-
പ്രോട്ടോമിക്സ്
ഒരു കോശത്തിന്റെയോ ടിഷ്യുവിന്റെയോ ജീവിയുടെയോ ഉള്ള മൊത്തത്തിലുള്ള പ്രോട്ടീനുകളുടെ അളവ് നിർണ്ണയിക്കുന്നതിനുള്ള സാങ്കേതികവിദ്യകളുടെ പ്രയോഗങ്ങൾ പ്രോട്ടിയോമിക്സിൽ ഉൾപ്പെടുന്നു.വിവിധ ഡയഗ്‌നോസ്റ്റിക് മാർക്കറുകൾ കണ്ടെത്തൽ, വാക്‌സിൻ ഉൽപ്പാദനത്തിനുള്ള ഉദ്യോഗാർത്ഥികൾ, രോഗകാരണ സംവിധാനങ്ങൾ മനസ്സിലാക്കൽ, വ്യത്യസ്ത സിഗ്നലുകളോടുള്ള പ്രതികരണമായി ആവിഷ്‌കാര പാറ്റേണുകളിൽ മാറ്റം വരുത്തൽ, വിവിധ രോഗങ്ങളിലെ പ്രവർത്തനക്ഷമമായ പ്രോട്ടീൻ പാതകളുടെ വ്യാഖ്യാനം എന്നിങ്ങനെ വിവിധ ഗവേഷണ ക്രമീകരണങ്ങൾക്കായി പ്രോട്ടിയോമിക്സ് അധിഷ്‌ഠിത സാങ്കേതികവിദ്യകൾ വിവിധ ശേഷികളിൽ ഉപയോഗിക്കുന്നു.നിലവിൽ, ക്വാണ്ടിറ്റേറ്റീവ് പ്രോട്ടിയോമിക്സ് സാങ്കേതികവിദ്യകളെ പ്രധാനമായും ടിഎംടി, ലേബൽ ഫ്രീ, ഡിഐഎ ക്വാണ്ടിറ്റേറ്റീവ് തന്ത്രങ്ങൾ എന്നിങ്ങനെ തിരിച്ചിരിക്കുന്നു.
-
മെറ്റബോളിക്സ്
മെറ്റബോളിം ജനിതകത്തിന്റെ അവസാനത്തെ താഴത്തെ ഉൽപ്പന്നമാണ്, കൂടാതെ ഒരു കോശത്തിലോ ടിഷ്യുവിലോ ജീവജാലത്തിലോ ഉള്ള എല്ലാ കുറഞ്ഞ തന്മാത്രാ ഭാരമുള്ള തന്മാത്രകളുടെയും (മെറ്റബോളിറ്റുകളുടെ) മൊത്തത്തിലുള്ള പൂരകവും അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു.ശാരീരിക ഉത്തേജനങ്ങളുടെയോ രോഗാവസ്ഥകളുടെയോ പശ്ചാത്തലത്തിൽ ചെറിയ തന്മാത്രകളുടെ വിശാലമായ വീതി അളക്കാൻ മെറ്റബോളമിക്സ് ലക്ഷ്യമിടുന്നു.ഉപാപചയ രീതികൾ രണ്ട് വ്യത്യസ്ത ഗ്രൂപ്പുകളായി തിരിച്ചിരിക്കുന്നു: നോൺ-ടാർഗെറ്റഡ് മെറ്റബോളമിക്സ്, GC-MS/LC-MS ഉപയോഗിച്ചുള്ള കെമിക്കൽ അജ്ഞാതങ്ങൾ ഉൾപ്പെടെ ഒരു സാമ്പിളിലെ അളക്കാനാവുന്ന എല്ലാ വിശകലനങ്ങളുടെയും ഉദ്ദേശിച്ച സമഗ്രമായ വിശകലനം, ടാർഗെറ്റഡ് മെറ്റബോളമിക്സ്, കെമിക്കൽ സ്വഭാവമുള്ള ഗ്രൂപ്പുകളുടെ നിർവചിക്കപ്പെട്ട ഗ്രൂപ്പുകളുടെ അളവ്. ജൈവ രാസപരമായി വ്യാഖ്യാനിച്ച മെറ്റബോളിറ്റുകൾ.
-
ബൾക്ക്ഡ് സെഗ്രഗന്റ് വിശകലനം
ബൾക്ക്ഡ് സെഗ്രഗന്റ് അനാലിസിസ് (ബിഎസ്എ) എന്നത് ഫിനോടൈപ്പുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ജനിതക മാർക്കറുകൾ പെട്ടെന്ന് തിരിച്ചറിയാൻ ഉപയോഗിക്കുന്ന ഒരു സാങ്കേതികതയാണ്.ബിഎസ്‌എയുടെ പ്രധാന വർക്ക്ഫ്ലോയിൽ രണ്ട് ഗ്രൂപ്പുകൾ തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നത് വളരെ വിരുദ്ധമായ ഫിനോടൈപ്പുകളുള്ളതാണ്, എല്ലാ വ്യക്തികളുടെയും ഡിഎൻഎ സംയോജിപ്പിച്ച് ഡിഎൻഎയുടെ രണ്ട് ബൾക്ക് രൂപീകരിക്കുന്നു, രണ്ട് പൂളുകൾക്കിടയിലുള്ള ഡിഫറൻഷ്യൽ സീക്വൻസുകൾ തിരിച്ചറിയുന്നു.സസ്യ/മൃഗ ജീനോമുകളിൽ ടാർഗെറ്റുചെയ്‌ത ജീനുകളാൽ ശക്തമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്ന ജനിതക മാർക്കറുകൾ തിരിച്ചറിയുന്നതിൽ ഈ സാങ്കേതികവിദ്യ വ്യാപകമായി ഉപയോഗിച്ചുവരുന്നു.
-
ഡിഎൻഎ/ആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗ് - നാനോപോർ സീക്വൻസർ
നാനോപോറുകളെ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ഒരു തന്മാത്ര തത്സമയ വൈദ്യുത സിഗ്നൽ സീക്വൻസിംഗ് സാങ്കേതികവിദ്യയാണ് ONT സീക്വൻസിങ്, ഓരോ പ്ലാറ്റ്ഫോമിന്റെയും സീക്വൻസിങ് തത്വം ഒന്നുതന്നെയാണ്.ഡബിൾ സ്ട്രാൻഡഡ് ഡിഎൻഎ/ആർഎൻഎ ബയോഫിലിമിൽ ഉൾച്ചേർത്ത നാനോപോറസ് പ്രോട്ടീനുമായി ബന്ധിപ്പിക്കുകയും മോട്ടോർ പ്രോട്ടീന്റെ ലീഡിന് കീഴിൽ അൺവൈൻഡ് ചെയ്യുകയും ചെയ്യും, ബയോഫിലിമിന്റെ ഇരുവശത്തുമുള്ള വോൾട്ടേജ് വ്യത്യാസത്തിന്റെ പ്രവർത്തനത്തിൽ, ഡിഎൻഎ/ആർഎൻഎ സ്ട്രാൻഡുകൾ നാനോപോർ ചാനൽ പ്രോട്ടീനിലൂടെ ഒരു നിശ്ചിത സമയത്ത് കടന്നുപോകുന്നു. നിരക്ക്.ഡിഎൻഎ/ആർഎൻഎ സ്ട്രാൻഡിലെ വിവിധ ബേസുകളുടെ രാസ ഗുണങ്ങളുടെ വ്യത്യാസം കാരണം, നാനോപോർ ചാനലിലൂടെ ഒരൊറ്റ ബേസ് അല്ലെങ്കിൽ ഡിഎൻഎ തന്മാത്ര കടന്നുപോകുമ്പോൾ, അത് വ്യത്യസ്ത വൈദ്യുത സിഗ്നലുകളുടെ മാറ്റത്തിന് കാരണമാകും.ഈ സിഗ്നലുകൾ കണ്ടെത്തുകയും അവയുമായി പൊരുത്തപ്പെടുകയും ചെയ്യുന്നതിലൂടെ, അനുബന്ധ അടിസ്ഥാന തരങ്ങൾ കണക്കാക്കാനും ക്രമത്തിന്റെ തത്സമയ കണ്ടെത്തൽ പൂർത്തിയാക്കാനും കഴിയും.
-
ഡിഎൻഎ/ആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ് -പാക്ബയോ സീക്വൻസർ
PacBio സീക്വൻസിംഗ് പ്ലാറ്റ്ഫോം ദീർഘനേരം വായിക്കുന്ന ഒരു സീക്വൻസിംഗ് പ്ലാറ്റ്‌ഫോമാണ്, ഇത് മൂന്നാം തലമുറ സീക്വൻസിംഗ് (TGS) സാങ്കേതികവിദ്യകളിൽ ഒന്നായും അറിയപ്പെടുന്നു.പ്രധാന സാങ്കേതികവിദ്യ, സിംഗിൾ-മോളിക്യൂൾ റിയൽ-ടൈം (SMRT), പതിനായിരക്കണക്കിന് കിലോ-ബേസ് ദൈർഘ്യമുള്ള വായനകളുടെ ജനറേഷൻ ശക്തമാക്കുന്നു."സീക്വൻസിംഗ്-ബൈ-സിന്തസിസ്" എന്നതിന്റെ അടിസ്ഥാനത്തിൽ, സീറോ-മോഡ് വേവ്ഗൈഡ് (ZMW) വഴി ഒറ്റ ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് റെസല്യൂഷൻ കൈവരിക്കുന്നു, ഇവിടെ പരിമിതമായ അളവ് (തന്മാത്ര സംശ്ലേഷണത്തിന്റെ സൈറ്റ്) മാത്രമേ പ്രകാശിപ്പിക്കുന്നുള്ളൂ.കൂടാതെ, എസ്എംആർടി സീക്വൻസിങ് എൻജിഎസ് സിസ്റ്റത്തിലെ സീക്വൻസ്-സ്പെസിഫിക് ബയസ് ഒഴിവാക്കുന്നു, ലൈബ്രറി നിർമ്മാണ പ്രക്രിയയിൽ മിക്ക PCR ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ ഘട്ടങ്ങളും ആവശ്യമില്ല.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: സീക്വൽ II, റിവിയോ
