వార్తలు

ట్రాన్స్‌పోజబుల్ ఎలిమెంట్ (TE) యాంప్లిఫికేషన్ జన్యు పరిమాణం విస్తరణ మరియు పరిణామానికి మధ్యవర్తిత్వం వహించే చోదక శక్తిగా గుర్తించబడింది, అయితే 3D జెనోమిక్ ఆర్కిటెక్చర్‌ను రూపొందించడం వల్ల కలిగే పరిణామాలు మొక్కలలో ఎక్కువగా తెలియవు.ఇక్కడ, మేము జన్యు పరిమాణంలో మూడు రెట్లు ఉండే మూడు జాతుల పత్తి కోసం రిఫరెన్స్-గ్రేడ్ జీనోమ్ అసెంబ్లీలను నివేదిస్తాము, అవిగోసిపియం రోటుండిఫోలియం(K2),జి. ఆర్బోరియం(A2), మరియుజి. రైమోండి(D5), ఆక్స్‌ఫర్డ్ నానోపోర్ టెక్నాలజీస్‌ని ఉపయోగిస్తోంది.తులనాత్మక జన్యు విశ్లేషణలు పెద్ద జన్యు పరిమాణ వ్యత్యాసాలకు (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb) దోహదపడే వంశ-నిర్దిష్ట TE యాంప్లిఫికేషన్ వివరాలను డాక్యుమెంట్ చేస్తాయి మరియు జన్యువుల మధ్య సాపేక్షంగా సంరక్షించబడిన జన్యు కంటెంట్ మరియు సంశ్లేషణ సంబంధాలను సూచిస్తాయి.సుమారు 17% సింథనిక్ జన్యువులు క్రియాశీల (“A”) మరియు నిష్క్రియ (“B”) కంపార్ట్‌మెంట్‌ల మధ్య క్రోమాటిన్ స్థితి మార్పును ప్రదర్శిస్తాయని మేము కనుగొన్నాము మరియు TE యాంప్లిఫికేషన్ జన్యు ప్రాంతాలలో (~ 7,000 జన్యువులు) A కంపార్ట్‌మెంట్ నిష్పత్తి పెరుగుదలతో ముడిపడి ఉంది. ) D5కి సంబంధించి K2 మరియు A2లో.మూడు జన్యువులలో 42% టోపోలాజికల్ అసోసియేటింగ్ డొమైన్ (TAD) సరిహద్దులు మాత్రమే భద్రపరచబడ్డాయి.మా డేటా వంశ-నిర్దిష్ట TAD సరిహద్దుల ఏర్పాటు తర్వాత TEల యొక్క ఇటీవలి విస్తరణను సూచిస్తుంది.ఈ అధ్యయనం మొక్కలలో హై-ఆర్డర్ క్రోమాటిన్ నిర్మాణం యొక్క పరిణామంలో ట్రాన్స్‌పోసన్-మధ్యవర్తిత్వ జన్యు విస్తరణ పాత్రపై వెలుగునిస్తుంది.