Productes

Prenent les dades de seqüenciació d'isoformes de Pacific Biosciences (PacBio) com a entrada, aquesta aplicació és capaç d'identificar seqüències de transcripció de llarga durada (sense muntatge).Mitjançant el mapeig de seqüències de longitud completa contra el genoma de referència, les transcripcions es poden optimitzar mitjançant gens coneguts, transcripcions, regions codificants, etc. En aquest cas, es pot aconseguir una identificació més precisa de les estructures d'ARNm, com ara splicing alternatiu, etc.L'anàlisi conjunta amb les dades de seqüenciació del transcriptoma NGS permet una anotació més completa i una quantificació més precisa de l'expressió a nivell de transcripció, cosa que beneficia en gran mesura l'expressió diferencial i l'anàlisi funcional aigües avall.