Newyddion

Mae ymhelaethu ar elfennau trosglwyddadwy (TE) wedi'i gydnabod fel grym gyrru sy'n cyfryngu ehangu ac esblygiad maint genom, ond mae'r canlyniadau ar gyfer siapio pensaernïaeth genomig 3D yn parhau i fod yn anhysbys i raddau helaeth mewn planhigion.Yma, rydym yn adrodd am gynulliadau genom gradd gyfeirio ar gyfer tair rhywogaeth o gotwm sy'n amrywio'n driphlyg o ran maint genom, sefGossypium rotundifolium(K2),G. gardd goed(A2), aG. raimondii(D5), gan ddefnyddio Oxford Nanopore Technologies.Mae dadansoddiadau genomau cymharol yn dogfennu manylion ymhelaethu ar y TE sy'n benodol i linach sy'n cyfrannu at y gwahaniaethau mawr mewn maint genomau (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb), ac yn nodi cynnwys genynnau cymharol gadwedig a pherthnasoedd synteni ymhlith genomau.Canfuom fod tua 17% o enynnau syntenig yn arddangos newid statws cromatin rhwng adrannau gweithredol (“A”) ac anactif (“B”), ac roedd ymhelaethiad TE yn gysylltiedig â chynnydd cyfran A compartment mewn rhanbarthau genynnau (~ 7,000 genynnau ) yn K2 ac A2 mewn perthynas â D5.Dim ond 42% o ffiniau parthau topolegol cysylltiedig (TAD) a gadwyd ymhlith y tri genom.Mae ein data yn awgrymu ymhelaethu diweddar ar TEs yn dilyn ffurfio ffiniau TAD llinach-benodol.Mae'r astudiaeth hon yn taflu goleuni ar rôl ehangu genom wedi'i gyfryngu â thrawsgludiad yn esblygiad strwythur cromatin uwch mewn planhigion.