ARN petit

Els ARN petits són ARN curts no codificants amb una longitud mitjana de 18-30 nt, incloent-hi miRNA, siRNA i piRNA, que tenen un paper important en els processos reguladors. El pipeline de sRNA de BMKCloud proporciona anàlisis estàndard i personalitzades per a la identificació de miRNA. Després del retall de lectures i el control de qualitat, les lectures s'alineen amb múltiples bases de dades per classificar els sRNA i seleccionar miRNA i es mapen al genoma de referència. Els miRNA s'identifiquen a partir de bases de dades de miRNA conegudes, proporcionant informació sobre l'estructura secundària, la família de miRNA i els gens diana. L'anàlisi d'expressió diferencial identifica miRNA expressats diferencialment i els gens diana corresponents s'anoten funcionalment per trobar categories enriquides.