ਖ਼ਬਰਾਂ

ਟਰਾਂਸਪੋਸੇਬਲ ਐਲੀਮੈਂਟ (TE) ਐਂਪਲੀਫਿਕੇਸ਼ਨ ਨੂੰ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਆਕਾਰ ਦੇ ਵਿਸਥਾਰ ਅਤੇ ਵਿਕਾਸ ਵਿੱਚ ਵਿਚੋਲਗੀ ਕਰਨ ਵਾਲੀ ਇੱਕ ਡ੍ਰਾਇਵਿੰਗ ਫੋਰਸ ਵਜੋਂ ਮਾਨਤਾ ਦਿੱਤੀ ਗਈ ਹੈ, ਪਰ ਪੌਦਿਆਂ ਵਿੱਚ 3D ਜੀਨੋਮਿਕ ਆਰਕੀਟੈਕਚਰ ਨੂੰ ਆਕਾਰ ਦੇਣ ਦੇ ਨਤੀਜੇ ਕਾਫ਼ੀ ਹੱਦ ਤੱਕ ਅਣਜਾਣ ਰਹਿੰਦੇ ਹਨ।ਇੱਥੇ, ਅਸੀਂ ਕਪਾਹ ਦੀਆਂ ਤਿੰਨ ਕਿਸਮਾਂ ਲਈ ਸੰਦਰਭ-ਗਰੇਡ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀਆਂ ਦੀ ਰਿਪੋਰਟ ਕਰਦੇ ਹਾਂ ਜੋ ਜੀਨੋਮ ਆਕਾਰ ਵਿੱਚ ਤਿੰਨ ਗੁਣਾ ਹਨ, ਅਰਥਾਤਗੌਸੀਪੀਅਮ ਰੋਟੁੰਡੀਫੋਲੀਅਮ(K2),ਜੀ. ਆਰਬੋਰੀਅਮ(A2), ਅਤੇਜੀ. ਰਾਇਮੰਡੀ(D5), ਆਕਸਫੋਰਡ ਨੈਨੋਪੋਰ ਟੈਕਨਾਲੋਜੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ।ਤੁਲਨਾਤਮਕ ਜੀਨੋਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵੱਡੇ ਜੀਨੋਮ ਆਕਾਰ ਦੇ ਅੰਤਰਾਂ (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb) ਵਿੱਚ ਯੋਗਦਾਨ ਪਾਉਣ ਵਾਲੇ ਵੰਸ਼-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ TE ਐਂਪਲੀਫਿਕੇਸ਼ਨ ਦੇ ਵੇਰਵਿਆਂ ਦਾ ਦਸਤਾਵੇਜ਼ੀਕਰਨ ਕਰਦੇ ਹਨ, ਅਤੇ ਜੀਨੋਮ ਵਿੱਚ ਮੁਕਾਬਲਤਨ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਜੀਨ ਸਮੱਗਰੀ ਅਤੇ ਸਿੰਟੇਨੀ ਸਬੰਧਾਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ।ਅਸੀਂ ਪਾਇਆ ਕਿ ਲਗਭਗ 17% ਸਿੰਟੇਨਿਕ ਜੀਨ ਕਿਰਿਆਸ਼ੀਲ ("ਏ") ਅਤੇ ਅਕਿਰਿਆਸ਼ੀਲ ("ਬੀ") ਕੰਪਾਰਟਮੈਂਟਾਂ ਵਿਚਕਾਰ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਸਥਿਤੀ ਤਬਦੀਲੀ ਨੂੰ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਿਤ ਕਰਦੇ ਹਨ, ਅਤੇ TE ਪ੍ਰਸਾਰਣ ਜੀਨ ਖੇਤਰਾਂ (~ 7,000 ਜੀਨਾਂ) ਵਿੱਚ ਏ ਕੰਪਾਰਟਮੈਂਟ ਦੇ ਅਨੁਪਾਤ ਦੇ ਵਾਧੇ ਨਾਲ ਜੁੜਿਆ ਹੋਇਆ ਸੀ। ) D5 ਦੇ ਮੁਕਾਬਲੇ K2 ਅਤੇ A2 ਵਿੱਚ।ਤਿੰਨ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਸਿਰਫ 42% ਟੌਪੋਲੋਜੀਲੀ ਐਸੋਸੀਏਟਿੰਗ ਡੋਮੇਨ (TAD) ਸੀਮਾਵਾਂ ਨੂੰ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਰੱਖਿਆ ਗਿਆ ਸੀ।ਸਾਡਾ ਡੇਟਾ ਵੰਸ਼-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ TAD ਸੀਮਾਵਾਂ ਦੇ ਗਠਨ ਤੋਂ ਬਾਅਦ TEs ਦੇ ਹਾਲ ਹੀ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਸਾਰਣ ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਦਾ ਹੈ।ਇਹ ਅਧਿਐਨ ਪੌਦਿਆਂ ਵਿੱਚ ਉੱਚ-ਕ੍ਰਮ ਦੇ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਢਾਂਚੇ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਵਿੱਚ ਟ੍ਰਾਂਸਪੋਸਨ-ਵਿਚੋਲੇ ਵਾਲੇ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਵਿਸਥਾਰ ਦੀ ਭੂਮਿਕਾ 'ਤੇ ਰੌਸ਼ਨੀ ਪਾਉਂਦਾ ਹੈ।