-
Proteomica
Proteomics omvat de toepassingen van technologieën voor de kwantificering van de totale eiwitten die aanwezig zijn in een cel, weefsel of organisme.Op proteomics gebaseerde technologieën worden in verschillende capaciteiten gebruikt voor verschillende onderzoeksomgevingen, zoals de detectie van verschillende diagnostische markers, kandidaten voor de productie van vaccins, het begrijpen van pathogeniteitsmechanismen, het veranderen van expressiepatronen als reactie op verschillende signalen en de interpretatie van functionele eiwitroutes bij verschillende ziekten.Momenteel zijn kwantitatieve proteomics-technologieën voornamelijk onderverdeeld in kwantitatieve strategieën TMT, Label Free en DIA.
-
Metabolomica
Het metaboloom is het terminale stroomafwaartse product van het genoom en bestaat uit het totale complement van alle moleculen met een laag molecuulgewicht (metabolieten) in een cel, weefsel of organisme.Metabolomics heeft tot doel een breed scala aan kleine moleculen te meten in de context van fysiologische stimuli of ziektetoestanden.Metabolomics-methodologieën vallen in twee verschillende groepen: niet-gerichte metabolomics, een beoogde uitgebreide analyse van alle meetbare analyten in een monster, inclusief chemische onbekenden, met behulp van GC-MS/LC-MS, en gerichte metabolomics, de meting van gedefinieerde groepen van chemisch gekarakteriseerde en biochemisch geannoteerde metabolieten.
-
Bulked Segregant-analyse
Bulked segregant analyse (BSA) is een techniek die wordt gebruikt om snel fenotype-geassocieerde genetische markers te identificeren.De belangrijkste workflow van BSA bestaat uit het selecteren van twee groepen individuen met extreem tegengestelde fenotypes, het samenvoegen van het DNA van alle individuen om twee grote hoeveelheden DNA te vormen en het identificeren van differentiële sequenties tussen twee pools.Deze techniek is op grote schaal toegepast bij het identificeren van genetische merkers die sterk geassocieerd zijn met gerichte genen in de genomen van planten en dieren.
-
DNA/RNA-sequencing – Nanopore-sequencer
ONT-sequencing is een real-time elektrische signaalsequencing-technologie met één molecuul, gebaseerd op nanoporiën. Het sequencing-principe van elk platform is hetzelfde.Dubbelstrengig DNA/RNA zal zich binden aan nanoporeus eiwit dat in de biofilm is ingebed en zich afwikkelen onder leiding van motoreiwit. Onder invloed van het spanningsverschil aan beide zijden van de biofilm passeren DNA/RNA-strengen het nanoporie-kanaaleiwit met een bepaalde snelheid. tarief.Vanwege de verschillen in de chemische eigenschappen van de verschillende basen op de DNA/RNA-streng, zal wanneer een enkele base of DNA-molecuul door het nanoporiekanaal gaat, de verandering van verschillende elektrische signalen veroorzaken.Door deze signalen te detecteren en ermee te corresponderen, kunnen de overeenkomstige basistypen worden berekend en kan de realtime detectie van de reeks worden voltooid.
-
DNA/RNA-sequencing -PacBio-sequencer
PacBio-sequencingplatform is een lang gelezen sequencingplatform, ook bekend als een van de Third-Generation Sequencing-technologieën (TGS).De kerntechnologie, single-molecule real-time (SMRT), maakt het genereren van leesbewerkingen met een lengte van tientallen kilobases mogelijk.Op basis van “Sequencing-by-Synthesis” wordt de resolutie van één nucleotide bereikt door Zero-mode golfgeleider (ZMW), waarbij slechts een beperkt volume aan de onderkant (plaats van molecuulsynthese) wordt verlicht.Bovendien vermijdt SMRT-sequencing grotendeels sequentiespecifieke bias in het NGS-systeem, in die zin dat de meeste PCR-amplificatiestappen niet vereist zijn in het bibliotheekconstructieproces.
Platform: Vervolg II, Revio
