ຂ່າວ

ການຂະຫຍາຍອົງປະກອບ Transposable (TE) ໄດ້ຖືກຮັບຮູ້ວ່າເປັນຕົວຊ່ວຍໄກ່ເກ່ຍການຂະຫຍາຍຂະໜາດຂອງ genome ແລະວິວັດທະນາການ, ແຕ່ຜົນສະທ້ອນຂອງການສ້າງສະຖາປັດຕະຍະກຳ genomic 3D ຍັງບໍ່ຮູ້ຈັກຫຼາຍໃນພືດ.ທີ່ນີ້, ພວກເຮົາລາຍງານການປະກອບພັນທຸກໍາລະດັບການອ້າງອິງສໍາລັບສາມຊະນິດຂອງຝ້າຍທີ່ມີຂະຫນາດສາມເທົ່າ, ຄື.Gossypium rotundifolium(K2),G. ສວນສັດ(A2), ແລະG. raimondii(D5), ການນໍາໃຊ້ Oxford Nanopore Technologies.ການວິເຄາະ genome ປຽບທຽບເອກະສານລາຍລະອຽດຂອງການຂະຫຍາຍພັນທຸກໍາຂອງ TE ທີ່ປະກອບສ່ວນເຂົ້າໃນຄວາມແຕກຕ່າງຂອງຂະຫນາດ genome ຂະຫນາດໃຫຍ່ (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb), ແລະຊີ້ບອກເຖິງເນື້ອໃນຂອງ gene ທີ່ຖືກອະນຸລັກແລະຄວາມສໍາພັນ synteny ລະຫວ່າງ genomes.ພວກເຮົາພົບວ່າປະມານ 17% ຂອງ genes syntenic ສະແດງໃຫ້ເຫັນການປ່ຽນແປງສະຖານະ chromatin ລະຫວ່າງ active (“A”) ແລະ inactive (“B”) compartments, ແລະການຂະຫຍາຍ TE ແມ່ນກ່ຽວຂ້ອງກັບການເພີ່ມຂື້ນຂອງອັດຕາສ່ວນຂອງ A compartment ໃນເຂດ gene (~ 7,000 genes. ) ໃນ K2 ແລະ A2 ທຽບກັບ D5.ພຽງແຕ່ 42% ຂອງເຂດແດນທີ່ເຊື່ອມໂຍງທາງດ້ານ topologically (TAD) ໄດ້ຖືກອະນຸລັກໃນບັນດາສາມ genomes.ຂໍ້​ມູນ​ຂອງ​ພວກ​ເຮົາ​ກ່ຽວ​ຂ້ອງ​ກັບ​ການ​ຂະ​ຫຍາຍ​ຕົວ​ໃນ​ໄລ​ຍະ​ຜ່ານ​ມາ​ຂອງ TEs ດັ່ງ​ຕໍ່​ໄປ​ນີ້​ການ​ສ້າງ​ຕັ້ງ​ຂອງ​ເສັ້ນ​ຊາຍ​ແດນ TAD ສະ​ເພາະ​ເຊື້ອ​ສາຍ​.ການສຶກສານີ້ສະແດງໃຫ້ເຫັນເຖິງບົດບາດຂອງການຂະຫຍາຍຕົວຂອງ genome transposon-mediated ໃນການວິວັດທະນາການຂອງໂຄງສ້າງ chromatin ທີ່ມີຄໍາສັ່ງສູງກວ່າໃນພືດ.