എൽഎൻസിആർഎൻഎ
ലോംഗ് നോൺ-കോഡിംഗ് ആർഎൻഎകൾ (lncRNA) 200 ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകളിൽ കൂടുതൽ നീളമുള്ള ആർഎൻഎകളാണ്, കുറഞ്ഞ കോഡിംഗ് സാധ്യതയുള്ളതും എന്നാൽ നിർണായക നിയന്ത്രണ പ്രവർത്തനങ്ങളുള്ളതുമാണ്. എൽഎൻസിആർഎൻഎയും എംആർഎൻഎ എക്സ്പ്രഷനും ഒരുമിച്ച് വിശകലനം ചെയ്തുകൊണ്ട് ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ളതും നന്നായി വ്യാഖ്യാനിച്ചതുമായ റഫറൻസ് ജീനോം ഉള്ള ആർആർഎൻഎ ഡിലീറ്റ് ചെയ്ത ലൈബ്രറികൾ വിശകലനം ചെയ്യുന്നതിനാണ് ബിഎംകെക്ലൗഡ് എൽഎൻസിആർഎൻഎ പൈപ്പ്ലൈൻ രൂപകൽപ്പന ചെയ്തിരിക്കുന്നത്. റീഡ് ട്രിമ്മിംഗിനും ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണത്തിനും ശേഷം, ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകൾ കൂട്ടിച്ചേർക്കുന്നതിനായി റഫറൻസ് ജീനോമുമായി റീഡുകൾ വിന്യസിക്കുന്നു, തുടർന്നുള്ള ജീൻ ഘടന വിശകലനം ഇതര സ്പ്ലിക്കിംഗും നോവൽ ജീനുകളും വെളിപ്പെടുത്തുന്നു. ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളെ എംആർഎൻഎകളോ എൽഎൻസിആർഎൻഎകളോ ആയി തിരിച്ചറിയുന്നു, കൂടാതെ ഡിഫറൻഷ്യൽ എക്സ്പ്രഷൻ വിശകലനം വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിച്ച എൽഎൻസിആർഎൻഎകളെയും അവയുടെ ലക്ഷ്യങ്ങളെയും വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിച്ച ജീനുകളെയും (ഡിഇജിഎസ്) തിരിച്ചറിയുന്നു. ഡിഇജികളും വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിച്ച എൽഎൻസിആർഎൻഎ ടാർഗെറ്റുകളും സമ്പുഷ്ടമായ പ്രവർത്തന വിഭാഗങ്ങൾ കണ്ടെത്തുന്നതിന് പ്രവർത്തനപരമായി വ്യാഖ്യാനിച്ചിരിക്കുന്നു.
ബയോഇൻഫോർമാറ്റിക്സ്
