Tala Fou

Transposable element (TE) amplification ua fa'ailoaina ose malosi fa'atosina e fa'asalalau le fa'alauteleina o le genome ma le evolusione, ae o taunu'uga mo le fa'atulagaina o le fa'ata'ita'iga 3D genomic e tumau pea ona le iloa i totonu o la'au.O iinei, matou te lipoti atu ai faʻasalalauga genome assemblies mo ituaiga e tolu o le cotton e faʻatolu le tele o le genome, e taʻua.Gossypium rotundifolium(K2),G. arboreum(A2), maG. raimondii(D5), faʻaaogaina Oxford Nanopore Technologies.O su'esu'ega fa'atusatusaga fa'atusa e fa'amauina ai fa'amatalaga o le fa'atuputeleina o le TE fa'atatau i le gafa e mafua ai le tele o eseesega o le genome (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb), ma fa'ailoa mai ai le fa'asaoina o mea tau kenera ma feso'ota'iga synteny i va o genome.Na matou iloa e tusa ma le 17% o kenera syntenic o loʻo faʻaalia le suiga o le tulaga o le chromatin i le va o vaega galue ("A") ma le le toaga ("B"), ma le faʻalauteleina o le TE na fesoʻotaʻi ma le faʻateleina o le vaega o A i vaega o kene (~ 7,000 genes. ) ile K2 ma le A2 fa'atatau ile D5.Na'o le 42% o tuaoi fa'afeso'ota'i i luga ole laiga (TAD) na fa'asaoina ile tolu genomes.O a matou fa'amaumauga o lo'o a'afia ai le fa'alauteleina lata mai o TE i le mae'a ai o le fa'atulagaina o tua'oi TAD fa'apitoa.O lenei suʻesuʻega e faʻamalamalamaina ai le matafaioi o le transposon-mediated genome faʻalauteleina i le atinaʻeina o le maualuga o le chromatin fausaga i totonu o laʻau.