-
Proteoomika
Proteoomika hõlmab tehnoloogiate rakendamist rakus, koes või organismis sisalduva üldise valkude sisalduse kvantifitseerimiseks.Proteoomikapõhiseid tehnoloogiaid kasutatakse mitmesugustes uurimisvaldkondades, näiteks erinevate diagnostiliste markerite tuvastamine, vaktsiini tootmise kandidaatide tuvastamine, patogeensusmehhanismide mõistmine, ekspressioonimustrite muutmine vastuseks erinevatele signaalidele ja funktsionaalsete valguradade tõlgendamine erinevates haigustes.Praegu jagunevad kvantitatiivse proteoomika tehnoloogiad peamiselt TMT, Label Free ja DIA kvantitatiivseteks strateegiateks.
-
Ainevahetus
Metaboom on genoomi lõpp-produkt ja koosneb kõigi madala molekulmassiga molekulide (metaboliitide) kogukomplemendist rakus, koes või organismis.Metaboloomika eesmärk on mõõta väikeste molekulide laia ulatust füsioloogiliste stiimulite või haigusseisundite kontekstis.Metaboloomika metoodikad jagunevad kahte erinevasse rühma: mittesihitud metaboloomika, kõigi proovis sisalduvate mõõdetavate analüütide kavandatud põhjalik analüüs, sealhulgas keemilised tundmatud ained, kasutades GC-MS/LC-MS, ja sihitud metaboolika, määratletud keemiliselt iseloomustatud ja biokeemiliselt annoteeritud metaboliidid.
-
Hulgieraldusanalüüs
Masseeritud segregantanalüüs (BSA) on meetod, mida kasutatakse fenotüübiga seotud geneetiliste markerite kiireks tuvastamiseks.BSA peamine töövoog hõlmab kahe äärmiselt vastandlike fenotüüpidega indiviidide rühma valimist, kõigi indiviidide DNA ühendamist, et moodustada kaks DNA-d, tuvastades kahe kogumi vahelised erinevused.Seda tehnikat on laialdaselt kasutatud geneetiliste markerite tuvastamiseks, mis on tugevalt seotud sihtgeenidega taimede / loomade genoomis.
-
DNA/RNA sekveneerimine – nanopooride sekveneerija
ONT sekveneerimine on ühe molekuli reaalajas elektrisignaalide sekveneerimise tehnoloogia, mis põhineb nanopooridel, iga platvormi järjestuspõhimõte on sama.Kaheahelaline DNA/RNA seondub biokile sisseehitatud nanopoorse valguga, mis kerib end lahti motoorse valgu juhtimisel, biokile mõlemalt küljelt tuleva pingeerinevuse toimel läbivad DNA/RNA ahelad nanopooride kanali valku teatud kindlal hetkel. määra.DNA/RNA ahela erinevate aluste keemiliste omaduste erinevuse tõttu põhjustab ühe aluse või DNA molekuli nanopooride kanali läbimine erinevate elektriliste signaalide muutumise.Neid signaale tuvastades ja neile vastates saab arvutada vastavad baastüübid ning lõpule viia jada reaalajas tuvastamise.
-
DNA/RNA sekveneerimine - PacBio Sequencer
PacBio sekveneerimisplatvorm on kaualoetav sekveneerimisplatvorm, mis on tuntud ka kui üks kolmanda põlvkonna järjestustehnoloogiatest (TGS).Põhitehnoloogia, ühemolekuliline reaalajas (SMRT), võimaldab luua kümneid kiloaluseid pikki lugemisi.Sequence-by-Synthesis alusel saavutatakse ühe nukleotiidi eraldusvõime nullrežiimi lainejuhiga (Zero-mode waveguide, ZMW), mille põhjas (molekuli sünteesi koht) on valgustatud ainult piiratud maht.Lisaks väldib SMRT sekveneerimine suuresti NGS-süsteemis järjestusspetsiifilist eelarvamust, kuna enamik PCR-i amplifikatsioonietappe ei ole raamatukogu ehitamise protsessis vajalik.
Platvorm: järg II, Revio
