Balita

Ang transposable element (TE) amplification giila nga usa ka puwersa sa pagpalihok nga nagpataliwala sa gidak-on sa genome ug ebolusyon, apan ang mga sangputanan sa pagporma sa 3D genomic nga arkitektura nagpabilin nga wala mailhi sa mga tanum.Dinhi, among gitaho ang reference-grade genome nga mga asembliya alang sa tulo ka espisye sa gapas nga tulo ka pilo ang gidak-on sa genome, nga maoEspesye sa tanom nga bulak ang Gossypium rotundifolium(K2),G. arboreum(A2), ugG. raimondii(D5), gamit ang Oxford Nanopore Technologies.Ang pagtandi sa genome nga pag-analisar nagdokumento sa mga detalye sa lineage-specific TE amplification nga nakatampo sa dako nga genome size differences (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb), ug nagpakita nga medyo gikonserbar nga gene content ug synteny nga mga relasyon sa mga genome.Nakita namon nga gibana-bana nga 17% sa mga syntenic nga mga gene nagpakita sa pagbag-o sa status sa chromatin tali sa aktibo ("A") ug dili aktibo ("B") nga mga kompartamento, ug ang TE amplification nalangkit sa pagtaas sa proporsyon sa A compartment sa mga rehiyon sa gene (~ 7,000 nga mga gene. ) sa K2 ug A2 kalabot sa D5.42% ra sa mga utlanan sa topologically associating domain (TAD) ang gikonserbar sa tulo ka genome.Ang among datos naglambigit sa bag-o nga pagpadako sa mga TE pagkahuman sa pagporma sa mga utlanan sa TAD nga piho sa linya.Kini nga pagtuon naghatag kahayag sa papel sa transposon-mediated genome expansion sa ebolusyon sa mas taas nga-order nga chromatin structure sa mga tanom.