Nuacht

Aithníodh aimpliú eilimint inaistrithe (TE) mar fhórsa tiomána a dhéanann idirghabháil ar mhéadú agus ar éabhlóid an ghéanóim, ach tá na hiarmhairtí maidir le hailtireacht ghéanómach 3D a mhúnlú fós anaithnid i bplandaí.Anseo, tuairiscímid tionóil ghéanóim de ghrád tagartha le haghaidh trí speiceas de chadás a bhfuil raon géineóm faoi thrí acu, eadhonRotundifolium gossypium(K2),G. crannlann(A2), agusG. raimondii(D5), ag baint úsáide as Oxford Nanopore Technologies.Déanann anailísí géanóm comparáideacha doiciméadú ar shonraí an aimplithe TE a bhaineann go sonrach leis an líneáil a chuireann leis na difríochtaí móra i méid an ghéanóim (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb), agus léiríonn siad ábhar géine measartha caomhnaithe agus gaolmhaireachtaí sintéise i measc na ngéanóim.Fuaireamar amach go léiríonn thart ar 17% de ghéinte sintéineacha athrú stádais chromatin idir urranna gníomhacha (“A”) agus neamhghníomhacha (“B”), agus bhain aimpliú TE leis an méadú ar chéatadán A urrann i réigiúin ghéine (~ 7,000 géinte. ) in K2 agus A2 i gcoibhneas le D5.Níor caomhnaíodh ach 42% de theorainneacha na bhfearann ​​a chomhlachú toipeolaíoch (TAD) i measc na dtrí ghéanóm.Tugann ár sonraí le tuiscint go bhfuil aimpliú le déanaí ar TEanna tar éis bunú teorainneacha TAD a bhaineann go sonrach le lineage.Léiríonn an staidéar seo an ról atá ag leathnú géanóm tras-idirghabhála in éabhlóid struchtúr crómatin ardoird i bplandaí.