Produkti

Izmantojot Pacific Biosciences (PacBio) izoformu sekvencēšanas datus kā ievadi, šī lietotne spēj identificēt pilna garuma transkriptu sekvences (bez montāžas). Kartējot pilna garuma sekvences pret atsauces genomu, transkriptus var optimizēt, izmantojot zināmus gēnus, transkriptus, kodējošos reģionus utt. Šajā gadījumā var panākt precīzāku mRNS struktūru identificēšanu, piemēram, alternatīvu splicēšanu utt. Kopīga analīze ar NGS transkriptomu sekvencēšanas datiem nodrošina visaptverošāku anotāciju un precīzāku kvantitatīvu noteikšanu ekspresijā transkripta līmenī, kas lielā mērā dod labumu diferenciālās ekspresijas un funkcionālās analīzes lejupējai analīzei.