Novas

Recoñeceuse que a amplificación de elementos transposables (TE) é unha forza motriz que media a expansión e evolución do tamaño do xenoma, pero as consecuencias para dar forma á arquitectura xenómica 3D seguen sendo moi descoñecidas nas plantas.Aquí, informamos de conxuntos de xenomas de referencia para tres especies de algodón cuxo tamaño do xenoma triplica, é dicirGossypium rotundifolium(K2),G. arboreo(A2) eG. raimondii(D5), utilizando Oxford Nanopore Technologies.As análises comparativas do xenoma documentan os detalles da amplificación de TE específica da liñaxe que contribúe ás grandes diferenzas de tamaño do xenoma (K2, 2,44 Gb; A2, 1,62 Gb; D5, 750,19 Mb) e indican o contido xenético relativamente conservado e as relacións de sintonia entre os xenomas.Descubrimos que aproximadamente o 17% dos xenes sintéticos presentan un cambio de estado da cromatina entre os compartimentos activos ("A") e inactivos ("B"), e a amplificación de TE asociouse co aumento da proporción do compartimento A nas rexións xenéticas (~ 7.000 xenes). ) en K2 e A2 en relación con D5.Só o 42% dos límites de dominios de asociación topolóxica (TAD) foron conservados entre os tres xenomas.Os nosos datos implican a amplificación recente de TE tras a formación de límites TAD específicos da liñaxe.Este estudo arroxa luz sobre o papel da expansión do xenoma mediada por transposóns na evolución da estrutura da cromatina de orde superior nas plantas.