল্যাটফর্ম：ন্যানোপুর প্রমিথিওন
লাইব্রেরি:সিডিএনএ-পিসিআর
-
পূর্ণ-দৈর্ঘ্য mRNA সিকোয়েন্সিং -PacBio
নতুনপূর্ণ-দৈর্ঘ্যের ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং, নামেও পরিচিতনতুনIso-Seq পঠিত দৈর্ঘ্যে PacBio সিকোয়েন্সারের সুবিধা গ্রহণ করে, যা কোনো বিরতি ছাড়াই পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের সিডিএনএ অণুগুলির সিকোয়েন্সিং সক্ষম করে।এটি সম্পূর্ণরূপে ট্রান্সক্রিপ্ট সমাবেশ ধাপে উত্পন্ন কোনো ত্রুটি এড়ায় এবং আইসোফর্ম-স্তরের রেজোলিউশনের সাথে ইউনিজিন সেট তৈরি করে।এই ইউনিজিন সেটগুলি ট্রান্সক্রিপ্টোম স্তরে "রেফারেন্স জিনোম" হিসাবে শক্তিশালী জেনেটিক তথ্য সরবরাহ করে।উপরন্তু, পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং ডেটার সাথে একত্রিত করে, এই পরিষেবাটি আইসোফর্ম-স্তরের অভিব্যক্তির সঠিক পরিমাণ নির্ধারণের ক্ষমতা দেয়।
প্ল্যাটফর্ম: PacBio সিক্যুয়েল IIলাইব্রেরি: SMRT বেল লাইব্রেরি -
ইউক্যারিওটিক এমআরএনএ সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
mRNA সিকোয়েন্সিং নির্দিষ্ট অবস্থার অধীনে কোষ থেকে ট্রান্সক্রিপ্ট করা সমস্ত mRNA এর প্রোফাইলিং সক্ষম করে।এটি জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইল, জিনের গঠন এবং নির্দিষ্ট জৈবিক প্রক্রিয়ার আণবিক প্রক্রিয়া প্রকাশ করার জন্য একটি শক্তিশালী প্রযুক্তি।আজ অবধি, mRNA সিকোয়েন্সিং মৌলিক গবেষণা, ক্লিনিকাল ডায়াগনস্টিকস, ড্রাগ ডেভেলপমেন্ট ইত্যাদিতে ব্যাপকভাবে নিযুক্ত করা হয়েছে।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্ম
-
নন-রেফারেন্স ভিত্তিক mRNA সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
এমআরএনএ সিকোয়েন্সিং নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং টেকনিক (এনজিএস) গ্রহণ করে মেসেঞ্জার আরএনএ(এমআরএনএ) ফর্ম ইউক্যারিওটকে নির্দিষ্ট সময়ে ক্যাপচার করতে যা কিছু বিশেষ ফাংশন সক্রিয় হয়।বিভক্ত করা দীর্ঘতম প্রতিলিপিটিকে 'ইউনিজিন' বলা হত এবং পরবর্তী বিশ্লেষণের জন্য রেফারেন্স ক্রম হিসাবে ব্যবহৃত হয়, যা রেফারেন্স ছাড়াই প্রজাতির আণবিক প্রক্রিয়া এবং নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্ক অধ্যয়নের একটি কার্যকর উপায়।
ট্রান্সক্রিপ্টোম ডেটা অ্যাসেম্বলি এবং ইউনিজিন ফাংশনাল অ্যানোটেশনের পরে
(1) এসএসআর বিশ্লেষণ, সিডিএস ভবিষ্যদ্বাণী এবং জিন গঠন প্রিফর্ম করা হবে।
(2) প্রতিটি নমুনায় ইউনিজিন এক্সপ্রেশনের পরিমাণ নির্ধারণ করা হবে।
(3) নমুনার (বা গোষ্ঠী) মধ্যে ভিন্নভাবে প্রকাশিত ইউনিজিনগুলি ইউনিজিন অভিব্যক্তির উপর ভিত্তি করে আবিষ্কৃত হবে
(4) পৃথকভাবে প্রকাশিত ইউনিজিনগুলির ক্লাস্টারিং, কার্যকরী টীকা এবং সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ করা হবে
-
লং নন-কোডিং সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
লং নন-কোডিং RNAs (lncRNAs) হল এক ধরনের RNA অণু যার দৈর্ঘ্য 200 nt-এর বেশি, যেগুলি অত্যন্ত কম কোডিং সম্ভাবনার দ্বারা চিহ্নিত করা হয়।LncRNA, নন-কোডিং RNA-তে একটি মূল সদস্য হিসাবে, প্রধানত নিউক্লিয়াস এবং প্লাজমাতে পাওয়া যায়।সিকোয়েন্সিং টেকনোলজি এবং জৈব ইনফরমটিক্সের বিকাশ অসংখ্য নভেল lncRNA এর সনাক্তকরণ এবং জৈবিক ফাংশনগুলির সাথে যুক্ত করতে সক্ষম করে।সঞ্চিত প্রমাণগুলি পরামর্শ দেয় যে lncRNA ব্যাপকভাবে এপিজেনেটিক রেগুলেশন, ট্রান্সক্রিপশন রেগুলেশন এবং পোস্ট-ট্রান্সক্রিপশন রেগুলেশনের সাথে জড়িত।
-
ছোট আরএনএ সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
ছোট আরএনএ বলতে বোঝায় নন-কোডিং আরএনএ অণুর একটি শ্রেণী যা সাধারণত 200nt এর কম দৈর্ঘ্যের হয়, যার মধ্যে রয়েছে মাইক্রো RNA (miRNA), ছোট হস্তক্ষেপ RNA (siRNA), এবং piwi-interacting RNA (piRNA)।
মাইক্রোআরএনএ (এমআইআরএনএ) হল অন্তঃসত্ত্বা ছোট আরএনএর একটি শ্রেণী যার দৈর্ঘ্য প্রায় 20-24nt, যা কোষে বিভিন্ন গুরুত্বপূর্ণ নিয়ন্ত্রক ভূমিকা পালন করে।miRNA অনেক জীবন প্রক্রিয়ার সাথে জড়িত যা টিস্যু প্রকাশ করে - নির্দিষ্ট এবং পর্যায় - নির্দিষ্ট অভিব্যক্তি এবং বিভিন্ন প্রজাতিতে অত্যন্ত সংরক্ষিত।
-
সার্কআরএনএ সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
CircRNAs (বৃত্তাকার RNAs) হল এক শ্রেণীর নন-কোডিং আরএনএ অণু যা 5′ এন্ড ক্যাপ এবং 3′ শেষ পলি(A) লেজের ছোট।সার্কআরএনএ সমযোজী বন্ধন দ্বারা বৃত্তাকার কাঠামো সম্পাদন করে যা আরএনএ এক্সোনুক্লিজ হজমের বিরুদ্ধে অবস্থান।circRNA জীবের বৃদ্ধি ও বিকাশ এবং বাহ্যিক পরিবেশের প্রতি তাদের প্রতিরোধে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে।
সার্কআরএনএ-এর অনেকগুলি ফাংশন রয়েছে, যা প্রতিযোগিতামূলকভাবে miRNA-কে আবদ্ধ করতে পারে, জিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করতে ceRNA-এর নিয়ন্ত্রক ফাংশন প্রয়োগ করতে পারে।সাম্প্রতিক বছরগুলিতে, এটিও পাওয়া গেছে যে এটি রোগের সংঘটন এবং বিকাশের সাথে ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত, এবং রোগ নির্ণয়ের চিহ্নিতকারীর দিক থেকে এর প্রয়োগের দুর্দান্ত সম্ভাবনা রয়েছে।
