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転移因子（TE）の増幅は、ゲノムサイズの拡大と進化を媒介する原動力として認識されていますが、植物における3Dゲノム構造の形成への影響​​はほとんど知られていないままです。今回我々は、ゲノムサイズが 3 倍の範囲にある 3 種のワタの参照グレードのゲノムアセンブリを報告します。ゴシピウム・ロトゥンディフォリウム(K2)、G.樹木園(A2)、およびG.ライモンディ(D5)、オックスフォード ナノポア テクノロジーを使用。比較ゲノム解析により、ゲノムサイズの大きな違い（K2、2.44 Gb、A2、1.62 Gb、D5、750.19 Mb）に寄与する系統特異的な TE 増幅の詳細が記録され、ゲノム間で比較的保存された遺伝子含有量とシンテニー関係が示されています。私たちは、シンテニック遺伝子の約 17% が活性 (「A」) コンパートメントと不活性 (「B」) コンパートメントの間でクロマチン状態の変化を示し、TE 増幅が遺伝子領域 (約 7,000 個の遺伝子) における A コンパートメントの割合の増加と関連していることを発見しました。 ) D5 を基準とした K2 と A2 の値。3 つのゲノム間では、位相関連ドメイン (TAD) 境界の 42% のみが保存されていました。我々のデータは、系統特異的な TAD 境界の形成後の TE の最近の増幅を示唆しています。この研究は、植物の高次クロマチン構造の進化におけるトランスポゾンを介したゲノム拡大の役割に光を当てます。