-
Proteomiikka
Proteomiikassa käytetään teknologioita solun, kudoksen tai organismin proteiinien kokonaispitoisuuden kvantifioimiseksi.Proteomiikkaan perustuvia teknologioita hyödynnetään erilaisissa ominaisuuksissa erilaisissa tutkimusympäristöissä, kuten erilaisten diagnostisten markkerien havaitsemisessa, rokotteen valmistukseen ehdokkaiden tunnistamisessa, patogeenisuusmekanismien ymmärtämisessä, ilmentymismallien muuttamisessa vasteena erilaisiin signaaleihin ja funktionaalisten proteiinipolkujen tulkintaan eri sairauksissa.Tällä hetkellä kvantitatiiviset proteomiikan teknologiat jaetaan pääasiassa TMT-, Label Free- ja DIA-kvantitatiivisiin strategioihin.
-
Aineenvaihdunta
Metabolia on genomin terminaalinen lopputuote, ja se koostuu solun, kudoksen tai organismin kaikkien pienimolekyylisten molekyylien (metaboliittien) kokonaiskomplementista.Metabolomiikka pyrkii mittaamaan laajan valikoiman pieniä molekyylejä fysiologisten ärsykkeiden tai sairaustilojen yhteydessä.Aineenvaihduntamenetelmät jakautuvat kahteen erilliseen ryhmään: ei-kohdennettu metabolomiikka, suunniteltu kattava analyysi kaikista näytteessä olevista mitattavissa olevista analyyteistä, mukaan lukien kemialliset tuntemattomat GC-MS/LC-MS:n avulla, ja kohdennettu metabolomiikka, määriteltyjen kemiallisesti karakterisoitujen ryhmien mittaus ja biokemiallisesti annotoidut metaboliitit.
-
Bulked Segregant -analyysi
Bulked segregant -analyysi (BSA) on tekniikka, jota käytetään fenotyyppiin liittyvien geneettisten markkerien nopeaan tunnistamiseen.BSA:n päätyönkulku sisältää kahden yksilöryhmän valitsemisen, joilla on äärimmäisen vastakkaiset fenotyypit, kaikkien yksilöiden DNA:n yhdistämisen muodostamaan kaksi DNA-osaa ja tunnistamaan erosekvenssit kahden poolin välillä.Tätä tekniikkaa on käytetty laajasti tunnistamaan geneettisiä markkereita, jotka liittyvät vahvasti kohdegeeniin kasvien/eläinten genomeissa.
-
DNA/RNA-sekvensointi – Nanopore-sekvensointilaite
ONT-sekvensointi on yhden molekyylin reaaliaikainen sähkösignaalin sekvensointitekniikka, joka perustuu nanohuokosiin, jokaisen alustan sekvensointiperiaate on sama.Kaksijuosteinen DNA/RNA sitoutuu nanohuokoiseen proteiiniin, joka on upotettu biofilmiin ja purkautuu moottoriproteiinin johdolla, biofilmin molemmilta puolilta tulevan jännite-eron vaikutuksesta DNA/RNA-säikeet kulkevat nanohuokoskanavaproteiinin läpi tietyllä hetkellä korko.DNA/RNA-juosteen eri emästen kemiallisten ominaisuuksien eroista johtuen, kun yksittäinen emäs tai DNA-molekyyli kulkee nanohuokoskanavan läpi, se aiheuttaa erilaisten sähköisten signaalien muutoksen.Näitä signaaleja tunnistamalla ja vastaamalla voidaan laskea vastaavat kantatyypit ja suorittaa sekvenssin reaaliaikainen ilmaisu.
-
DNA/RNA-sekvensointi - PacBio Sequencer
PacBio-sekvensointialusta on pitkään luettava sekvensointialusta, joka tunnetaan myös yhtenä Third-Generation Sequencing (TGS) -tekniikoista.Ydinteknologia, yksimolekyylinen reaaliaikainen (SMRT), mahdollistaa kymmenien kilometrien pituisten lukujen luomisen."Sequencing-by-Synthesis" -menetelmän perusteella yhden nukleotidin resoluutio saavutetaan Zero-mode waveguide (ZMW), jossa vain rajoitettu tilavuus alaosassa (molekyylisynteesin kohta) on valaistu.Lisäksi SMRT-sekvensoinnilla vältetään suurelta osin sekvenssispesifinen harha NGS-järjestelmässä, koska suurinta osaa PCR-monistusvaiheista ei vaadita kirjaston rakennusprosessissa.
Alusta: Sequel II, Revio
