-
Proteomics
Ang Proteomics ay nagsasangkot ng mga aplikasyon ng mga teknolohiya para sa pagsukat ng kabuuang mga protina na kasalukuyang nilalaman ng isang cell, tissue o isang organismo.Ang mga teknolohiyang nakabatay sa proteomic ay ginagamit sa iba't ibang kapasidad para sa iba't ibang setting ng pananaliksik tulad ng pagtuklas ng iba't ibang diagnostic marker, mga kandidato para sa produksyon ng bakuna, pag-unawa sa mga mekanismo ng pathogenicity, pagbabago ng mga pattern ng pagpapahayag bilang tugon sa iba't ibang signal at interpretasyon ng functional na mga pathway ng protina sa iba't ibang sakit.Sa kasalukuyan, ang mga quantitative proteomics na teknolohiya ay pangunahing nahahati sa TMT, Label Free at DIA quantitative na mga diskarte.
-
Metabolomics
Ang metabolome ay ang terminal downstream product ng genome at binubuo ng kabuuang complement ng lahat ng low-molecular-weight molecules (metabolites) sa isang cell, tissue, o organism.Layunin ng Metabolomics na sukatin ang malawak na lawak ng maliliit na molekula sa konteksto ng physiological stimuli o mga estado ng sakit.Ang mga metabolomics methodologies ay nahahati sa dalawang magkakaibang grupo: non-targeted metabolomics, isang nilalayong komprehensibong pagsusuri ng lahat ng masusukat na analyte sa isang sample kabilang ang mga kemikal na hindi alam gamit ang GC-MS/LC-MS, at naka-target na metabolomics, ang pagsukat ng mga tinukoy na grupo ng chemically characterized at biochemically annotated metabolites.
-
Bulked Segregant analysis
Ang bulked segregant analysis (BSA) ay isang pamamaraan na ginagamit upang mabilis na matukoy ang mga genetic marker na nauugnay sa phenotype.Ang pangunahing daloy ng trabaho ng BSA ay naglalaman ng pagpili ng dalawang grupo ng mga indibidwal na may labis na magkasalungat na mga phenotype, na pinagsasama-sama ang DNA ng lahat ng mga indibidwal upang bumuo ng dalawang bulto ng DNA, na tumutukoy sa pagkakaiba-iba ng mga pagkakasunud-sunod sa pagitan ng dalawang pool.Ang pamamaraan na ito ay malawakang ginamit sa pagtukoy ng mga genetic marker na malakas na nauugnay ng mga naka-target na gene sa mga genome ng halaman/hayop.
-
DNA/RNA Sequencing – Nanopore Sequencer
Ang ONT sequencing ay isang solong molekula na real-time na electrical signal sequencing technology batay sa nanopores, ang sequencing principle ng bawat platform ay pareho.Ang double-stranded na DNA/RNA ay magbibigkis sa nanoporous na protina na naka-embed sa biofilm at mag-unwinding sa ilalim ng lead ng motor protein, sa ilalim ng pagkilos ng pagkakaiba ng boltahe mula sa magkabilang panig ng biofilm, ang mga DNA/RNA strands ay dumadaan sa nanopore channel protein sa isang tiyak rate.Dahil sa pagkakaiba-iba ng mga kemikal na katangian ng iba't ibang base sa DNA/RNA strand, kapag ang isang base o molekula ng DNA ay dumaan sa nanopore channel, ito ay magiging sanhi ng pagbabago ng iba't ibang electrical signal.Sa pamamagitan ng pag-detect at pag-uugnay sa mga signal na ito, maaaring kalkulahin ang mga kaukulang uri ng base, at ang real-time na pagtuklas ng sequence ay maaaring makumpleto.
-
DNA/RNA sequencing -PacBio Sequencer
Ang PacBio sequencing platform ay isang long-read sequencing platform, na kilala rin bilang isa sa mga teknolohiya ng Third-Generation Sequencing(TGS).Ang pangunahing teknolohiya, ang single-molecule real-time (SMRT), ay nagbibigay ng kapangyarihan sa pagbuo ng mga reads na may sampu-sampung kilo-base ang haba.Sa base ng "Sequencing-by-Synthesis", ang solong nucleotide resolution ay nakakamit ng Zero-mode waveguide(ZMW), kung saan limitado lamang ang volume sa ibaba(site ng molecule synthesis), ang iluminado.Bilang karagdagan, higit na iniiwasan ng SMRT sequencing ang bias na partikular sa pagkakasunud-sunod sa sistema ng NGS, dahil ang karamihan sa mga hakbang sa pagpapalakas ng PCR ay hindi kinakailangan sa proseso ng pagtatayo ng library.
Plataporma: Sequel II, Revio
