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Proteômica
A proteômica envolve as aplicações de tecnologias para a quantificação do conteúdo global de proteínas presentes em uma célula, tecido ou organismo.As tecnologias baseadas na proteómica são utilizadas em diversas capacidades para diferentes ambientes de investigação, tais como detecção de vários marcadores de diagnóstico, candidatos para produção de vacinas, compreensão de mecanismos de patogenicidade, alteração de padrões de expressão em resposta a diferentes sinais e interpretação de vias funcionais de proteínas em diferentes doenças.Atualmente, as tecnologias proteômicas quantitativas são divididas principalmente em estratégias quantitativas TMT, Label Free e DIA.
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Metabolômica
O metaboloma é o produto terminal a jusante do genoma e consiste no complemento total de todas as moléculas de baixo peso molecular (metabólitos) em uma célula, tecido ou organismo.A metabolômica visa medir uma ampla gama de pequenas moléculas no contexto de estímulos fisiológicos ou estados de doença.As metodologias metabolômicas se enquadram em dois grupos distintos: metabolômica não direcionada, uma análise abrangente pretendida de todos os analitos mensuráveis em uma amostra, incluindo incógnitas químicas usando GC-MS/LC-MS, e metabolômica direcionada, a medição de grupos definidos de substâncias quimicamente caracterizadas e metabólitos anotados bioquimicamente.
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Análise de segregante em massa
A análise segregante em massa (BSA) é uma técnica empregada para identificar rapidamente marcadores genéticos associados ao fenótipo.O fluxo de trabalho principal da BSA consiste na seleção de dois grupos de indivíduos com fenótipos extremamente opostos, reunindo o DNA de todos os indivíduos para formar dois volumes de DNA, identificando sequências diferenciais entre dois pools.Esta técnica tem sido amplamente empregada na identificação de marcadores genéticos fortemente associados por genes alvo em genomas de plantas/animais.
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Sequenciamento de DNA/RNA – Sequenciador Nanopore
O sequenciamento ONT é uma tecnologia de sequenciamento de sinal elétrico em tempo real de molécula única baseada em nanoporos, o princípio de sequenciamento de cada plataforma é o mesmo.DNA/RNA de fita dupla se ligará à proteína nanoporosa incorporada no biofilme e se desenrolará sob a liderança da proteína motora, sob a ação da diferença de voltagem de ambos os lados do biofilme, os fios de DNA/RNA passam através da proteína do canal nanoporo em um certo avaliar.Devido às diferenças nas propriedades químicas das diferentes bases na cadeia de DNA/RNA, quando uma única base ou molécula de DNA passa pelo canal nanoporo, causará a mudança de diferentes sinais elétricos.Ao detectar e corresponder a estes sinais, os tipos de base correspondentes podem ser calculados e a detecção da sequência em tempo real pode ser concluída.
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Sequenciamento de DNA/RNA - Sequenciador PacBio
A plataforma de sequenciamento PacBio é uma plataforma de sequenciamento de leitura longa, também conhecida como uma das tecnologias de sequenciamento de terceira geração (TGS).A tecnologia principal, molécula única em tempo real (SMRT), permite a geração de leituras com dezenas de quilobases de comprimento.Com base no “Sequenciamento por Síntese”, a resolução de nucleotídeo único é alcançada pelo guia de ondas de modo zero (ZMW), onde apenas o volume limitado na parte inferior (local de síntese da molécula) é iluminado.Além disso, o sequenciamento SMRT evita em grande parte o viés específico da sequência no sistema NGS, na medida em que a maioria das etapas de amplificação por PCR não são necessárias no processo de construção da biblioteca.
Plataforma: Sequela II, Revio
