വാർത്ത

ട്രാൻസ്‌പോസിബിൾ എലമെന്റ് (ടിഇ) ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ ജീനോം വലുപ്പം വികസിപ്പിക്കുന്നതിനും പരിണാമത്തിനും മധ്യസ്ഥത വഹിക്കുന്ന ഒരു പ്രേരകശക്തിയായി അംഗീകരിക്കപ്പെട്ടിട്ടുണ്ട്, എന്നാൽ 3D ജീനോമിക് ആർക്കിടെക്ചർ രൂപപ്പെടുത്തുന്നതിന്റെ അനന്തരഫലങ്ങൾ സസ്യങ്ങളിൽ അജ്ഞാതമായി തുടരുന്നു.ജീനോം വലുപ്പത്തിൽ മൂന്നിരട്ടി വരുന്ന മൂന്ന് ഇനം പരുത്തികൾക്കുള്ള റഫറൻസ് ഗ്രേഡ് ജീനോം അസംബ്ലികൾ ഞങ്ങൾ ഇവിടെ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യുന്നു, അതായത്ഗോസിപിയം റൊട്ടണ്ടിഫോളിയം(കെ2),ജി. അർബോറിയം(A2), ഒപ്പംജി. റെയ്‌മോണ്ടി(D5), ഓക്സ്ഫോർഡ് നാനോപോർ ടെക്നോളജീസ് ഉപയോഗിക്കുന്നു.താരതമ്യ ജീനോം വിശകലനങ്ങൾ വലിയ ജീനോം വലുപ്പ വ്യത്യാസങ്ങൾക്ക് (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb) സംഭാവന ചെയ്യുന്ന ലൈനേജ്-സ്പെസിഫിക് TE ആംപ്ലിഫിക്കേഷന്റെ വിശദാംശങ്ങൾ രേഖപ്പെടുത്തുന്നു, കൂടാതെ താരതമ്യേന സംരക്ഷിത ജീൻ ഉള്ളടക്കവും ജീനോമുകൾക്കിടയിലുള്ള സംയോജന ബന്ധങ്ങളും സൂചിപ്പിക്കുന്നു.ഏകദേശം 17% സിന്റനിക് ജീനുകൾ സജീവമായ (“എ”), നിഷ്‌ക്രിയ (“ബി”) കമ്പാർട്ടുമെന്റുകൾക്കിടയിൽ ക്രോമാറ്റിൻ സ്റ്റാറ്റസ് മാറ്റം കാണിക്കുന്നതായി ഞങ്ങൾ കണ്ടെത്തി, കൂടാതെ ടിഇ ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ ജീൻ പ്രദേശങ്ങളിലെ എ കമ്പാർട്ടുമെന്റിന്റെ അനുപാതത്തിന്റെ വർദ്ധനവുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു (~ 7,000 ജീനുകൾ ) D5 നെ അപേക്ഷിച്ച് K2, A2 എന്നിവയിൽ.മൂന്ന് ജീനോമുകൾക്കിടയിൽ ടോപ്പോളജിക്കൽ അസോസിയേറ്റ് ഡൊമെയ്‌നിന്റെ (ടിഎഡി) 42% മാത്രമേ സംരക്ഷിക്കപ്പെട്ടിട്ടുള്ളൂ.ലൈനേജ്-നിർദ്ദിഷ്‌ട TAD അതിരുകളുടെ രൂപീകരണത്തെത്തുടർന്ന് TE-കളുടെ സമീപകാല വർദ്ധന ഞങ്ങളുടെ ഡാറ്റ സൂചിപ്പിക്കുന്നു.സസ്യങ്ങളിലെ ഉയർന്ന ക്രമത്തിലുള്ള ക്രോമാറ്റിൻ ഘടനയുടെ പരിണാമത്തിൽ ട്രാൻസ്‌പോസൺ-മധ്യസ്ഥ ജനിതക വികാസത്തിന്റെ പങ്കിനെക്കുറിച്ച് ഈ പഠനം വെളിച്ചം വീശുന്നു.