-
Proteomika
Proteomika behels die toepassing van tegnologieë vir die kwantifisering van algehele proteïene teenwoordige inhoud van 'n sel, weefsel of 'n organisme.Proteomika-gebaseerde tegnologieë word gebruik in verskeie hoedanighede vir verskillende navorsingsinstellings soos opsporing van verskeie diagnostiese merkers, kandidate vir entstofproduksie, begrip van patogenisiteitsmeganismes, verandering van uitdrukkingspatrone in reaksie op verskillende seine en interpretasie van funksionele proteïenbane in verskillende siektes.Op die oomblik word kwantitatiewe proteomika-tegnologieë hoofsaaklik verdeel in TMT, Label Free en DIA kwantitatiewe strategieë.
-
Metabolomika
Die metaboloom is die terminale stroomaf produk van die genoom en bestaan uit die totale komplement van al die lae-molekulêre gewig molekules (metaboliete) in 'n sel, weefsel of organisme.Metabolomics het ten doel om 'n wye breedte van klein molekules te meet in die konteks van fisiologiese stimuli of siektetoestande.Metabolomika-metodologieë val in twee afsonderlike groepe: nie-geteikende metabolomika, 'n beoogde omvattende analise van al die meetbare analiete in 'n monster, insluitend chemiese onbekendes deur gebruik te maak van GC-MS/LC-MS, en geteikende metabolomika, die meting van gedefinieerde groepe van chemies gekarakteriseerde en biochemies geannoteerde metaboliete.
-
Grootmaat Segregant-analise
Bulked segregant-analise (BSA) is 'n tegniek wat gebruik word om fenotipe-geassosieerde genetiese merkers vinnig te identifiseer.Die hoofwerkvloei van BSA bevat die selektering van twee groepe individue met uiters opponerende fenotipes, die samevoeging van die DNA van alle individue om twee massas DNA te vorm, die identifisering van differensiële volgordes tussen twee poele.Hierdie tegniek is omvattend aangewend in die identifisering van genetiese merkers wat sterk geassosieer word deur geteikende gene in plant-/diergenome.
-
DNA/RNA-volgordebepaling – Nanopore-volgordebepaling
ONT-volgordebepaling is 'n enkele molekule intydse elektriese seinvolgorde-tegnologie gebaseer op nanopore, die volgordebepalingsbeginsel van elke platform is dieselfde.Dubbelstring DNS/RNA sal bind aan nanoporeuse proteïen wat in die biofilm ingebed is en onder die leiding van motorproteïen afwikkel, onder die werking van spanningsverskil vanaf beide kante van die biofilm, gaan DNS/RNA-stringe deur die nanoporekanaalproteïen op 'n sekere koers.As gevolg van die verskille van die chemiese eienskappe van die verskillende basisse op die DNS/RNA-string, sal dit die verandering van verskillende elektriese seine veroorsaak wanneer 'n enkele basis of DNS-molekule deur die nanopore-kanaal gaan.Deur hierdie seine op te spoor en daarmee ooreenstem, kan die ooreenstemmende basistipes bereken word, en die intydse opsporing van die volgorde kan voltooi word.
-
DNA/RNA-volgordebepaling -PacBio-volgordebepaling
PacBio-volgordebepalingsplatform is 'n langleesvolgordebepalingsplatform, wat ook bekend staan as een van die Third-Generation Sequencing (TGS) tegnologieë.Die kerntegnologie, enkel-molekule-intydse (SMRT), bemagtig die generering van leeswerk met tientalle kilobasis lank.Op basis van "Opeenvolging-deur-sintese", word enkelnukleotiedresolusie bereik deur Zero-modus golfleier (ZMW), waar slegs beperkte volume aan die onderkant (plek van molekulesintese), verlig word.Daarbenewens vermy SMRT-volgordebepaling grootliks volgorde-spesifieke vooroordeel in NGS-stelsel, deurdat die meeste PCR-amplifikasiestappe nie in die biblioteekkonstruksieproses vereis word nie.
Platform: Vervolg II, Revio
