-
โปรตีโอมิกส์
โปรตีโอมิกส์เกี่ยวข้องกับการประยุกต์เทคโนโลยีในการหาปริมาณโปรตีนโดยรวมที่มีอยู่ในเซลล์ เนื้อเยื่อ หรือสิ่งมีชีวิตเทคโนโลยีที่ใช้โปรตีโอมิกส์ถูกนำมาใช้ในความสามารถที่หลากหลายสำหรับการตั้งค่าการวิจัยที่แตกต่างกัน เช่น การตรวจหาเครื่องหมายในการวินิจฉัยต่างๆ ตัวเลือกสำหรับการผลิตวัคซีน การทำความเข้าใจกลไกการเกิดโรค การเปลี่ยนแปลงรูปแบบการแสดงออกเพื่อตอบสนองต่อสัญญาณที่แตกต่างกัน และการตีความวิถีทางโปรตีนเชิงฟังก์ชันในโรคต่างๆปัจจุบันเทคโนโลยีโปรตีโอมิกส์เชิงปริมาณแบ่งออกเป็นกลยุทธ์เชิงปริมาณ TMT, Label Free และ DIA เป็นหลัก
-
เมแทบอลิซึม
เมตาโบโลมเป็นผลผลิตจากปลายน้ำของจีโนมและประกอบด้วยส่วนประกอบทั้งหมดของโมเลกุลน้ำหนักโมเลกุลต่ำ (เมตาบอไลต์) ทั้งหมดในเซลล์ เนื้อเยื่อ หรือสิ่งมีชีวิตเมตาโบโลมิกส์มีจุดมุ่งหมายเพื่อวัดความกว้างของโมเลกุลขนาดเล็กในบริบทของสิ่งเร้าทางสรีรวิทยาหรือสภาวะของโรควิธีเมตาโบโลมิกส์แบ่งออกเป็นสองกลุ่มที่แตกต่างกัน: เมตาโบโลมิกส์แบบไม่กำหนดเป้าหมาย การวิเคราะห์ที่ครอบคลุมโดยตั้งใจของสารวิเคราะห์ที่วัดได้ทั้งหมดในตัวอย่าง รวมถึงไม่ทราบสารเคมีโดยใช้ GC-MS/LC-MS และเมตาโบโลมิกส์แบบกำหนดเป้าหมาย การวัดกลุ่มที่กำหนดซึ่งมีลักษณะทางเคมีและ สารที่มีหมายเหตุประกอบทางชีวเคมี
-
การวิเคราะห์แยกกลุ่มแบบเป็นกลุ่ม
การวิเคราะห์แยกกลุ่ม (BSA) เป็นเทคนิคที่ใช้ในการระบุเครื่องหมายทางพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับฟีโนไทป์อย่างรวดเร็วขั้นตอนการทำงานหลักของ BSA ประกอบด้วยการเลือกบุคคลสองกลุ่มที่มีฟีโนไทป์ที่ตรงกันข้ามกันอย่างยิ่ง โดยรวบรวม DNA ของบุคคลทั้งหมดเพื่อสร้าง DNA สองกลุ่ม โดยระบุลำดับที่แตกต่างกันระหว่างสองกลุ่มเทคนิคนี้ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการระบุเครื่องหมายทางพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องอย่างมากกับยีนเป้าหมายในจีโนมของพืช/สัตว์
-
การหาลำดับ DNA/RNA – ลำดับนาโนพอร์
การจัดลำดับ ONT เป็นเทคโนโลยีการจัดลำดับสัญญาณไฟฟ้าแบบเรียลไทม์โมเลกุลเดี่ยวที่ใช้นาโนพอร์ หลักการเรียงลำดับของแต่ละแพลตฟอร์มจะเหมือนกันDNA/RNA แบบเกลียวคู่จะจับกับโปรตีนที่มีรูพรุนระดับนาโนที่ฝังอยู่ในแผ่นชีวะและคลี่คลายภายใต้ตะกั่วของโปรตีนมอเตอร์ ภายใต้การกระทำของแรงดันไฟฟ้าที่แตกต่างกันจากทั้งสองด้านของแผ่นชีวะ เส้น DNA/RNA จะผ่านโปรตีนช่องนาโนพอร์ในระดับหนึ่ง ประเมิน.เนื่องจากคุณสมบัติทางเคมีของเบสต่างๆ บนสาย DNA/RNA นั้นแตกต่างกัน เมื่อเบสหรือโมเลกุล DNA เดี่ยวผ่านช่องนาโนพอร์ จะทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงของสัญญาณไฟฟ้าต่างๆด้วยการตรวจจับและสอดคล้องกับสัญญาณเหล่านี้ จึงสามารถคำนวณประเภทฐานที่สอดคล้องกันได้ และการตรวจจับลำดับแบบเรียลไทม์ก็เสร็จสมบูรณ์ได้
-
การหาลำดับ DNA/RNA - PacBio Sequencer
แพลตฟอร์มการจัดลำดับ PacBio เป็นแพลตฟอร์มการจัดลำดับแบบอ่านมานาน ซึ่งเป็นที่รู้จักว่าเป็นหนึ่งในเทคโนโลยี Third-Generation Sequencing (TGS)เทคโนโลยีหลักแบบเรียลไทม์โมเลกุลเดี่ยว (SMRT) ช่วยให้การสร้างการอ่านที่มีความยาวหลายสิบกิโลเบสบนพื้นฐานของ "การจัดลำดับโดยการสังเคราะห์" ความละเอียดของนิวคลีโอไทด์เดี่ยวทำได้โดยท่อนำคลื่นแบบโหมดศูนย์ (ZMW) ซึ่งมีการส่องสว่างเพียงปริมาตรที่จำกัดที่ด้านล่าง (บริเวณของการสังเคราะห์โมเลกุล)นอกจากนี้ การจัดลำดับ SMRT ส่วนใหญ่จะหลีกเลี่ยงอคติเฉพาะลำดับในระบบ NGS โดยที่ขั้นตอนการขยาย PCR ส่วนใหญ่ไม่จำเป็นในกระบวนการสร้างห้องสมุด
แพลตฟอร์ม: ภาคต่อ II, Revio
