Produkty

Wykorzystując dane sekwencjonowania izoform Pacific Biosciences (PacBio) jako dane wejściowe, ta aplikacja jest w stanie zidentyfikować sekwencje transkryptów pełnej długości (bez montażu). Mapowanie sekwencji pełnej długości na genom referencyjny umożliwia optymalizację transkryptów pod kątem znanych genów, transkryptów, regionów kodujących itp. W ten sposób można uzyskać dokładniejszą identyfikację struktur mRNA, takich jak alternatywny splicing itp. Łączna analiza z danymi sekwencjonowania transkryptomu NGS umożliwia bardziej kompleksową adnotację i dokładniejszą kwantyfikację ekspresji na poziomie transkryptu, co w znacznym stopniu przyczynia się do dalszej analizy ekspresji różnicowej i analizy funkcjonalnej.