মেটাট্রান্সক্রিপটোম সিকোয়েন্সিং
পরিষেবার বৈশিষ্ট্য
● rRNA অপসারণের পর নির্দেশিত mRNA লাইব্রেরি প্রস্তুতকরণ।
● ইলুমিনা নোভা সিক (Illumina NovaSeq)-এ সিকোয়েন্সিং।
পরিষেবার সুবিধা
●জটিল অণুজীব সম্প্রদায়ের পরিবর্তনসমূহ অধ্যয়ন করুন:এটি ট্রান্সক্রিপশনাল পর্যায়ে ঘটে এবং সম্ভাব্য নতুন জিন অন্বেষণ করে।
●পোষক বা পরিবেশের সাথে অণুজীব সম্প্রদায়ের মিথস্ক্রিয়া ব্যাখ্যা করা
●ব্যাপক বায়োইনফরমেটিক বিশ্লেষণএটি কমিউনিটির শ্রেণিবিন্যাসগত ও কার্যগত গঠন এবং সেইসাথে ডিফারেনশিয়াল জিন এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ সম্পর্কে অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে।
●বিস্তৃত জিন টীকা:অণুজীব সম্প্রদায়ের তথ্যপূর্ণ জিন অভিব্যক্তি তথ্যের জন্য হালনাগাদ জিন কার্যকারিতা ডেটাবেস ব্যবহার করা।
●বিক্রয়োত্তর সহায়তা:প্রকল্প সমাপ্তির পরেও আমাদের দায়বদ্ধতা ৩ মাসের বিক্রয়োত্তর সেবার মাধ্যমে অব্যাহত থাকে। এই সময়ে, আমরা প্রকল্পের ফলো-আপ, সমস্যা সমাধানে সহায়তা এবং ফলাফল সম্পর্কিত যেকোনো জিজ্ঞাসার সমাধানের জন্য প্রশ্নোত্তর পর্বের আয়োজন করে থাকি।
পরিষেবার স্পেসিফিকেশন
| সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্ম | ক্রমবিন্যাস কৌশল | ডেটা সুপারিশ করা হয়েছে | ডেটা গুণমান নিয়ন্ত্রণ |
| ইলুমিনা নোভাসিক | PE150 | ১২ জিবি | Q30≥85% |
নমুনা প্রয়োজনীয়তা
| ঘনত্ব (ng/µL) | মোট পরিমাণ (µg) | আয়তন (µL) | ওডি২৬০/২৮০ | ওডি২৬০/২৩০ | রিন |
| ≥৫০ | ≥১.০ | ≥২০ | ১.৮-২.০ | ১.০-২.৫ | ≥৬.৫ |
পরিষেবা কার্যপ্রবাহ
নমুনা সরবরাহ
গ্রন্থাগার নির্মাণ
ক্রমবিন্যাস
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয়োত্তর সেবা
নিম্নলিখিত বিশ্লেষণ অন্তর্ভুক্ত:
● সিকোয়েন্সিং ডেটার গুণমান নিয়ন্ত্রণ
● প্রতিলিপি সমাবেশ
● শ্রেণিবিন্যাসগত টীকা এবং প্রাচুর্য
● কার্যকরী টীকা এবং প্রাচুর্য
● এক্সপ্রেশন কোয়ান্টিমিনেশন এবং ডিফারেনশিয়াল অ্যানালাইসিস
প্রতিটি নমুনার শ্রেণিবিন্যাসগত বন্টন:
বিটা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ: UPGMA
কার্যকরী টীকা – GO প্রাচুর্য
ডিফারেনশিয়াল ট্যাক্সোনমি অ্যাবানডেন্স – LEFSE
নির্বাচিত প্রকাশনা সংকলনের মাধ্যমে BMKGene-এর মেটা ট্রান্সক্রিপ্টোমিক্স সিকোয়েন্সিং পরিষেবার দ্বারা সাধিত অগ্রগতিগুলো অন্বেষণ করুন।
লু, জেড. এট আল. (২০২৩) 'ব্যাকটেরয়েডালিস বর্গের ল্যাকটেট-ব্যবহারকারী ব্যাকটেরিয়ার অম্ল সহনশীলতা, উচ্চ-ঘনত্বের খাদ্যে অভ্যস্ত ছাগলের রুমিনাল অ্যাসিডোসিস প্রতিরোধে অবদান রাখে',পশু পুষ্টি, 14, পৃ. 130-140। doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
সং, জেড. প্রমুখ (২০১৭) 'হাই-থ্রুপুট অ্যামপলিকন এবং মেটাট্রান্সক্রিপটোমিক্স সিকোয়েন্সিং দ্বারা ঐতিহ্যবাহী সলিড-স্টেট ফারমেন্টেশনে মূল কার্যকরী মাইক্রোবায়োটার রহস্য উন্মোচন',মাইক্রোবায়োলজিতে ফ্রন্টিয়ার্স, ৮(জুলাই)। doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
ওয়াং, ডব্লিউ. এট আল. (২০২২) 'উদ্ভিদ রোগ সৃষ্টিকারী অল্টারনারিয়া ছত্রাকের মেটাট্রান্সক্রিপটোমিক্স সমীক্ষা থেকে আবিষ্কৃত নতুন মাইকোভাইরাস',ভাইরাস, 14(11), পৃ. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
ওয়েই, জে. এট আল. (২০২২) 'সমান্তরাল মেটাট্রান্সক্রিপটোম বিশ্লেষণ বিটল এবং তাদের অন্ত্রের সহজীবীদের দ্বারা উদ্ভিদের গৌণ বিপাকের অবক্ষয় প্রকাশ করে',আণবিক বাস্তুবিদ্যা, 31(15), পৃ. 3999–4016। doi: 10.1111/MEC.16557।
