แอปพลิเคชันนี้ใช้ข้อมูลการจัดลำดับไอโซฟอร์มของ Pacific Biosciences (PacBio) เป็นอินพุต เพื่อระบุลำดับทรานสคริปต์แบบเต็มความยาว (โดยไม่ต้องประกอบ) โดยการแมปข้อมูลลำดับแบบเต็มความยาวกับจีโนมอ้างอิง ทรานสคริปต์สามารถปรับให้เหมาะสมโดยใช้ยีน ทรานสคริปต์ บริเวณการเข้ารหัส ฯลฯ ที่รู้จัก ในกรณีนี้ จะสามารถระบุโครงสร้าง mRNA ได้แม่นยำยิ่งขึ้น เช่น การตัดต่อทางเลือก ฯลฯ การวิเคราะห์ร่วมกับข้อมูลการจัดลำดับทรานสคริปต์แบบ NGS ช่วยให้การระบุรายละเอียดที่ครอบคลุมมากขึ้นและการวัดปริมาณการแสดงออกในระดับทรานสคริปต์แม่นยำยิ่งขึ้น ซึ่งเป็นประโยชน์อย่างมากต่อการวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างกันและการวิเคราะห์การทำงานในขั้นตอนต่อไป
ชีวสารสนเทศ
+49 (0) 25153893975
0086-400-600-3186
info@bmkgene.com