L'estudi d'associació a tot el genoma (GWAS) té com a objectiu identificar variants genètiques (genotip) que s'associen a trets específics (fenotip).Els estudis de GWA investiguen marcadors genètics que creuen el genoma sencer d'un gran nombre d'individus i prediuen associacions genotip-fenotip mitjançant anàlisis estadístiques a nivell de població.La reseqüenciació del genoma sencer pot descobrir potencialment totes les variants genètiques.Juntament amb les dades fenotípiques, el GWAS es pot processar per identificar SNP, QTL i gens candidats relacionats amb el fenotip, que recolza fortament la millora moderna d'animals/plantes.SLAF és una estratègia de seqüenciació del genoma simplificada desenvolupada per si mateix, que descobreix marcadors distribuïts a tot el genoma, SNP.Aquests SNP, com a marcadors genètics moleculars, es poden processar per a estudis d'associació amb trets dirigits.És una estratègia rendible per identificar trets complexos associades a variacions genètiques.
