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Proteomica
La proteomica prevede l'applicazione di tecnologie per la quantificazione del contenuto complessivo di proteine presenti in una cellula, tessuto o organismo.Le tecnologie basate sulla proteomica sono utilizzate a vario titolo per diversi contesti di ricerca come il rilevamento di vari marcatori diagnostici, candidati per la produzione di vaccini, la comprensione dei meccanismi di patogenicità, l'alterazione dei modelli di espressione in risposta a diversi segnali e l'interpretazione dei percorsi proteici funzionali in diverse malattie.Allo stato attuale, le tecnologie di proteomica quantitativa sono principalmente suddivise in strategie quantitative TMT, Label Free e DIA.
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Metabolomica
Il metaboloma è il prodotto finale a valle del genoma e consiste nel complemento totale di tutte le molecole a basso peso molecolare (metaboliti) in una cellula, tessuto o organismo.La metabolomica mira a misurare un'ampia gamma di piccole molecole nel contesto di stimoli fisiologici o stati patologici.Le metodologie di metabolomica rientrano in due gruppi distinti: metabolomica non mirata, un'analisi completa prevista di tutti gli analiti misurabili in un campione, comprese le sostanze chimiche incognite utilizzando GC-MS/LC-MS, e metabolomica mirata, la misurazione di gruppi definiti di composti chimicamente caratterizzati e Metaboliti annotati biochimicamente.
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Analisi dei segreganti in bulk
L'analisi dei segreganti in massa (BSA) è una tecnica utilizzata per identificare rapidamente i marcatori genetici associati al fenotipo.Il flusso di lavoro principale della BSA prevede la selezione di due gruppi di individui con fenotipi estremamente opposti, il raggruppamento del DNA di tutti gli individui per formare due masse di DNA, l'identificazione di sequenze differenziali tra due pool.Questa tecnica è stata ampiamente impiegata per identificare marcatori genetici fortemente associati a geni mirati nei genomi di piante/animali.
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Sequenziamento DNA/RNA – Sequenziatore di nanopori
Il sequenziamento ONT è una tecnologia di sequenziamento del segnale elettrico in tempo reale di una singola molecola basata su nanopori, il principio di sequenziamento di ciascuna piattaforma è lo stesso.Il DNA/RNA a doppio filamento si legherà alla proteina nanoporosa incorporata nel biofilm e si srotola sotto la guida della proteina motrice, sotto l'azione della differenza di voltaggio da entrambi i lati del biofilm, i filamenti di DNA/RNA passano attraverso la proteina del canale del nanoporo ad una certa distanza valutare.A causa delle differenze delle proprietà chimiche delle diverse basi sul filamento di DNA/RNA, quando una singola base o molecola di DNA passa attraverso il canale dei nanopori, causerà il cambiamento di diversi segnali elettrici.Rilevando e facendo corrispondere questi segnali, è possibile calcolare i tipi di base corrispondenti e completare il rilevamento in tempo reale della sequenza.
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Sequenziatore DNA/RNA -PacBio Sequencer
La piattaforma di sequenziamento PacBio è una piattaforma di sequenziamento a lettura lunga, nota anche come una delle tecnologie di sequenziamento di terza generazione (TGS).La tecnologia di base, la tecnologia in tempo reale a singola molecola (SMRT), consente la generazione di letture con una lunghezza di decine di chilo-base.Sulla base del "Sequenziamento per sintesi", la risoluzione del singolo nucleotide è ottenuta mediante la guida d'onda in modalità zero (ZMW), dove viene illuminato solo il volume limitato nella parte inferiore (sito di sintesi delle molecole).Inoltre, il sequenziamento SMRT evita in gran parte errori specifici della sequenza nel sistema NGS, in quanto la maggior parte delle fasi di amplificazione della PCR non sono richieste nel processo di costruzione della libreria.
Piattaforma: Sequel II, Revio
