খবর

ট্রান্সপোজেবল এলিমেন্ট (টিই) অ্যামপ্লিফিকেশন জিনোমের আকার সম্প্রসারণ এবং বিবর্তনের মধ্যস্থতাকারী একটি চালিকা শক্তি হিসাবে স্বীকৃত হয়েছে, তবে 3D জিনোমিক আর্কিটেকচারকে আকার দেওয়ার ফলাফলগুলি উদ্ভিদের মধ্যে অনেকাংশে অজানা রয়ে গেছে।এখানে, আমরা তিন প্রজাতির তুলার জন্য রেফারেন্স-গ্রেড জিনোম অ্যাসেম্বলি রিপোর্ট করি, জিনোমের আকারে তিনগুণ, যথাগসিপিয়াম রোটুন্ডিফোলিয়াম(K2),G. arboreum(A2), এবংজি. রায়মন্ডি(D5), অক্সফোর্ড ন্যানোপুর প্রযুক্তি ব্যবহার করে।তুলনামূলক জিনোম বিশ্লেষণগুলি বংশ-নির্দিষ্ট TE পরিবর্ধনের বিবরণ নথিভুক্ত করে যা বৃহৎ জিনোমের আকারের পার্থক্যে অবদান রাখে (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb), এবং জিনোমের মধ্যে তুলনামূলকভাবে সংরক্ষিত জিনের বিষয়বস্তু এবং সিন্টেনি সম্পর্ক নির্দেশ করে।আমরা দেখেছি যে প্রায় 17% সিন্টেনিক জিন সক্রিয় ("A") এবং নিষ্ক্রিয় ("B") অংশগুলির মধ্যে ক্রোমাটিন স্থিতির পরিবর্তন প্রদর্শন করে এবং TE পরিবর্ধন জিন অঞ্চলে A কম্পার্টমেন্টের অনুপাত বৃদ্ধির সাথে যুক্ত ছিল (~ 7,000 জিন) ) K2 এবং A2 তে D5 এর সাপেক্ষে।তিনটি জিনোমের মধ্যে মাত্র 42% টপোলজিক্যালি অ্যাসোসিয়েটিং ডোমেন (TAD) সীমানা সংরক্ষিত ছিল।আমাদের ডেটা বংশ-নির্দিষ্ট TAD সীমানা গঠনের পরে TEs-এর সাম্প্রতিক পরিবর্ধনকে জড়িত করে।এই গবেষণাটি উদ্ভিদের উচ্চ-ক্রম ক্রোমাটিন কাঠামোর বিবর্তনে ট্রান্সপোসন-মধ্যস্থ জিনোম সম্প্রসারণের ভূমিকার উপর আলোকপাত করে।