-
Proteomica
Proteomica implică aplicațiile tehnologiilor pentru cuantificarea conținutului total de proteine prezente într-o celulă, țesut sau organism.Tehnologiile bazate pe proteomică sunt utilizate în diferite capacități pentru diferite medii de cercetare, cum ar fi detectarea diferiților markeri de diagnostic, candidați pentru producerea de vaccin, înțelegerea mecanismelor de patogenitate, alterarea tiparelor de expresie ca răspuns la diferite semnale și interpretarea căilor funcționale ale proteinelor în diferite boli.În prezent, tehnologiile de proteomică cantitativă sunt în principal împărțite în strategii cantitative TMT, Label Free și DIA.
-
Metabolomica
Metabolomul este produsul terminal din aval al genomului și constă din complementul total al tuturor moleculelor cu greutate moleculară mică (metaboliți) dintr-o celulă, țesut sau organism.Metabolomica își propune să măsoare o gamă largă de molecule mici în contextul stimulilor fiziologici sau al stărilor de boală.Metodologiile metabolomice se împart în două grupuri distincte: metabolomica nețintită, o analiză cuprinzătoare intenționată a tuturor analiților măsurabili dintr-o probă, inclusiv necunoscute chimice folosind GC-MS/LC-MS și metabolomica țintită, măsurarea grupurilor definite de substanțe caracterizate chimic și metaboliți adnotați biochimic.
-
Analiza segregant în bloc
Analiza segregantă în masă (BSA) este o tehnică folosită pentru a identifica rapid markerii genetici asociați cu fenotip.Fluxul de lucru principal al BSA conține selectarea a două grupuri de indivizi cu fenotipuri extrem de opuse, gruparea ADN-ului tuturor indivizilor pentru a forma două cantități mari de ADN, identificând secvențe diferențiale între două grupuri.Această tehnică a fost utilizată pe scară largă în identificarea markerilor genetici puternic asociați de genele vizate în genomul plantelor/animalelor.
-
Secvențierea ADN/ARN – Sequencer Nanopore
Secvențierea ONT este o tehnologie de secvențiere a semnalului electric în timp real cu o singură moleculă bazată pe nanopori, principiul de secvențiere al fiecărei platforme este același.ADN/ARN dublu catenar se va lega de proteina nanoporoasă încorporată în biofilm și se va desfășura sub conducerea proteinei motorii, sub acțiunea diferenței de tensiune de pe ambele părți ale biofilmului, catenele de ADN/ARN trec prin proteina canalului nanopor la un anumit rată.Datorită diferențelor de proprietăți chimice ale diferitelor baze de pe catena ADN/ARN, atunci când o singură bază sau moleculă de ADN trece prin canalul nanoporului, va provoca schimbarea diferitelor semnale electrice.Prin detectarea și corespondența acestor semnale, pot fi calculate tipurile de bază corespunzătoare și poate fi finalizată detectarea în timp real a secvenței.
-
Secvențierea ADN/ARN -PacBio Sequencer
Platforma de secvențiere PacBio este o platformă de secvențiere cu citire lungă, care este cunoscută și ca una dintre tehnologiile de secvențiere a treia generație (TGS).Tehnologia de bază, o singură moleculă în timp real (SMRT), permite generarea de citiri cu o lungime de zeci de kilo-bază.Pe baza „Sequencing-by-Synthesis”, rezoluția unei singure nucleotide este obținută prin ghidul de undă Zero-mode (ZMW), unde este iluminat doar un volum limitat în partea de jos (locul sintezei moleculei).În plus, secvențierea SMRT evită în mare măsură părtinirea specifică secvenței în sistemul NGS, deoarece majoritatea etapelor de amplificare PCR nu sunt necesare în procesul de construire a bibliotecii.
Platformă: Sequel II, Revio
