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Tomando como entrada los datos de secuenciación de isoformas de Pacific Biosciences (PacBio), esta aplicación puede identificar secuencias de transcripción completas (sin ensamblaje).Al mapear secuencias de longitud completa con respecto al genoma de referencia, las transcripciones se pueden optimizar mediante genes, transcripciones, regiones codificantes, etc. conocidos. En este caso, se puede lograr una identificación más precisa de las estructuras del ARNm, como el empalme alternativo, etc.El análisis conjunto con datos de secuenciación del transcriptoma NGS permite una anotación más completa y una cuantificación más precisa en la expresión a nivel de transcripción, lo que beneficia en gran medida la expresión diferencial y el análisis funcional posteriores.