Metagenòmica (NGS)

La metagenòmica d’escopeta amb Illumina és una eina popular per estudiar microbiomes mitjançant la seqüenciació directa de l’ADN de mostres complexes, permetent l’estudi de la diversitat taxonòmica i funcional. El gasoducte Metagenòmic (NGS) BMKCLOUD comença amb el control de qualitat i el muntatge de metagenoma, a partir dels quals es preveuen els gens i s’agrupen en conjunts de dades no redundants que s’anoten per a la funció i el taxonomia mitjançant múltiples bases de dades. Aquesta informació s’utilitza per analitzar la diversitat taxonòmica dins de la mostra (diversitat alfa) i la diversitat entre mostres (diversitat beta). L’anàlisi diferencial entre grups troba les funcions OTU i les funcions biològiques que difereixen entre els dos grups mitjançant proves paramètriques i no paramètriques, mentre que l’anàlisi de correlació relaciona aquestes diferències amb els factors ambientals.