خبرون

ٽرانسپوزيبل عنصر (TE) ايمپليفڪيشن کي جينوم جي سائيز جي توسيع ۽ ارتقاءَ جي وچولي قوت جي طور تي تسليم ڪيو ويو آهي، پر 3D جينومڪ فن تعمير کي شڪل ڏيڻ جا نتيجا گهڻو ڪري ٻوٽن ۾ اڻڄاتل آهن.هتي، اسان رپورٽ ڪريون ٿا ريفرنس-گريڊ جينوم اسيمبليءَ لاءِ ڪپهه جي ٽن قسمن جي جينوم سائيز ۾ ٽي گنا، يعنيگوسيپيم روٽينڊيفوليم(K2)جي آربوريم(A2)، ۽جي ريموندي(D5)، آڪسفورڊ نانوپور ٽيڪنالاجي استعمال ڪندي.تقابلي جينوم تجزيا دستاويزن جي تفصيلن جي تفصيلن جي تفصيل سان لاڳاپيل TE امپليڪشن جي وڏي جينوم سائيز فرقن ۾ حصو وٺندا آهن (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb)، ۽ ظاهر ڪن ٿا نسبتا محفوظ جين مواد ۽ جينوم جي وچ ۾ مطابقت واري رشتي.اسان اهو معلوم ڪيو ته تقريبن 17٪ syntenic جينز فعال ("A") ۽ غير فعال ("B") حصن جي وچ ۾ ڪروميٽين جي حالت جي تبديلي کي ظاهر ڪن ٿا، ۽ TE ايمپليفڪيشن جين علائقن (~ 7,000 جينز) ۾ هڪ خاني جي تناسب جي واڌ سان لاڳاپيل هو. D5 جي نسبت K2 ۽ A2 ۾.صرف 42٪ topologically associating domain (TAD) جون حدون ٽن جينوم جي وچ ۾ محفوظ ڪيون ويون.اسان جي ڊيٽا کي TEs جي تازي واڌ کي شامل ڪري ٿو، نسب جي مخصوص TAD حدن جي ٺهڻ کان پوء.هي مطالعو ٻوٽن ۾ اعليٰ آرڊر ڪرومٽين جي جوڙجڪ جي ارتقا ۾ ٽرانسپوسن جي وچولي جينوم جي توسيع جي ڪردار تي روشني وجهي ٿو.