-
Proteomika
Proteomika obejmuje zastosowanie technologii do ilościowego oznaczania całkowitej zawartości białek w komórce, tkance lub organizmie.Technologie oparte na proteomice są wykorzystywane do różnych celów w różnych kontekstach badawczych, takich jak wykrywanie różnych markerów diagnostycznych, kandydatów do produkcji szczepionek, zrozumienie mechanizmów patogeniczności, zmiana wzorców ekspresji w odpowiedzi na różne sygnały i interpretacja funkcjonalnych szlaków białek w różnych chorobach.Obecnie ilościowe technologie proteomiki dzielą się głównie na strategie ilościowe TMT, Label Free i DIA.
-
Metabolomika
Metabolom jest końcowym produktem genomu i składa się z całkowitego uzupełnienia wszystkich cząsteczek o niskiej masie cząsteczkowej (metabolitów) w komórce, tkance lub organizmie.Metabolomika ma na celu pomiar szerokiego zakresu małych cząsteczek w kontekście bodźców fizjologicznych lub stanów chorobowych.Metodologie metabolomiki można podzielić na dwie odrębne grupy: metabolomika nieukierunkowana, zamierzona wszechstronna analiza wszystkich mierzalnych analitów w próbce, w tym nieznanych substancji chemicznych, przy użyciu GC-MS/LC-MS, oraz metabolomika celowana, czyli pomiar określonych grup chemicznie scharakteryzowanych i metabolity z adnotacjami biochemicznymi.
-
Zbiorcza analiza Segreganta
Zbiorcza analiza segregantowa (BSA) to technika stosowana do szybkiej identyfikacji markerów genetycznych związanych z fenotypem.Główny przebieg badania BSA obejmuje wybór dwóch grup osobników o skrajnie przeciwstawnych fenotypach, połączenie DNA wszystkich osobników w celu utworzenia dwóch grup DNA oraz identyfikację różnicowych sekwencji pomiędzy dwiema pulami.Technikę tę szeroko stosowano do identyfikacji markerów genetycznych silnie powiązanych z docelowymi genami w genomach roślin/zwierząt.
-
Sekwencjonowanie DNA/RNA – Sekwenser Nanoporów
Sekwencjonowanie ONT to technologia sekwencjonowania sygnału elektrycznego w czasie rzeczywistym pojedynczej cząsteczki, oparta na nanoporach. Zasada sekwencjonowania każdej platformy jest taka sama.Dwuniciowy DNA/RNA zwiąże się z nanoporowatym białkiem osadzonym w biofilmie i rozwinie się pod przewodnictwem białka motorycznego, pod wpływem różnicy napięcia po obu stronach biofilmu nici DNA/RNA przejdą przez białkowy kanał nanoporowy w określonej temperaturze wskaźnik.Ze względu na różnice we właściwościach chemicznych różnych zasad nici DNA/RNA, przejście pojedynczej zasady lub cząsteczki DNA przez kanał nanoporów powoduje zmianę różnych sygnałów elektrycznych.Wykrywając i odpowiadając tym sygnałom, można obliczyć odpowiednie typy zasad i zakończyć wykrywanie sekwencji w czasie rzeczywistym.
-
Sekwencjonowanie DNA/RNA -PacBio Sequencer
Platforma sekwencjonowania PacBio to platforma sekwencjonowania o długim odczycie, znana również jako jedna z technologii sekwencjonowania trzeciej generacji (TGS).Podstawowa technologia, jednocząsteczkowy czas rzeczywisty (SMRT), umożliwia generowanie odczytów o długości kilkudziesięciu kilogramów.W oparciu o „sekwencjonowanie przez syntezę” rozdzielczość pojedynczych nukleotydów osiąga się za pomocą falowodu w trybie zerowym (ZMW), w którym oświetlana jest tylko ograniczona objętość na dole (miejsce syntezy cząsteczki).Ponadto sekwencjonowanie SMRT w dużym stopniu pozwala uniknąć błędu specyficznego dla sekwencji w systemie NGS, ponieważ większość etapów amplifikacji PCR nie jest wymagana w procesie konstruowania biblioteki.
Platforma: Sequel II, Revio
